Denna gen tillhör gaffelproteinfamiljen av transkriptionsfaktorer som kännetecknas av en DNA-bindande gaffeldomän . FoxD3 fungerar som en transkriptionsrepressor och innehåller det C-terminala engrailed homology-1-motivet (eh1), vilket ger en interaktiv yta med en transkriptionell co-repressor Grg4 (Groucho-relaterad gen-4).
Stamceller
Flera studier har föreslagit Foxd3-inblandning i övergången från naiva till primerade pluripotenta stamceller i embryoutveckling. Tidigare har Foxd3 visat sig krävas för att upprätthålla pluripotens i embryonala stamceller från mus . En ny upptäckt visade vidare att Foxd3 är nödvändig som en repressor i övergången från ESC till epiblastliknande celler (EpiLC). Studien föreslog att Foxd3 är associerad med inaktivering av viktiga naiva pluripotensgener genom dess modifiering av kromatinstrukturer via rekrytering av histondemetylaser och minskning av antalet aktiverande faktorer. En annan föreslagen mekanism hävdade å andra sidan att Foxd3 börjar avlägsna nukleosom och induktion till ett "primat" pluripotent tillstånd genom att rekrytera Brgl , en nukleosomremodellerare, och sedan fungerar som en repressor för maximal aktivering av dessa förstärkare genom att rekrytera histondeacetylaser , vilket tyder på ett komplext förmedlande funktion där förstärkare förbereds för någon framtida kontrollerad tidpunkt snarare än omedelbart uttryck. Även om det inte finns någon tvetydighet om att Foxd3 spelar en viktig roll för att reglera övergången från naivt till primerat pluripotenstillstånd, visar de två modellerna en annan process. Försök att förena slutsatserna från de två studierna har vidare antytt att Foxd3 fungerar som alla ovanstående.
Neural Crest-celler
FOXD3 spelar en viktig roll i utvecklingen och differentieringen av neurala crestceller. Specifikt tros det att FOXD3 spelar en viktig roll för att kontrollera utvecklingsväxlingen mellan Schwann-cellsprogenitorer och melanocyter.