Transkriptionsfaktor II H

allmän transkriptionsfaktor IIH, polypeptid 1, 62 kDa
identifierare
Symbol GTF2H1
Alt. symboler BTF2
NCBI-genen 2965
HGNC 4655
OMIM 189972
RefSeq NM_005316
UniProt P32780
Övriga uppgifter
Ställe Chr. 11 p15.1-p14
Söka efter
Strukturer Schweizisk modell
Domäner InterPro
allmän transkriptionsfaktor IIH, polypeptid 2, 44kDa-
identifierare
Symbol GTF2H2
Alt. symboler BTF2, TFIIH, BTF2P44, T-BTF2P44
NCBI-genen 2966
HGNC 4656
OMIM 601748
RefSeq NM_001515
UniProt Q13888
Övriga uppgifter
Ställe Chr. 5 q12.2-13.3
Söka efter
Strukturer Schweizisk modell
Domäner InterPro
allmän transkriptionsfaktor IIH, polypeptid 3, 34kDa-
identifierare
Symbol GTF2H3
Alt. symboler BTF2, TFIIH
NCBI-genen 2967
HGNC 4657
OMIM 601750
RefSeq NM_001516
UniProt Q13889
Övriga uppgifter
Ställe Chr. 12 q24.31
Söka efter
Strukturer Schweizisk modell
Domäner InterPro

Transkriptionsfaktor II Human ( transkriptionsfaktor IIH ; TF IIH i ) är ett viktigt proteinkomplex , som har roller transkription av olika proteinkodande gener och DNA- nukleotidexcisionsreparationsvägar (NER). TF II H kom först i dagen 1989 när allmän transkriptionsfaktor-δ eller grundläggande transkriptionsfaktor 2 karakteriserades som en oumbärlig transkriptionsfaktor in vitro. Denna faktor isolerades också från jäst och gavs slutligen namnet TF II H 1992.

TF II H består av tio subenheter, varav 7 ( ERCC2 /XPD, ERCC3 /XPB, GTF2H1 /p62, GTF2H4 /p52, GTF2H2 /p44, GTF2H3/p34 och GTF2H5 /TTDA) bildar kärnkomplexet. Det cyklinaktiverande kinas-subkomplexet ( CDK7 , MAT1 och cyklin H) är kopplat till kärnan via XPD-proteinet. Två av underenheterna, ERCC2 /XPD och ERCC3/ XPB , har helikas- och ATPas -aktiviteter och hjälper till att skapa transkriptionsbubblan . I ett provrör krävs dessa subenheter endast för transkription om DNA -mallen inte redan är denaturerad eller om den är supercoiled .

Två andra TF II H-subenheter, CDK7 och cyklin H, fosforylerar serinaminosyror RNA - polymeras II C - terminala domänen och möjligen andra proteiner involverade i cellcykeln . Förutom en vital funktion vid transkriptionsinitiering är TF IIH också involverad i nukleotidexcisionsreparation .

Historia om TF II H

Innan TF II H identifierade den, hade den flera namn: denna faktor först 1989 isolerad från lever på råtta känd som faktor transkriptionsdelta den också, isolerad från cancercell känd som Basic transkriptionsfaktor 2, Dessutom är den isolerad från jäst känd transkriptionsfaktor B. Slutligen, 1992 känd som TF II H.

Struktur för TF II H

TF II H är ett tio-subenhetskomplex; sju av dessa subenheter omfattar "kärnan" medan tre innefattar den dissocierbara "CAK"-modulen (CDK Activating Kinase). Kärnan består av subenheter XPB, XPD, p62 , p52 , p44, p34 och p8 medan CAK är sammansatt av CDK7 , cyklin H och MAT1 .

Funktioner

Allmän funktion för TF II H:

  1. Initiering av transkription av proteinkodande gen.
  2. DNA-nukleotidreparation.

(NER)TF II H är en allmän transkriptionsfaktor som verkar för att rekrytera RNA Pol II till promotorerna av gener. Den fungerar som en helikas som lindar upp DNA. Den lindar också upp DNA efter att en DNA-skada har identifierats av antingen den globala genomreparationsvägen (GGR) eller den transkriptionskopplade reparationsvägen (TCR) av NER. Renat TF II H har en roll i att stoppa ytterligare RNA-syntes genom att aktivera den cykliska peptiden a-amanitin.

Trikotiodystrofi

Mutation i generna ERCC3 ( XPB ), ERCC2 ( XPD ) eller GTF2H5 ( TTDA ) orsakar trikotiodystrofi , ett tillstånd som kännetecknas av ljuskänslighet , iktyos , skört hår och naglar, intellektuell funktionsnedsättning, minskad fertilitet och/eller kortväxthet.

Sjukdom

Genetiska polymorfismer av gener som kodar för subenheter av TF IIH är kända för att vara associerade med ökad cancerkänslighet i många vävnader, t.ex. hudvävnad, bröstvävnad och lungvävnad. Mutationer i subenheterna (som XPD och XPB) kan leda till en mängd olika sjukdomar, inklusive xeroderma pigmentosum (XP) eller XP kombinerat med Cockayne syndrom . Förutom genetiska variationer riktar viruskodade proteiner sig också mot TF II H.

DNA-reparation

TF II H deltar i nukleotidexcisionsreparation (NER) genom att öppna DNA- dubbelhelixen efter att skadan initialt har upptäckts. NER är en flerstegsväg som tar bort en lång rad olika skador som förvränger normal basparning, inklusive skrymmande kemiska skador och UV-inducerade skador. Individer med mutationsdefekter i gener som specificerar proteinkomponenter som katalyserar NER-vägen, inklusive TF II H-komponenterna, uppvisar ofta drag av för tidigt åldrande (se DNA-skadeteori om åldrande ).

Inhibitorer

Kraftfulla, bioaktiva naturliga produkter som triptolid som hämmar däggdjurstranskription via hämning av XPB-subenheten av den allmänna transkriptionsfaktorn TF II H har nyligen rapporterats som ett glukoskonjugat för att rikta in sig på hypoxiska cancerceller med ökat glukostransportöruttryck.

Mekanism för att TF II H reparerar DNA-skadad sekvens

Mekanism för TFIIH-reparation av DNA-skadad sekvens

externa länkar