CBX1

CBX1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CBX, HP1-BETA, HP1Hs-beta, HP1Hsbeta, M31, MOD1, p25beta, chromobox 1
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Chromobox protein homolog 1 är ett protein som hos människor kodas av CBX1 -genen .

Fungera

Proteinet är lokaliserat vid heterokromatinställen , där det förmedlar gentystnad .

Modellorganismer

Cbx1 knockout mus fenotyp

Karakteristisk	Fenotyp
Homozygot viabilitet	Onormal
Fertilitet	Vanligt
Kroppsvikt	Vanligt
Ångest	Vanligt
Neurologisk bedömning	Vanligt
Greppstyrka	Vanligt
Varm tallrik	Vanligt
Dysmorfologi	Vanligt
Indirekt kalorimetri	Onormal
Glukostoleranstest	Vanligt
Auditiv hjärnstammsrespons	Vanligt
DEXA	Vanligt
Radiografi	Vanligt
Kroppstemperatur	Vanligt
Ögonmorfologi	Vanligt
Klinisk kemi	Vanligt
Hematologi	Vanligt
Perifera blodlymfocyter	Vanligt
Mikrokärntest	Vanligt
Hjärtvikt	Vanligt
Hudhistopatologi	Vanligt
Ögonhistopatologi	Vanligt
Alla tester och analyser från

Modellorganismer har använts i studien av CBX1-funktion. En villkorlig knockout-muslinje , kallad Cbx1 ^{tm1a(EUCOMM)Wtsi} genererades som en del av programmet International Knockout Mouse Consortium - ett högkapacitetsprojekt för mutagenes för att generera och distribuera djurmodeller av sjukdomar till intresserade forskare - vid Wellcome Trust Sanger Institute .

Han- och hondjur genomgick en standardiserad fenotypisk screening för att bestämma effekterna av deletion. Tjugotvå tester utfördes och två fenotyper rapporterades. Inga homozygota mutanta djur överlevde förrän två veckors ålder, därför utfördes de återstående testerna på heterozygota mutantmöss. Manliga heterozygoter visade ökad VO2 , elimineringshastighet av koldioxid och energiförbrukning som bestämdes genom indirekt kalorimetri .

Interaktioner

CBX1 har visat sig interagera med:

• C11orf30 ,
• CBX3 och
• CBX5 , och
• SUV39H1 .

