Actinomycetota
|
|
| Actinomycetota | |
|---|---|
| Skannaelektronmikrofotografi av Actinomyces israelii . | |
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Bakterie |
| Clade : | Terrabakterier |
| Provins: |
Actinomycetota Goodfellow 2021 |
| Typ släkte | |
|
Actinomyces Harz 1877 (godkända listor 1980)
|
|
| Klasser | |
|
|
| Synonymer | |
|
|
Actinomycetota (eller Actinobacteria ) är en filum av alla gram - positiva bakterier . De kan vara terrestra eller vattenlevande . De är av stor ekonomisk betydelse för människor eftersom jordbruk och skogar är beroende av deras bidrag till marksystemen . I jord hjälper de till att bryta ner det organiska materialet från döda organismer så att molekylerna kan tas upp på nytt av växter . Även om denna roll också spelas av svampar , är Actinomycetota mycket mindre och upptar sannolikt inte samma ekologiska nisch . I denna roll växer kolonierna ofta omfattande mycelier , som en svamp skulle göra, och namnet på en viktig ordning i fylum, Actinomycetales (actinomycetes), återspeglar att de länge troddes vara svampar. Vissa jordaktinomycetota (som Frankia ) lever symbiotiskt med växterna vars rötter genomsyrar jorden och fixerar kväve för växterna i utbyte mot tillgång till några av växtens sackarider . Andra arter, såsom många medlemmar av släktet Mycobacterium , är viktiga patogener .
Utöver det stora intresset för Actinomycetota för deras markroll, återstår mycket att lära om dem. Även om de för närvarande främst förstås som jordbakterier, kan de finnas mer rikligt i sötvatten. Actinomycetota är en av de dominerande bakteriestammarna och innehåller en av de största bakteriesläktena, Streptomyces . Streptomyces och andra actinomycetota är viktiga bidragsgivare till biologisk buffring av jordar. De är också källan till många antibiotika . [ citat behövs ]
Actinomycetota - släktet Bifidobacterium är den vanligaste bakterien i mikrobiomet hos spädbarn. Även om vuxna har färre bifidobakterier, hjälper intestinala bifidobakterier till att upprätthålla slemhinnebarriären och minskar lipopolysackarid i tarmen.
Även om några av de största och mest komplexa bakteriecellerna tillhör Actinomycetota, har gruppen av marina Actinomarinales beskrivits ha de minsta fritt levande prokaryota cellerna.
Någon sibirisk eller antarktisk Actinomycetota sägs vara den äldsta levande organismen på jorden, frusen i permafrost för omkring en halv miljon år sedan. Symtomen på liv upptäcktes av CO 2 -utsläpp från permafrostprover 640 kya eller yngre.
Allmän
De flesta Actinomycetota av medicinsk eller ekonomisk betydelse tillhör klassen Actinomycetia och tillhör ordningen Actinomycetales . Medan många av dessa orsakar sjukdom hos människor, Streptomyces anmärkningsvärd som en källa till antibiotika . [ citat behövs ]
Av de Actinomycetota som inte finns i Actinomycetales är Gardnerella en av de mest efterforskade. Klassificering av Gardnerella är kontroversiell, och MeSH katalogiserar den som både en grampositiv och gramnegativ organism.
Actinomycetota , speciellt Streptomyces spp., är erkända som producenter av många bioaktiva metaboliter som är användbara för människor inom medicin, såsom antibakteriella medel, antimykotika, antivirala medel, antitrombotika, immunmodifierare, antitumörläkemedel och enzyminhibitorer; och inom jordbruket, inklusive insekticider, herbicider, fungicider och tillväxtfrämjande ämnen för växter och djur. Aktinomycetota -härledda antibiotika som är viktiga i medicin inkluderar aminoglykosider, antracykliner, kloramfenikol, makrolid, tetracykliner, etc. [ Citat behövs ] Actinomycetota har högt innehåll av guanin och cytosin i sitt DNA . G+C-halten i Actinomycetota kan vara så hög som 70 %, även om vissa kan ha en låg G+C-halt.
Analys av glutaminsyntetassekvens har föreslagits för fylogenetisk analys av Actinomycetota .
Fylogeni
| Helgenombaserad fylogeni | 16S rRNA-baserad LTP _12_2021 | GTDB 07-RS207 av Genome Taxonomy Database | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
|
Taxonomi
Den för närvarande accepterade taxonomin är baserad på listan över prokaryota namn med stående i nomenklaturen (LPSN) och National Center for Biotechnology Information (NCBI).
- Klass "Syntrophaliphaticia" corrig. Liu et al. 2020
- Klass "Aquicultoria" Jiao et al. 2021
- Klass "Geothermincolia" Jiao et al. 2021
- Klass "Humimicrobiia" Jiao et al. 2021
- Klass Acidimicrobiia Norris 2013
- Klass Actinomycetia (Stackebrandt et al. 1997) Salam et al. 2020 ( Nitriliruptoria Ludwig et al. 2013 )
- Underklass Actinobacteridae Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997
- Underklass Nitriliruptoridae Kurahashi et al. 2010
- Klass Coriobacteriia König 2013
- Klass Rubrobacteria Suzuki 2013
- Klass Thermoleophilia Suzuki och Whitman 2013
Se även
Vidare läsning
- Baltz, RH (2005). "Antibiotikaupptäckt från Actinomycetes : Kommer en renässans att följa nedgången och fallet?". SIM Nyheter . 55 : 186–196.
- Baltz, RH (2007). "Antimikrobiella medel från Actinomycetes : Tillbaka till framtiden" . Mikrob . 2 (3): 125–131. Arkiverad från originalet 2013-12-31.
- Pandey, B.; Ghimire, P.; Agrawal, VP (12–15 januari 2004). Studier av den antibakteriella aktiviteten hos Actinomycetes isolerade från Khumbu-regionen i Nepal (PDF) . Internationell konferens om det stora Himalaya: klimat, hälsa, ekologi, förvaltning och bevarande. Katmandu. Arkiverad från originalet (PDF) 2013-08-10.