Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
CEBPE
Tillgängliga strukturer
PDB
Ortologisk sökning:
Identifierare
, C/EBP-epsilon, CRP1, CCAAT/enhancer-bindande protein-epsilon, CCAAT-enhancer-bindande protein-epsilon, c/EBP-epsilon
Externa ID :n
Wikidata
CCAAT/enhancer-bindande protein (C/EBP), epsilon, även känd som CEBPE och CRP1 , är en typ av ccaat-enhancer-bindande protein . CEBPE är dess mänskliga gen och är proapoptotisk .
Proteinet som kodas av denna gen är en bZIP -transkriptionsfaktor som kan binda som en homodimer till vissa DNA-reglerande regioner. Det kan också bilda heterodimerer med det relaterade proteinet CEBP-δ . Det kodade proteinet kan vara väsentligt för terminal differentiering och funktionell mognad av engagerade granulocyt- progenitorceller . Mutationer i denna gen har associerats med specifik granulbrist , en sällsynt medfödd sjukdom. Flera varianter av denna gen har beskrivits, men fullängdsnaturen för endast en har fastställts.
Vidare läsning
Sladek FM, Darnell JE (april 1992). "Mekanismer för leverspecifikt genuttryck". Aktuell åsikt inom genetik och utveckling . 2 (2): 256–9. doi : 10.1016/S0959-437X(05)80282-5 . PMID 1638120 .
Gombart AF, Koeffler HP (januari 2002). "Neutrofilspecifik granulbrist och mutationer i genen som kodar för transkriptionsfaktor C/EBP(epsilon)". Aktuell åsikt i hematologi . 9 (1): 36–42. doi : 10.1097/00062752-200201000-00007 . PMID 11753076 . S2CID 25411864 .
Williams SC, Cantwell CA, Johnson PF (sep 1991). "En familj av C/EBP-relaterade proteiner som kan bilda kovalent kopplade leucinblixtlåsdimerer in vitro" . Gener & Utveckling . 5 (9): 1553–67. doi : 10.1101/gad.5.9.1553 . PMID 1884998 .
Antonson P, Stellan B, Yamanaka R, Xanthopoulos KG (juli 1996). "En ny human CCAAT/enhancer-bindande proteingen, C/EBPepsilon, uttrycks i celler av lymfoida och myeloida linjer och är lokaliserad på kromosom 14q11.2 nära T-cellsreceptorn alfa/delta-lokus". Genomik . 35 (1): 30–8. doi : 10.1006/geno.1996.0319 . PMID 8661101 .
Chumakov AM, Grillier I, Chumakova E, Chih D, Slater J, Koeffler HP (mars 1997). "Klonning av den nya humana myeloidcellspecifika C/EBP-epsilon-transkriptionsfaktorn" . Molekylär och cellulär biologi . 17 (3): 1375–86. doi : 10.1128/mcb.17.3.1375 . PMC 231862 . PMID 9032264 .
Yamanaka R, Kim GD, Radomska HS, Lekstrom-Himes J, Smith LT, Antonson P, Tenen DG, Xanthopoulos KG (juni 1997). "CCAAT/enhancer-bindande protein epsilon uppregleras företrädesvis under granulocytisk differentiering och dess funktionella mångsidighet bestäms av alternativ användning av promotorer och differentiell splitsning" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (12): 6462–7. doi : 10.1073/pnas.94.12.6462 . PMC 21072 . PMID 9177240 .
Verbeek W, Gombart AF, Chumakov AM, Müller C, Friedman AD, Koeffler HP (maj 1999). "C/EBPepsilon interagerar direkt med den DNA-bindande domänen av c-myb och aktiverar i samverkan transkription av myeloida promotorer" . Blod . 93 (10): 3327–37. doi : 10.1182/blod.V93.10.3327 . PMID 10233885 .
Lekstrom-Himes JA, Dorman SE, Kopar P, Holland SM, Gallin JI (juni 1999). "Neutrofilspecifik granulbrist är resultatet av en ny mutation med förlust av funktion av transkriptionsfaktorn CCAAT/enhancer-bindande protein epsilon" . Journal of Experimental Medicine . 189 (11): 1847–52. doi : 10.1084/jem.189.11.1847 . PMC 2193089 . PMID 10359588 .