Se även

• Heterokromatinprotein 1

Vidare läsning

•   Lessard J, Baban S, Sauvageau G (feb 1998). "Stagespecifikt uttryck av polykamgruppsgener i mänskliga benmärgsceller" . Blod . 91 (4): 1216–24. doi : 10.1182/blod.V91.4.1216 . PMID 9454751 .
•    Aagaard L, Laible G, Selenko P, Schmid M, Dorn R, Schotta G, Kuhfittig S, Wolf A, Lebersorger A, Singh PB, Reuter G, Jenuwein T (apr 1999). "Funktionella däggdjurshomologer av Drosophila PEV-modifieraren Su(var)3-9 kodar för centromerassocierade proteiner som komplexbinder med heterokromatinkomponenten M31" . EMBO Journal . 18 (7): 1923–38. doi : 10.1093/emboj/18.7.1923 . PMC 1171278 . PMID 10202156 .
•    Minc E, Allory Y, Worman HJ, Courvalin JC, Buendia B (aug 1999). "Lokalisering och fosforylering av HP1-proteiner under cellcykeln i däggdjursceller". Kromosom . 108 (4): 220–34. doi : 10.1007/s004120050372 . PMID 10460410 . S2CID 12381860 .
•   Murzina N, Verreault A, Laue E, Stillman B (okt 1999). "Heterokromatindynamik i musceller: interaktion mellan kromatinmonteringsfaktor 1 och HP1-proteiner" . Molekylär cell . 4 (4): 529–40. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80204-X . PMID 10549285 .
•    Nielsen AL, Ortiz JA, You J, Oulad-Abdelghani M, Khechumian R, Gansmuller A, Chambon P, Losson R (november 1999). "Interaktion med medlemmar av familjen heterokromatinprotein 1 (HP1) och histondeacetylering är olika involverade i transkriptionell tystnad av medlemmar av TIF1-familjen. " EMBO Journal . 18 (22): 6385–95. doi : 10.1093/emboj/18.22.6385 . PMC 1171701 . PMID 10562550 .
•    Brasher SV, Smith BO, Fogh RH, Nietlispach D, Thiru A, Nielsen PR, Broadhurst RW, Ball LJ, Murzina NV, Laue ED (april 2000). "Strukturen av mus HP1 antyder ett unikt sätt för enskild peptidigenkänning av skuggkromdomändimeren" . EMBO Journal . 19 (7): 1587–97. doi : 10.1093/emboj/19.7.1587 . PMC 310228 . PMID 10747027 .
•   Zhao T, Heyduk T, Allis CD, Eissenberg JC (sep 2000). "Heterokromatinprotein 1 binder till nukleosomer och DNA in vitro" . Journal of Biological Chemistry . 275 (36): 28332–8. doi : 10.1074/jbc.M003493200 . PMID 10882726 .
•    Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (mars 2001). "Metylering av histon H3 lysin 9 skapar ett bindningsställe för HP1-proteiner". Naturen . 410 (6824): 116–20. doi : 10.1038/35065132 . PMID 11242053 . S2CID 4331863 .
•    Bannister AJ, Zegerman P, Partridge JF, Miska EA, Thomas JO, Allshire RC, Kouzarides T (mars 2001). "Selektiv igenkänning av metylerat lysin 9 på histon H3 av HP1-kromodomänen". Naturen . 410 (6824): 120–4. doi : 10.1038/35065138 . PMID 11242054 . S2CID 4334447 .
•   Nielsen AL, Oulad-Abdelghani M, Ortiz JA, Remboutsika E, Chambon P, Losson R (apr 2001). "Heterokromatinbildning i däggdjursceller: interaktion mellan histoner och HP1-proteiner" . Molekylär cell . 7 (4): 729–39. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00218-0 . PMID 11336697 .
•    Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (Jan 2002). "Riktad proteomisk analys av den mänskliga nukleolen" . Aktuell biologi . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
•    Scholzen T, Endl E, Wohlenberg C, van der Sar S, Cowell IG, Gerdes J, Singh PB (feb 2002). "Ki-67-proteinet interagerar med medlemmar av familjen heterochromatin protein 1 (HP1): en potentiell roll i regleringen av högre ordningens kromatinstruktur". The Journal of Pathology . 196 (2): 135–44. doi : 10.1002/path.1016 . PMID 11793364 . S2CID 36130549 .
•    Nielsen PR, Nietlispach D, Mott HR, Callaghan J, Bannister A, Kouzarides T, Murzin AG, Murzina NV, Laue ED (mars 2002). "Struktur av HP1-kromodomänen bunden till histon H3 metylerad vid lysin 9". Naturen . 416 (6876): 103–7. Bibcode : 2002Natur.416..103N . doi : 10.1038/nature722 . PMID 11882902 . S2CID 4423019 .
•    Vassallo MF, Tanese N (april 2002). "Isoform-specifik interaktion av HP1 med human TAFII130" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (9): 5919–24. Bibcode : 2002PNAS...99.5919V . doi : 10.1073/pnas.092025499 . PMC 122877 . PMID 11959914 .
•   Hwang KK, Worman HJ (maj 2002). "Genreglering av mänskliga ortologer av Drosophila heterochromatin protein 1". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 293 (4): 1217–22. doi : 10.1016/S0006-291X(02)00377-7 . PMID 12054505 .
•    Bhattacharya N, Wang Z, Davitt C, McKenzie IF, Xing PX, Magnuson NS (juli 2002). "Pim-1 associerar med proteinkomplex som är nödvändiga för mitos". Kromosom . 111 (2): 80–95. doi : 10.1007/s00412-002-0192-6 . PMID 12111331 . S2CID 26016943 .
•    Lin CY, Li CC, Huang PH, Lee FJ (dec 2002). "Ett utvecklingsreglerat ARF-liknande 5-protein (ARL5), lokaliserat till kärnor och nukleoler, interagerar med heterokromatinprotein 1" . Journal of Cell Science . 115 (Pt 23): 4433–45. doi : 10.1242/jcs.00123 . PMID 12414990 . S2CID 16851984 .
•    Festenstein R, Pagakis SN, Hiragami K, Lyon D, Verreault A, Sekkali B, Kioussis D (januari 2003). "Modulation av heterochromatin protein 1 dynamik i primära däggdjursceller". Vetenskap . 299 (5607): 719–21. Bibcode : 2003Sci...299..719F . doi : 10.1126/science.1078694 . PMID 12560554 . S2CID 26661977 .

externa länkar

• CBX1+protein,+human vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
• Humant CBX1- genomplacering och CBX1- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .