Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
SOX13
Identifiers
, ICA12, Sox-13, SRY-box 13, SRY-box transkriptionsfaktor 13
Externa ID:n
Wikidata
Transkriptionsfaktor SOX-13 är ett protein som hos människor kodas av SOX13 -genen .
Fungera
Denna gen kodar för en medlem av SOX-familjen (SRY-relaterad HMG-box) av transkriptionsfaktorer som är involverade i regleringen av embryonal utveckling och i bestämningen av cellöde. Det kodade proteinet kan fungera som en transkriptionsregulator efter att ha bildats ett proteinkomplex med andra proteiner. Det har också fastställts att det är ett autoantigen för typ 1-diabetes, även känd som öcellsantikropp 12.
I melanocytiska celler kan SOX13-genuttrycket regleras av MITF .
Se även
Vidare läsning
Wilson M, Koopman P (aug 2002). "Matching SOX: partnerproteiner och co-faktorer i SOX-familjen av transkriptionella regulatorer". Aktuell åsikt inom genetik och utveckling . 12 (4): 441–6. doi : 10.1016/S0959-437X(02)00323-4 . PMID 12100890 .
Schepers GE, Teasdale RD, Koopman P (aug 2002). "Tjugo par sox: omfattning, homologi och nomenklatur för genfamiljerna för mus och mänskliga sox transkriptionsfaktorer" . Utvecklingscell . 3 (2): 167–70. doi : 10.1016/S1534-5807(02)00223-X . PMID 12194848 .
Roose J, Korver W, Oving E, Wilson A, Wagenaar G, Markman M, Lamers W, Clevers H (Jan 1998). "Högt uttryck av HMG-boxfaktorn sox-13 i artärväggar under embryonal utveckling" . Nukleinsyraforskning . 26 (2): 469–76. doi : 10.1093/nar/26.2.469 . PMC 147262 . PMID 9421502 .
Argentaro A, Olsson J, Critcher R, McDowall SG, Harley VR (maj 2000). "Genomisk karakterisering och fin kartläggning av den mänskliga SOX13-genen". Gene . 250 (1–2): 181–9. doi : 10.1016/S0378-1119(00)00157-8 . PMID 10854791 .
Kasimiotis H, Myers MA, Argentaro A, Mertin S, Fida S, Ferraro T, Olsson J, Rowley MJ, Harley VR (april 2000). "Könsbestämmande region Y-relaterat protein SOX13 är ett diabetesautoantigen uttryckt i pankreasöar" . Diabetes . 49 (4): 555–61. doi : 10.2337/diabetes.49.4.555 . PMID 10871192 .
Steinbrenner H, Lohmann T, Ostendorf B, Scherbaum WA, Seissler J (november 2000). "Autoantikroppar mot ICA12 (SOX-13) är inte specifika för typ I-diabetes" . Diabetologia . 43 (11): 1381–4. doi : 10.1007/s001250051542 . PMID 11126406 .
Kasimiotis H, Fida S, Rowley MJ, Mackay IR, Zimmet PZ, Gleason S, Rabin DU, Myers MA (2001). "Antikroppar mot SOX13 (ICA12) är associerade med typ 1-diabetes". Autoimmunitet . 33 (2): 95–101. doi : 10.3109/08916930108995994 . PMID 11264788 . S2CID 43867785 .
Lampasona V, Scirpoli M, Bosi E, Bonifacio E (feb 2001). "ICA12(SOX13)-autoantikroppar är osannolikt att vara en användbar markör för preklinisk typ I-diabetes" . Diabetologia . 44 (2): 267. doi : 10.1007/s001250051610 . PMID 11270687 .
Argentaro A, Wapelhorst B, Concannon P, Harley VR (april 2001). "Länkstudier av SOX13, ICA12-autoantigengenen, i familjer med typ 1-diabetes". Molekylär genetik och metabolism . 72 (4): 356–9. doi : 10.1006/mgme.2000.3136 . PMID 11286511 .
