Rel homologidomän
| Rel homologidomän (RHD) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Ovanifrån av kristallstrukturen för en homodimer av Rel homologidomänerna av NFKB1 (grön och magenta) bunden till DNA (orange).
| |||||||||||
| Identifierare | |||||||||||
| Symbol | RHD | ||||||||||
| Pfam | PF00554 | ||||||||||
| InterPro | IPR011539 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC00924 | ||||||||||
| SCOP2 | 1svc / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| CDD | cd07827 | ||||||||||
| |||||||||||
Rel -homologidomänen (RHD) är en proteindomän som finns i en familj av eukaryota transkriptionsfaktorer , inklusive både NF-KB och NFAT , bland andra. Vissa av dessa transkriptionsfaktorer verkar bilda multiprotein- DNA -bundna komplex. Fosforylering av RHD verkar spela en roll i regleringen av några av dessa transkriptionsfaktorer, som verkar för att modulera uttrycket av deras målgener.
RHD består av två immunglobulinliknande beta - fat- subdomäner som greppar DNA:t i huvudskåran. Den N-terminala specificitetsdomänen liknar kärndomänen för p53- transkriptionsfaktorn och innehåller en igenkänningsloop som interagerar med DNA-baser. I fallet med NF-KB bestämmer den C-terminala dimeriseringssubdomänen dimeriseringsbenägenhet med andra proteiner i NF-KB /Rel-proteinfamiljen. Dimeriseringssubdomänen följs omedelbart av en nukleär lokaliseringssekvens som också innefattar stället för hämmande interaktioner med IKB .