Tavor S, Vuong PT, Park DJ, Gombart AF, Cohen AH, Koeffler HP (mars 2002). "Makrofagfunktionell mognad och cytokinproduktion är försämrad i möss med C/EBP-epsilonbrist". Blod . 99 (5): 1794–801. doi : 10.1182/blod.V99.5.1794 . PMID 11861297 .
Zhang P, Nelson E, Radomska HS, Iwasaki-Arai J, Akashi K, Friedman AD, Tenen DG (juni 2002). "Induktion av granulocytisk differentiering genom 2 vägar" . Blod . 99 (12): 4406–12. doi : 10.1182/blod.V99.12.4406 . PMID 12036869 .
Kim J, Cantwell CA, Johnson PF, Pfarr CM, Williams SC (okt 2002). "Transkriptionsaktivitet av CCAAT/enhancer-bindande proteiner kontrolleras av en konserverad hämmande domän som är ett mål för sumoylering" . Journal of Biological Chemistry . 277 (41): 38037–44. doi : 10.1074/jbc.M207235200 . PMID 12161447 .
Du J, Stankiewicz MJ, Liu Y, Xi Q, Schmitz JE, Lekstrom-Himes JA, Ackerman SJ (november 2002). "Nya kombinatoriska interaktioner av GATA-1-, PU.1- och C/EBPepsilon-isoformer reglerar transkription av genen som kodar för eosinofilgranulens huvudprotein. " Journal of Biological Chemistry . 277 (45): 43481–94. doi : 10.1074/jbc.M204777200 . PMID 12202480 .
Truong BT, Lee YJ, Lodie TA, Park DJ, Perrotti D, Watanabe N, Koeffler HP, Nakajima H, Tenen DG, Kogan SC (feb 2003). "CCAAT/Enhancer-bindande proteiner undertrycker den leukemiska fenotypen av akut myeloid leukemi". Blod . 101 (3): 1141–8. doi : 10.1182/blood-2002-05-1374 . PMID 12393450 .
Gombart AF, Kwok SH, Anderson KL, Yamaguchi Y, Torbett BE, Koeffler HP (april 2003). "Reglering av neutrofil och eosinofil sekundär granul genuttryck genom transkriptionsfaktorer C/EBP epsilon och PU.1" . Blod . 101 (8): 3265–73. doi : 10.1182/blood-2002-04-1039 . PMID 12515729 .
Khanna-Gupta A, Zibello T, Sun H, Gaines P, Berliner N (maj 2003). "Kromatinimmunutfällningsstudier (ChIP) indikerar en roll för CCAAT-förstärkarbindande proteiner alfa och epsilon (C/EBP alfa och C/EBP epsilon) och CDP/cut i myeloidmognadsinducerat laktoferringenenuttryck". Blod . 101 (9): 3460–8. doi : 10.1182/blood-2002-09-2767 . PMID 12522000 .
Gery S, Gombart AF, Fung YK, Koeffler HP (feb 2004). "C/EBPepsilon interagerar med retinoblastom och E2F1 under granulopoiesis" . Blod . 103 (3): 828–35. doi : 10.1182/blood-2003-01-0159 . PMID 12947005 .
Gery S, Park DJ, Vuong PT, Chih DY, Lemp N, Koeffler HP (dec 2004). "Retinsyra reglerar C/EBP homologt proteinuttryck (CHOP), som negativt reglerar myeloida målgener" . Blod . 104 (13): 3911–7. doi : 10.1182/blood-2003-10-3688 . PMID 15308577 .
externa länkar
Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .
(1) Grundläggande domäner
(1.1) Grundläggande leucin blixtlås ( bZIP )
(1.2) Basic helix-loop-helix ( bHLH )
Grupp A
Grupp B
Grupp C bHLH- PAS
Grupp D
Grupp E
Grupp F bHLH-COE
(1,3) bHLH-ZIP
(1.4) NF-1
(1,5) RF-X
(1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
(2) Zinkfinger DNA-bindande domäner
(2.1) Nukleär receptor (Cys 4 )
underfamilj 1
underfamilj 2
underfamilj 3
underfamilj 4
underfamilj 5
underfamilj 6
underfamilj 0
(2.2) Andra Cys 4
(2.3) Cys 2 His 2
(2.4) Cys 6
(2.5) Alternerande sammansättning
(2.6) VÄLDIGT
(4) β-Ställningsfaktorer med mindre spårkontakter
(0) Andra transkriptionsfaktorer