Fida S, Myers M, Mackay IR, Zimmet PZ, Mohan V, Deepa R, Rowley MJ (juni 2001). "Antikroppar mot diabetesassocierade autoantigener hos indiska patienter med typ 1-diabetes: prevalens av anti-ICA512/IA2 och anti-SOX13". Diabetesforskning och klinisk praxis . 52 (3): 205–11. doi : 10.1016/S0168-8227(01)00230-3 . PMID 11323090 .
Tandon N, Shtauvere-Brameus A, Hagopian WA, Sanjeevi CB (april 2002). "Prevalens av ICA-12 och andra autoantikroppar hos nordindiska patienter med tidig diabetes". Annals of the New York Academy of Sciences . 958 (1): 214–7. Bibcode : 2002NYASA.958..214T . doi : 10.1111/j.1749-6632.2002.tb02972.x . PMID 12021109 . S2CID 39609924 .
Törn C, Shtauvere-Brameus A, Sanjeevi CB, Landin-Olsson M (apr 2002). "Ökade autoantikroppar mot SOX13 hos svenska patienter med typ 1-diabetes". Annals of the New York Academy of Sciences . 958 (1): 218–23. Bibcode : 2002NYASA.958..218T . doi : 10.1111/j.1749-6632.2002.tb02973.x . PMID 12021110 . S2CID 38116575 .
Shtauvere-Brameus A, Hagopian W, Rumba I, Sanjeevi CB (april 2002). "Antikroppar mot nytt betacellantigen ICA12 hos lettiska diabetespatienter". Annals of the New York Academy of Sciences . 958 (1): 297–304. Bibcode : 2002NYASA.958..297S . doi : 10.1111/j.1749-6632.2002.tb02991.x . PMID 12021128 . S2CID 26701600 .
Gupta M, Tandon N, Shtauvere-Brameus A, Sanjeevi CB (april 2002). "ICA12-autoantikroppar är associerade med icke-DR3/icke-DR4 hos patienter med latent autoimmun diabetes hos vuxna från norra Indien". Annals of the New York Academy of Sciences . 958 (1): 329–32. Bibcode : 2002NYASA.958..329G . doi : 10.1111/j.1749-6632.2002.tb02998.x . PMID 12021135 . S2CID 32027653 .
Fida S, Myers MA, Whittingham S, Rowley MJ, Ozaki S, Mackay IR (dec 2002). "Autoantikroppar mot transkriptionsfaktorn SOX13 vid primär biliär cirros jämfört med andra sjukdomar". Journal of Autoimmunity . 19 (4): 251–7. doi : 10.1006/jaut.2002.0622 . PMID 12473246 .
Park Y, Park H, Yoo E, Kim D (november 2003). "SOX13-autoantikroppar kommer sannolikt att vara en kompletterande markör för typ 1-diabetes i Korea". Annals of the New York Academy of Sciences . 1005 (1): 253–8. Bibcode : 2003NYASA1005..253P . doi : 10.1196/annals.1288.038 . PMID 14679071 . S2CID 11552139 .
externa länkar
Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .
PDB-galleri
1i11 : LÖSNINGSSTRUKTUR HOS DEN DNA-BINDANDE DOMÄNEN, SOX-5 HMG BOX FRÅN MUS
(1) Grundläggande domäner
(1.1) Grundläggande leucin blixtlås ( bZIP )
(1.2) Basic helix-loop-helix ( bHLH )
Grupp A
Grupp B
Grupp C bHLH- PAS
Grupp D
Grupp E
Grupp F bHLH-COE
(1,3) bHLH-ZIP
(1.4) NF-1
(1,5) RF-X
(1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
(2) Zinkfinger DNA-bindande domäner
(2.1) Nukleär receptor (Cys 4 )
underfamilj 1
underfamilj 2
underfamilj 3
underfamilj 4
underfamilj 5
underfamilj 6
underfamilj 0
(2.2) Andra Cys 4
(2.3) Cys 2 His 2
(2.4) Cys 6
(2.5) Alternerande sammansättning
(2.6) VÄLDIGT
(4) β-Ställningsfaktorer med mindre spårkontakter
(0) Andra transkriptionsfaktorer