Denna gen tillhör homeobox -familjen av gener. Homeobox-generna kodar för en mycket konserverad familj av transkriptionsfaktorer som spelar en viktig roll i morfogenesen i alla flercelliga organismer . Däggdjur har fyra liknande homeobox-genkluster, HOXA, HOXB, HOXC och HOXD, som finns på olika kromosomer och består av 9 till 11 gener arrangerade i tandem. Denna gen, HOXC5, är en av flera homeobox HOXC-gener som finns i ett kluster på kromosom 12 . Tre gener, HOXC5, HOXC4 och HOXC6 , delar en 5' icke-kodande exon . Transkript kan inkludera den delade exonen splitsad till de genspecifika exonerna, eller så kan de inkludera endast de genspecifika exonerna. Två alternativt skarvade varianter har beskrivits för HOXC5. Transkriptvarianten som inkluderar det delade exonet kodar tydligen inte för ett protein. Den proteinkodande transkriptvarianten innehåller endast genspecifika exoner.
Boncinelli E, Acampora D, Pannese M, D'Esposito M, Somma R, Gaudino G, Stornaiuolo A, Cafiero M, Faiella A, Simeone A (1990). "Organisation av human klass I homeobox-gener". Genom . 31 (2): 745–56. doi : 10.1139/g89-133 . PMID 2576652 .