RE1-dämpande transkriptionsfaktor

RESTEN
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, Rest, 2610008J04Rik, AA407358, NRSF, XBR, REST4, WT6, RE1 tystande transkriptionsfaktor, GINGF5, HGF5, DFNA27
Externa ID: n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

RE1-Silencing Transcription Factor ( REST ), även känd som Neuron-Restrictive Silencer Factor ( NRSF ), är ett protein som hos människor kodas av REST -genen och fungerar som en transkriptionsrepressor . REST är uttryckligen involverat i undertryckandet av neurala gener i icke-neuronala celler. Många genetiska störningar har kopplats till förändringar i REST-uttrycksmönstret, inklusive kolon- och småcelliga lungkarcinom som hittats med trunkerade versioner av REST. Utöver dessa cancerformer har defekter i REST också tillskrivits en roll i Huntingtons sjukdom, neuroblastom och effekterna av epileptiska anfall och ischemi.

Fungera

Denna gen kodar för en transkriptionell repressor som undertrycker neuronala gener i icke-neuronala vävnader. Det är en medlem av Kruppel -typ zinkfinger transkriptionsfaktorfamiljen . Det undertrycker transkription genom att binda ett DNA-sekvenselement som kallas det neuron-restriktiva ljuddämparelementet (NRSE, även känt som RE1). Proteinet finns också i odifferentierade neuronala progenitorceller , och man tror att denna repressor kan fungera som en master negativ regulator av neurogenes . Alternativt splitsade transkriptvarianter har beskrivits; deras fulla längds natur har dock inte fastställts. REST visar sig vara nedreglerad hos äldre personer med Alzheimers sjukdom .

REST innehåller 8 Cys ₂ His ₂ zinkfingrar och förmedlar genrepression genom att rekrytera flera kromatinmodifierande enzymer.

NRSF band till DNA och kofaktorer på var och en av dess två kofaktorbindande domäner.
Kromatinomformning sker, vilket gör att genen "stänger av".

REST-uttryck korrelerar starkt med ökad livslängd. REST-nivåerna är högst i hjärnan hos människor som levde upp till 90-100-talet och förblev kognitivt intakta. Nivåerna förblev höga specifikt i hjärnregioner som var sårbara för Alzheimers, vilket tyder på att de kan vara skyddade från demens. Det antas att REST undertrycker gener som främjar celldöd och Alzheimers sjukdomspatologi och inducerar uttrycket av stressresponsgener. Dessutom skyddar REST potent neuroner från oxidativ stress och amyloid β-proteintoxicitet. REST är också ansvarigt för ischemi-inducerad neuronal celldöd, i musmodeller av hjärnischemi. Ischemi, som är resultatet av minskad blodperfusion av vävnader, minskad närings- och syretillförsel, inducerar REST-transkription och kärnackumulering, vilket leder till epigenetisk repression av neuronala gener som leder till celldöd. Mekanismen bortom REST-induktion vid ischemi kan vara nära kopplad till dess syreberoende nukleära translokation och repression av målgener i hypoxi (lågt syre) där REST fyller funktionerna hos en masterregulator för genrepression vid hypoxi.

Interaktioner

RE1-tysta transkriptionsfaktor har visats interagera med RCOR1 .

