Baciller

Bacillus subtilis Gram.jpg
Bacilli
Bacillus subtilis , Gramfärgning
Vetenskaplig klassificering
Domän: Bakterie
Provins: Bacillota
Klass:
Bacilli Ludwig et al. 2010
Order
Synonymer
  • "Bacillia" Oren, Parte & Garrity 2016
  • Desulfuribacillia Sorokin et al. 2021
  • Firmibacteria Murray 1988
  • Teichobacteria Cavalier-Smith 2002

Baciller är en taxonomisk klass av bakterier som inkluderar två ordnar, Bacillales och Lactobacillales , som innehåller flera välkända patogener som Bacillus anthracis (orsaken till mjältbrand ). Baciller är nästan uteslutande grampositiva bakterier .

Namnet Bacillus , med versaler och kursiv stil , hänvisar till ett specifikt släkte av bakterier. Namnet Baciller, med versaler men inte kursivt, kan också hänvisa till en mindre specifik taxonomisk grupp av bakterier som inkluderar två ordnar, varav en innehåller släktet Bacillus . När ordet är formaterat med gemener och inte kursiverat, 'bacillus', kommer det med största sannolikhet att syfta på form och inte alls till släktet.

Tvetydighet

Flera relaterade begrepp använder sig av liknande ord, och oklarheten kan skapa stor förvirring. Termen " Bacillus " (stor och kursiv) är också namnet på ett släkte ( Bacillus anthracis ) som, bland många andra släkten, faller inom klassen Baciller.

Ordet " bacillus " (eller dess plural "baciller", med ett litet b) är också en generisk term för att beskriva morfologin hos alla stavformade bakterier. Denna allmänna term betyder inte att försökspersonen tillhör klassen Bacilli eller släktet Bacillus . Det innebär alltså inte nödvändigtvis en liknande grupp av egenskaper. Inte alla medlemmar av klassen Baciller är stavformade ( Stafylokocker är sfäriska), och många andra stavformade bakterier som inte faller inom den klassen existerar (t.ex. Clostridium är stavformad men väldigt olika taxonomiskt). Dessutom indikerar den allmänna termen "bacillus" inte nödvändigtvis den grampositiva färgningen som är vanlig för klass Baciller. Till exempel E. coli en stavformad bakterie som kan beskrivas som "en bacill", men den färgar gramnegativ och tillhör inte släktet Bacillus eller klassen Baciller. Vissa mikrobiologer har övergett den allmänna termen "bacill" på grund av den förvirring som den kan skapa.

Fylogeni

Den för närvarande accepterade taxonomin baserad på listan över prokaryota namn med stående i nomenklaturen (LPSN) och National Center for Biotechnology Information (NCBI).

120 markörproteiner baserade GTDB 07-RS207

"Kyrpidiaceae" {"Kyrpidiales"}

"Tumebacilles"

"Effusibacillaceae"

"Tumebacilceae"

"Alicylobacillales"

"Acidibacillaceae"

Alicyclobacillaceae

Desulfuribacillaceae {Desulfuribacillales}

Bacillaceae_M {Bacillales_F}

Pasteuriaceae {RES148}

"Calditerricolaceae" {"Calditerricolales"}

"Thermicanaceae" {"Thermicanales"}

DSM-22653 {DSM-22653}

"Thermoactinomycetales"

"Novibacillaceae"

Thermoactinomycetaceae

DSM-45169

JIR-001

DSM-44946

"Tepidibacillales"

"Tepidibacillaceae"

"Paenibacillales"

Reconcilibacilaceae

SCSIO-06110

Paenibacilaceae

YIM-B00363

NBRC-103111

"Brevibacillales"

"Brevibacillaceae"

"Aneurinibacillales"

RAOX-1

"Aneurinibacilaceae"

"Caldalkalibacillales"

JCM-10596

"Caldalkalibacillaceae"

"Rubeoparvulaceae" {"Rubeoparvulales"}

"Exiguobacteraceae" {"Exiguobacterales"}

CAJFEE01 {CAJFEE01}

"Bacillidae"

Planococcaceae {Caryophanales}

"Caldibacilaceae" {DSM-16016}

JC228 {JC228}

Bacillales B

DSM-1321

DSM-18226

Bacillaceae_C

"Domibacillaceae"

DSM-25281

Bacillaceae_B

Bacillaceae_K

"Jeotgalibacillaceae"

Bacillales

Bacillaceae_I

SA4

Bacillaceae_G

Bacillaceae_H

Bacillaceae

Bacillaceae_L

"Aeribacillaceae"

"Anoxybacillaceae"

Bacillaceae_J {Bacillales C}

Bacillales D

Bacillaceae_N

Bacillaceae_O

DSM-28697

"Amphibacilceae"

"Alkalibacillaceae"

"Halobacillaceae"

Bacillales E

SA5d-4

"Massilibacteriaceae"

Bacillales G

UBA6769

HB172195

"Fictibacillaceae"

Sporolactobacillaceae

Bacillales H

"Salisediminibacteriaceae"

"Marinococcaceae"

Bacillaceae_D

Bacillaceae_F

KJ1-10-99

"Anaerobacillaceae"

"Stafylokocker"

"Gemellaceae"

Staphylococcaceae

DSM-29158

"Salinicoccaceae"

" Erysipelotrichidae "

Lactobacillales

Se även

  1. ^   Ludwig, Wolfgang; Schleifer, Karl-Heinz; Whitman, William B. (2015). "Bacilliklass. Nov". Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria . sid. 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00033 . ISBN 9781118960608 .
  2. ^ JP Euzéby. "Baciller" . Lista över prokaryota namn med Standing in Nomenclature ( LPSN) . Hämtad 2018-07-20 .
  3. ^ Sayers; et al. "Baciller" . National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomidatabas . Hämtad 2018-07-20 .
  4. ^ "GTDB release 07-RS207" . Genomtaxonomidatabas . Hämtad 20 juni 2022 .
  5. ^ "bac120_r207.sp_labels" . Genomtaxonomidatabas . Hämtad 20 juni 2022 .
  6. ^ "Taxonhistoria" . Genomtaxonomidatabas . Hämtad 20 juni 2022 .