Conotoxin

Alfakonotoxinprekursor
Alpha-Conotoxin from Conus pennaceus 1AKG.png
a-konotoxin PnIB från C. pennaceus , disulfidbindningar visas i gult. Från University of Michigan's Orientations of Proteins in Membranes databas , .
Identifierare
Symbol Toxin_8
Pfam PF07365
InterPro IPR009958
PROSITE PDOC60004
SCOP2 1mii / SCOPe / SUPFAM
OPM superfamilj 148
OPM-protein 1akg
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
Omega conotoxin
Ziconotide 1DW5.png
Schematiskt diagram över den tredimensionella strukturen av ω-conotoxin MVIIA ( ziconotid ). Disulfidbindningar visas i guld. Från .
Identifierare
Symbol Conotoxin
Pfam PF02950
InterPro IPR004214
SCOP2 2cco / SCOPe / SUPFAM
OPM superfamilj 112
OPM-protein 1fyg
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Ett conotoxin är ett av en grupp neurotoxiska peptider som isolerats från giftet från den marina konsnigeln, släktet Conus .

Konotoxiner, som är peptider som består av 10 till 30 aminosyrarester , har vanligtvis en eller flera disulfidbindningar . Konotoxiner har en mängd olika verkningsmekanismer, varav de flesta inte har fastställts. Det verkar dock som att många av dessa peptider modulerar aktiviteten hos jonkanaler . Under de senaste decennierna har konotoxiner varit föremål för farmakologiskt intresse.

LD 50 för conotoxin varierar från 5-25 μg/kg.

Hypervariabilitet

Konotoxiner är hypervariabla även inom samma art. De verkar inte i en kropp där de produceras ( endogent ) utan verkar på andra organismer. Därför upplever conotoxin-gener mindre selektion mot mutationer (som genduplicering och icke-synonym substitution ), och mutationer förblir i genomet längre, vilket ger mer tid för potentiellt fördelaktiga nya funktioner att uppstå. Variabilitet i konotoxinkomponenter minskar sannolikheten för att bytesorganismer utvecklar resistens; således konsniglar är under konstant selektivt tryck för att upprätthålla polymorfism i dessa gener eftersom misslyckande med att utvecklas och anpassa sig kommer att leda till utrotning ( Red Queen hypothesis) .

Disulfidanslutningar

Typer av konotoxiner skiljer sig också i antal och mönster av disulfidbindningar. Disulfidbindningsnätverket, såväl som specifika aminosyror i inter-cysteinslingor, tillhandahåller specificiteten för konotoxiner.

Typer och biologiska aktiviteter

Antalet konotoxiner vars aktiviteter hittills har bestämts är fem, och de kallas α(alfa)-, δ(delta)-, κ(kappa)-, μ(mu)- och ω(omega)-typerna . Var och en av de fem typerna av konotoxiner angriper olika mål:

Alfa

Alfakonotoxiner har två typer av cysteinarrangemang och är kompetitiva nikotinacetylkolinreceptorantagonister.

Delta, kappa och omega

Omega-, delta- och kappafamiljer av konotoxiner har en knottin- eller inhibitorcystinknutställning . Knottinställningen är en mycket speciell disulfid-till-disulfidknut, där III-VI-disulfidbindningen korsar makrocykeln som bildas av två andra disulfidbindningar (I-IV och II-V) och de sammankopplade ryggradssegmenten, där I-VI indikerar de sex cysteinresterna utgående från N-terminalen. Cysteinarrangemangen är desamma för omega-, delta- och kappafamiljer, även om omega-konotoxiner är kalciumkanalblockerare, medan deltakonotoxiner fördröjer inaktiveringen av natriumkanaler och kappakonotoxiner är kaliumkanalblockerare.

Mu

Mu-conotoxin
PDB 1r9i EBI.jpg
nmr lösning struktur av piiia toxin, nmr, 20 strukturer
Identifierare
Symbol Mu-konotoxin
Pfam PF05374
Pfam klan CL0083
InterPro IPR008036
SCOP2 1gib / SCOPe / SUPFAM
OPM superfamilj 112
OPM-protein 1ag7
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Mu-konotoxiner har två typer av cysteinarrangemang, men knottinställningen observeras inte. Mu-konotoxiner riktar sig mot de muskelspecifika spänningsstyrda natriumkanalerna och är användbara prober för att undersöka spänningsberoende natriumkanaler i exciterbara vävnader. Mu-konotoxiner riktar sig mot de spänningsstyrda natriumkanalerna , företrädesvis de i skelettmuskulaturen , och är användbara prober för att undersöka spänningsberoende natriumkanaler i exciterbara vävnader .

Olika undertyper av spänningsstyrda natriumkanaler finns i olika vävnader hos däggdjur, t.ex. i muskler och hjärna, och studier har genomförts för att bestämma känsligheten och specificiteten hos mu-konotoxinerna för de olika isoformerna.

Se även

Den här artikeln innehåller text från den offentliga egendomen Pfam och InterPro :

externa länkar