Vidare läsning

Ooi L, Wood IC (juli 2007). "Chromatin crosstalk i utveckling och sjukdom: lärdomar från REST". Naturrecensioner Genetik . 8 (7): 544–54. doi : 10.1038/nrg2100 . PMID 17572692 . S2CID 415873 .
Chong JA, Tapia-Ramírez J, Kim S, Toledo-Aral JJ, Zheng Y, Boutros MC, Altshuller YM, Frohman MA, Kraner SD, Mandel G (mars 1995). "REST: ett däggdjursljuddämparprotein som begränsar natriumkanalgenexpression till neuroner" . Cell . 80 (6): 949–57. doi : 10.1016/0092-8674(95)90298-8 . PMID 7697725 . S2CID 6412634 .
Schoenherr CJ, Anderson DJ (mars 1995). "Den neuron-restriktiva ljuddämparfaktorn (NRSF): en koordinatrepressor av flera neuronspecifika gener". Vetenskap . 267 (5202): 1360–3. Bibcode : 1995Sci...267.1360S . doi : 10.1126/science.7871435 . PMID 7871435 . S2CID 25101475 .
Scholl T, Stevens MB, Mahanta S, Strominger JL (februari 1996). "Ett zinkfingerprotein som undertrycker transkription av den humana MHC klass II-genen, DPA". Journal of Immunology . 156 (4): 1448–57. PMID 8568247 .
Coulson JM (september 2005). "Transkriptionsreglering: cancer, neuroner och REST" . Aktuell biologi . 15 (17): 665–8 kr. doi : 10.1016/j.cub.2005.08.032 . PMID 16139198 . S2CID 11901339 .
Thiel G, Lietz M, Cramer M (oktober 1998). "Biologisk aktivitet och modulär struktur av RE-1-tysta transkriptionsfaktor (REST), en repressor av neuronala gener" . Journal of Biological Chemistry . 273 (41): 26891–9. doi : 10.1074/jbc.273.41.26891 . PMID 9756936 .
Andrés ME, Burger C, Peral-Rubio MJ, Battaglioli E, Anderson ME, Grimes J, Dallman J, Ballas N, Mandel G (augusti 1999). "CoREST: en funktionell corepressor som krävs för reglering av neuralspecifikt genuttryck" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (17): 9873–8. Bibcode : 1999PNAS...96.9873A . doi : 10.1073/pnas.96.17.9873 . PMC 22303 . PMID 10449787 .
Palm K, Metsis M, Timmusk T (september 1999). "Neuronspecifik splitsning av zinkfingertranskriptionsfaktor REST/NRSF/XBR är frekvent i neuroblastom och konserverad hos människa, mus och råtta". Hjärnforskning. Molekylär hjärnforskning . 72 (1): 30–9. doi : 10.1016/S0169-328X(99)00196-5 . PMID 10521596 .
Naruse Y, Aoki T, Kojima T, Mori N (november 1999). "Neural restriktiv ljuddämparfaktor rekryterar mSin3 och histondeacetylaskomplex för att undertrycka neuronspecifika målgener" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (24): 13691–6. Bibcode : 1999PNAS...9613691N . doi : 10.1073/pnas.96.24.13691 . PMC 24126 . PMID 10570134 .
Grimes JA, Nielsen SJ, Battaglioli E, Miska EA, Speh JC, Berry DL, Atouf F, Holdener BC, Mandel G, Kouzarides T (mars 2000). "Samrepressorn mSin3A är en funktionell komponent i REST-CoREST-repressorkomplexet" . Journal of Biological Chemistry . 275 (13): 9461–7. doi : 10.1074/jbc.275.13.9461 . PMID 10734093 .
Coulson JM, Edgson JL, Woll PJ, Quinn JP (april 2000). "En splitsningsvariant av den neuronrestriktiva ljuddämparfaktorrepressorn uttrycks i småcellig lungcancer: en potentiell roll i depression av neuroendokrina gener och en användbar klinisk markör". Cancerforskning . 60 (7): 1840–4. PMID 10766169 .
Kojima T, Murai K, Naruse Y, Takahashi N, Mori N (juni 2001). "Icke-selektiv transkription av celltyp av mus- och mänskliga gener som kodar för neural-restriktiv ljuddämparfaktor". Hjärnforskning. Molekylär hjärnforskning . 90 (2): 174–86. doi : 10.1016/S0169-328X(01)00107-3 . PMID 11406295 .
