KDM5D

KDM5D
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, HY, HYA, JARID1D, SMCY, lysindemetylas 5D
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Lysinspecifikt demetylas 5D är ett enzym som hos människor kodas av KDM5D -genen . KDM5D tillhör den alfa-ketoglutaratberoende hydroxylas- superfamiljen.

Denna gen kodar för ett protein som innehåller zinkfingerdomäner . En kort peptid som härrör från detta protein är ett mindre histokompatibilitetsantigen som kan leda till transplantatavstötning av manliga donatorceller hos en kvinnlig mottagare.

Vidare läsning

•   Simpson E, Scott D, Chandler P (1997). "Det mansspecifika histokompatibilitetsantigenet, HY: en historia av transplantation, immunsvarsgener, könsbestämning och uttryckskloning". Årlig översyn av immunologi . 15 : 39–61. doi : 10.1146/annurev.immunol.15.1.39 . PMID 9143681 .
•    Wolf U (1998). "Det serologiskt detekterade HY-antigenet återbesöks". Cytogenetik och cellgenetik . 80 (1–4): 232–5. doi : 10.1159/000014986 . PMID 9678364 . S2CID 25908189 .
•   Agulnik AI, Mitchell MJ, Lerner JL, Woods DR, Bishop CE (juni 1994). "En mus Y-kromosomgen kodad av en region som är nödvändig för spermatogenes och uttryck av mansspecifika mindre histokompatibilitetsantigener". Human molekylär genetik . 3 (6): 873–8. doi : 10.1093/hmg/3.6.873 . PMID 7524912 .
•   Wang W, Meadows LR, den Haan JM, Sherman NE, Chen Y, Blokland E, Shabanowitz J, Agulnik AI, Hendrickson RC, Bishop CE (september 1995). "Human HY: ett mansspecifikt histokompatibilitetsantigen härlett från SMCY-proteinet". Vetenskap . 269 ​​(5230): 1588–90. Bibcode : 1995Sci...269.1588W . doi : 10.1126/science.7667640 . hdl : 1887/2988 . PMID 7667640 .
•   Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Ohira M, Kawarabayasi Y, Ohara O, Tanaka A, Kotani H, Miyajima N, Nomura N (oktober 1996). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. VI. De kodande sekvenserna för 80 nya gener (KIAA0201-KIAA0280) härledd genom analys av cDNA-kloner från cellinje KG-1 och hjärna" . DNA-forskning . 3 (5): 321–9, 341–54. doi : 10.1093/dnares/3.5.321 . PMID 9039502 .
•    Agulnik AI, Bishop CE, Lerner JL, Agulnik SI, Solovyev VV (februari 1997). "Analys av mutationshastigheter i SMCY/SMCX-gener visar att däggdjursutveckling är manlig". Däggdjurs genom . 8 (2): 134–8. doi : 10.1007/s003359900372 . PMID 9060413 . S2CID 8099911 .
•   Rufer N, Wolpert E, Helg C, Tiercy JM, Gratwohl A, Chapuis B, Jeannet M, Goulmy E, Roosnek E (oktober 1998). "HA-1 och den SMCY-härledda peptiden FIDSYICQV (HY) är immundominanta mindre histokompatibilitetsantigener efter benmärgstransplantation". Transplantation . 66 (7): 910–6. doi : 10.1097/00007890-199810150-00016 . PMID 9798702 .
•    Lau YF, Zhang J (april 2000). "Expressionsanalys av trettioen Y-kromosomgener i mänsklig prostatacancer". Molekylär karcinogenes . 27 (4): 308–21. doi : 10.1002/(SICI)1098-2744(200004)27:4<308::AID-MC9>3.0.CO;2-R . PMID 10747295 . S2CID 23677925 .
•    Shen P, Wang F, Underhill PA, Franco C, Yang WH, Roxas A, Sung R, Lin AA, Hyman RW, Vollrath D, Davis RW, Cavalli-Sforza LL, Oefner PJ (juni 2000). "Befolkningsgenetiska implikationer från sekvensvariation i fyra Y-kromosomgener" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (13): 7354–9. Bibcode : 2000PNAS...97.7354S . doi : 10.1073/pnas.97.13.7354 . PMC 16549 . PMID 10861003 .
•   Skaletsky H, Kuroda-Kawaguchi T, Minx PJ, Cordum HS, Hillier L, Brown LG, Repping S, Pyntikova T, Ali J, Bieri T, Chinwalla A, Delehaunty A, Delehaunty K, Du H, Fewell G, Fulton L, Fulton R, Graves T, Hou SF, Latrielle P, Leonard S, Mardis E, Maupin R, McPherson J, Miner T, Nash W, Nguyen C, Ozersky P, Pepin K, Rock S, Rohlfing T, Scott K, Schultz B , Strong C, Tin-Wollam A, Yang SP, Waterston RH, Wilson RK, Rozen S, Page DC (juni 2003). "Den mansspecifika regionen av den mänskliga Y-kromosomen är en mosaik av diskreta sekvensklasser" . Naturen . 423 (6942): 825–37. Bibcode : 2003Natur.423..825S . doi : 10.1038/nature01722 . PMID 12815422 .
•   Agate RJ, Choe M, Arnold AP (februari 2004). "Könsskillnader i struktur och uttryck av könskromosomgenerna CHD1Z och CHD1W i zebrafinkar" . Molekylärbiologi och evolution . 21 (2): 384–96. doi : 10.1093/molbev/msh027 . PMID 14660691 .
•    Miklos DB, Kim HT, Miller KH, Guo L, Zorn E, Lee SJ, Hochberg EP, Wu CJ, Alyea EP, Cutler C, Ho V, Soiffer RJ, Antin JH, Ritz J (april 2005). "Antikroppssvar på HY mindre histokompatibilitetsantigener korrelerar med kronisk transplantat-mot-värd-sjukdom och sjukdomsremission" . Blod . 105 (7): 2973–8. doi : 10.1182/blood-2004-09-3660 . PMC 1350982 . PMID 15613541 .
•   Piper KP, McLarnon A, Arrazi J, Horlock C, Ainsworth J, Kilby MD, Martin WL, Moss PA (januari 2007). "Funktionella HY-specifika CD8+ T-celler finns i en hög andel kvinnor efter graviditet med ett manligt foster" . Reproduktionens biologi . 76 (1): 96–101. doi : 10.1095/biolreprod.106.055426 . PMID 16988213 .
•    Iwase S, Lan F, Bayliss P, de la Torre-Ubieta L, Huarte M, Qi HH, Whetstine JR, Bonni A, Roberts TM, Shi Y (mars 2007). "Den X-länkade mental retardationsgen SMCX/JARID1C definierar en familj av histon H3 lysin 4 demetylaser" . Cell . 128 (6): 1077–88. doi : 10.1016/j.cell.2007.02.017 . PMID 17320160 . S2CID 14729302 .
•    Lee MG, Norman J, Shilatifard A, Shiekhattar R (mars 2007). "Fysisk och funktionell association av ett trimetyl H3K4-demetylas och Ring6a/MBLR, ett polykamliknande protein" . Cell . 128 (5): 877–87. doi : 10.1016/j.cell.2007.02.004 . PMID 17320162 . S2CID 6519228 .

externa länkar

• JARID1D+protein,+human vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q9BY66 (Lysin-specifikt demetylas 5D) vid PDBe-KB .

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .