SOX5

SOX5-
identifierare
	, LL-SOX5B, L-SOX5F, LAMSHF, SRY-box 5, SRY-box-transkriptionsfaktor 5
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Transkriptionsfaktor SOX-5 är ett protein som hos människor kodas av SOX5 -genen .

Fungera

Denna gen kodar för en medlem av SOX-familjen (SRY-relaterad HMG-box) av transkriptionsfaktorer involverade i regleringen av embryonal utveckling och i bestämningen av cellödet. Det kodade proteinet kan fungera som en transkriptionsregulator efter att ha bildats ett proteinkomplex med andra proteiner. Det kodade proteinet kan spela en roll vid kondrogenes. En pseudogen av denna gen finns på kromosom 8. Flera transkriptvarianter som kodar för distinkta isoformer har identifierats för denna gen.

Mutationer i SOX5-genen kan orsaka Lamb-Shaffers syndrom .

Se även

• SOX-gener

Vidare läsning

•   Kamachi Y, Uchikawa M, Kondoh H (april 2000). "Para ihop SOX off: med partners i regleringen av embryonal utveckling". Trender inom genetik . 16 (4): 182–7. doi : 10.1016/S0168-9525(99)01955-1 . PMID 10729834 .
•   Bowles J, Schepers G, Koopman P (november 2000). "Fylogeni av SOX-familjen av utvecklingstranskriptionsfaktorer baserad på sekvens och strukturella indikatorer" . Utvecklingsbiologi . 227 (2): 239–55. doi : 10.1006/dbio.2000.9883 . PMID 11071752 .
•   Wilson M, Koopman P (aug 2002). "Matching SOX: partnerproteiner och co-faktorer i SOX-familjen av transkriptionella regulatorer". Aktuell åsikt inom genetik och utveckling . 12 (4): 441–6. doi : 10.1016/S0959-437X(02)00323-4 . PMID 12100890 .
•   Schepers GE, Teasdale RD, Koopman P (aug 2002). "Tjugo par sox: omfattning, homologi och nomenklatur för genfamiljerna för mus och mänskliga sox transkriptionsfaktorer" . Utvecklingscell . 3 (2): 167–70. doi : 10.1016/S1534-5807(02)00223-X . PMID 12194848 .
•    Denny P, Swift S, Brand N, Dabhade N, Barton P, Ashworth A (juni 1992). "En konserverad familj av gener relaterade till den testikelbestämmande genen, SRY" . Nukleinsyraforskning . 20 (11): 2887. doi : 10.1093/nar/20.11.2887 . PMC 336939 . PMID 1614875 .
•    Connor F, Cary PD, Read CM, Preston NS, Driscoll PC, Denny P, Crane-Robinson C, Ashworth A (aug 1994). "DNA-bindnings- och böjningsegenskaper hos det postmeiotiskt uttryckta Sry-relaterade proteinet Sox-5" . Nukleinsyraforskning . 22 (16): 3339–46. doi : 10.1093/nar/22.16.3339 . PMC 523727 . PMID 8078769 .
•   Maruyama K, Sugano S (januari 1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•   Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (sep 1996). "Normalisering och subtraktion: två tillvägagångssätt för att underlätta genupptäckt" . Genomforskning . 6 (9): 791-806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (okt 1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•    Lefebvre V, Li P, de Crombrugghe B (okt 1998). "En ny lång form av Sox5 (L-Sox5), Sox6 och Sox9 samuttrycks i kondrogenes och samarbetar aktiverar kollagenen typ II. " EMBO Journal . 17 (19): 5718–33. doi : 10.1093/emboj/17.19.5718 . PMC 1170900 . PMID 9755172 .
•    Uusitalo H, Hiltunen A, Ahonen M, Gao TJ, Lefebvre V, Harley V, Kähäri VM, Vuorio E (okt 2001). "Accelererad uppreglering av L-Sox5, Sox6 och Sox9 genom BMP-2-genöverföring under murin frakturläkning" . Journal of Bone and Mineral Research . 16 (10): 1837–45. doi : 10.1359/jbmr.2001.16.10.1837 . PMID 11585348 . S2CID 42947355 .
•   Zafarana G, Gillis AJ, van Gurp RJ, Olsson PG, Elstrodt F, Stoop H, Millán JL, Oosterhuis JW, Looijenga LH (mars 2002). "Koamplifiering av DAD-R, SOX5 och EKI1 i humana testikelseminom, med specifikt överuttryck av DAD-R, korrelerar med minskade nivåer av apoptos och tidigare klinisk manifestation". Cancerforskning . 62 (6): 1822–31. PMID 11912161 .
•   Ikeda T, Zhang J, Chano T, Mabuchi A, Fukuda A, Kawaguchi H, Nakamura K, Ikegawa S (sep 2002). "Identifiering och karakterisering av den mänskliga långa formen av Sox5 (L-SOX5) gen". Gene . 298 (1): 59–68. doi : 10.1016/S0378-1119(02)00927-7 . PMID 12406576 .