Battaglioli E, Andrés ME, Rose DW, Chenoweth JG, Rosenfeld MG, Anderson ME, Mandel G (oktober 2002). "REST-repression av neuronala gener kräver komponenter av hSWI.SNF-komplexet" . Journal of Biological Chemistry . 277 (43): 41038–45. doi : 10.1074/jbc.M205691200 . PMID 12192000 .
Lunyak VV, Burgess R, Prefontaine GG, Nelson C, Sze SH, Chenoweth J, Schwartz P, Pevzner PA, Glass C, Mandel G, Rosenfeld MG (november 2002). "Corepressor-beroende tystnad av kromosomala regioner som kodar neuronala gener". Vetenskap . 298 (5599): 1747–52. Bibcode : 2002Sci...298.1747L . CiteSeerX 10.1.1.136.7131 . doi : 10.1126/science.1076469 . PMID 12399542 . S2CID 13507921 .
Lietz M, Hohl M, Thiel G (januari 2003). "RE-1 tystande transkriptionsfaktor (REST) reglerar mänsklig synaptofysingentranskription genom ett intronsekvensspecifikt DNA-bindningsställe" . European Journal of Biochemistry . 270 (1): 2–9. doi : 10.1046/j.1432-1033.2003.03360.x . PMID 12492469 .
Hersh LB, Shimojo M (mars 2003). "Reglering av kolinergt genuttryck av den neuronrestriktiva ljuddämparfaktorn/repressorelement-1 tystande transkriptionsfaktorn". Livsvetenskap . 72 (18–19): 2021–8. doi : 10.1016/S0024-3205(03)00065-1 . PMID 12628452 .
Kemp DM, Lin JC, Habener JF (september 2003). "Reglering av Pax4-parad homeodomängen genom neuron-restriktiv ljuddämparfaktor" . Journal of Biological Chemistry . 278 (37): 35057–62. doi : 10.1074/jbc.M305891200 . PMID 12829700 .
Zuccato C, Tartari M, Crotti A, Goffredo D, Valenza M, Conti L, Cataudella T, Leavitt BR, Hayden MR, Timmusk T, Rigamonti D, Cattaneo E (september 2003). "Huntingtin interagerar med REST/NRSF för att modulera transkriptionen av NRSE-kontrollerade neuronala gener". Naturgenetik . 35 (1): 76–83. doi : 10.1038/ng1219 . PMID 12881722 . S2CID 28110381 .
Martin D, Tawadros T, Meylan L, Abderrahmani A, Condorelli DF, Waeber G, Haefliger JA (december 2003). "Kritisk roll för den transkriptionella repressorn neuron-restriktiva ljuddämparfaktorn i den specifika kontrollen av connexin36 i insulinproducerande cellinjer" . Journal of Biological Chemistry . 278 (52): 53082–9. doi : 10.1074/jbc.M306861200 . PMID 14565956 .
Kuwahara K, Saito Y, Takano M, Arai Y, Yasuno S, Nakagawa Y, Takahashi N, Adachi Y, Takemura G, Horie M, Miyamoto Y, Morisaki T, Kuratomi S, Noma A, Fujiwara H, Yoshimasa Y, Kinoshita H , Kawakami R, Kishimoto I, Nakanishi M, Usami S, Saito Y, Harada M, Nakao K (december 2003). "NRSF reglerar fostrets hjärtgenprogram och upprätthåller normal hjärtstruktur och funktion" . EMBO Journal . 22 (23): 6310–21. doi : 10.1093/emboj/cdg601 . PMC 291842 . PMID 14633990 .
Kuwabara T, Hsieh J, Nakashima K, Taira K, Gage FH (mars 2004). "Ett litet modulerande dsRNA specificerar ödet för vuxna neurala stamceller" . Cell . 116 (6): 779–93. doi : 10.1016/S0092-8674(04)00248-X . PMID 15035981 . S2CID 12656737 .
Zullo JM, Drake D, Aron L, O'Hern P, Dhamne SC, Davidsohn N, Mao CA, Klein WH, Rotenberg A, Bennett DA, Church GM, Colaiácovo MP, Yankner BA (oktober 2019). "Reglering av livslängd genom neural excitation och REST" . Naturen . 574 (7778): 359–364. Bibcode : 2019Natur.574..359Z . doi : 10.1038/s41586-019-1647-8 . PMC 6893853 . PMID 31619788 .

externa länkar

REST+protein,+human vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
Faktorbok NRSF

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .