Nukleära hepatocytfaktorer

Nukleära hepatocytfaktorer ( HNF ) är en grupp av fylogenetiskt orelaterade transkriptionsfaktorer som reglerar transkriptionen av en mångfaldig grupp gener till proteiner . Dessa proteiner inkluderar blodkoaguleringsfaktorer och dessutom enzymer och transportörer som är involverade i transport och metabolism av glukos , kolesterol och fettsyror .

Fungera

Som namnet antyder uttrycks nukleära hepatocytfaktorer huvudsakligen i levern . Men HNF uttrycks också och spelar viktiga roller i ett antal andra vävnader så att namnet hepatocytkärnfaktor är något missvisande. Ändå är levern den enda vävnaden där ett betydande antal olika HNF uttrycks samtidigt. Dessutom finns det ett antal gener som innehåller flera promotor- och förstärkarregioner som var och en regleras av en annan HNF. Dessutom kräver ett effektivt uttryck av dessa gener synergistisk aktivering av flera HNF. Följaktligen fungerar nukleära hepatocytfaktorer för att säkerställa leverspecifikt uttryck av vissa gener.

Som är fallet med många transkriptionsfaktorer reglerar HNF uttrycket av en mängd olika målgener och fungerar därför. Dessa funktioner (och speciellt funktioner som involverar levern) inkluderar utveckling och metabolisk homeostas av organismen. Till exempel påverkar HNF uttryck av insulingenen såväl som gener involverade i glukostransport och metabolism. I embryoutveckling tros HNF4α ha en viktig roll i utvecklingen av levern , njurarna och tarmarna .

Sjukdomsimplikation

Varianter av generna kan orsaka flera relativt sällsynta former av MODY , en ärftlig, tidigt debuterande form av diabetes. Mutationer i HNF4a , HNF1a eller HNF1β är kopplade till MODY 1 , MODY 3 respektive MODY 5 . Mutationer i HNF-gener är också associerade med ett antal andra sjukdomar inklusive leveradenom och njurcystor .

Medlemmar

Följande är en lista över mänskliga hepatocytkärnfaktorer (se även rutor till höger för ytterligare information om dessa proteiner):

HNF1

Medlemmar av HNF1-underfamiljen innehåller en POU-homeodomän och binder till DNA som homodimerer.

• HNF1α /TCF1/MODY3 (relaterad sjukdom: MODY 3 )
• HNF1β /TCF2/MODY5 (relaterad sjukdom: MODY 5 )

hepatocyt nukleär faktor 1, alfa Struktur av hepatocyt nukleär faktor 1A (grön tecknad serie) bunden till DNA (magenta) baserat på de kristallografiska koordinaterna . Identifierare Symbol HNF1A Alt. symboler MODY3, HNF1, LFB1, TCF1 NCBI-genen 6927 HGNC 11621 OMIM 142410 PDB 1JB6 RefSeq NM_000545 UniProt P20823 Övriga uppgifter Ställe Chr. 12 q24.3-12q24.3 Söka efter Strukturer Schweizisk modell Domäner InterPro

hepatocyt nukleär faktor 1, beta- identifierare Symbol TCF2 Alt. symboler HNF1beta, LFB3 MODY5, VHNF1 NCBI-genen 6928 HGNC 11630 OMIM 189907 PDB 2H8R RefSeq NM_000458 UniProt P35680 Övriga uppgifter Ställe Chr. 17 q12-17q12 Söka efter Strukturer Schweizisk modell Domäner InterPro

HNF3

HNF3-underfamiljens medlemmar innehåller en bevingad helix-DNA-bindande domän och binder till DNA som monomerer.

• HNF3α/ FOXA1 ( gaffellåda A1)
• HNF3β/ FOXA2 (gaffellåda A2)
• HNF3γ/ FOXA3 (gaffellåda A3)

hepatocyt nukleär faktor 3, alfa- identifierare Symbol FOXA1 Alt. symboler HNF3A NCBI-genen 3169 HGNC 5021 OMIM 602294 RefSeq NM_004496 UniProt P55317 Övriga uppgifter Ställe Chr. 14 q12-q13 Söka efter Strukturer Schweizisk modell Domäner InterPro

hepatocyt nukleär faktor 3, beta- identifierare Symbol FOXA2 Alt. symboler HNF3B NCBI-genen 3170 HGNC 5022 OMIM 600288 RefSeq NM_021784 UniProt Q9Y261 Övriga uppgifter Ställe Chr. 20 p1120p11 Söka efter Strukturer Schweizisk modell Domäner InterPro

hepatocyt nukleär faktor 3, gamma- identifierare Symbol FOXA3 Alt. symboler HNF3G NCBI-genen 3171 HGNC 5023 OMIM 602295 RefSeq NM_004497 UniProt P55318 Övriga uppgifter Ställe Chr. 19 q13.2-q13.4 Söka efter Strukturer Schweizisk modell Domäner InterPro

HNF4

Medlemmar av HNF4-underfamiljen är nukleära receptorer och binder till DNA antingen som homodimerer eller RXR -heterodimerer.

• HNF4a /TCF14/ MODY1
• HNF4y

hepatocyt nukleär faktor 4 alfa- identifierare Symbol HNF4A Alt. symboler MODY, MODY1, NR2A1, TCF14 NCBI-genen 3172 HGNC 5024 OMIM 600281 PDB 1M7W RefSeq NM_001030004 UniProt P41235 Övriga uppgifter Ställe Chr. 20 q12-20q13.1 Söka efter Strukturer Schweizisk modell Domäner InterPro

hepatocyt nukleär faktor 4 gamma- identifierare Symbol HNF4G Alt. symboler NR2A2 NCBI-genen 3174 HGNC 5026 OMIM 605966 PDB 1LV2 RefSeq NM_004133 UniProt Q14541 Övriga uppgifter Ställe Chr. 8 q21-q22 Söka efter Strukturer Schweizisk modell Domäner InterPro

HNF6

HNF6-underfamiljemedlemmarna innehåller en cut-homeodomän ( ONECUT ) som binder till DNA som monomerer.

• HNF6α/OC-1/ ONECUT1 ( ONECUT1 )
• HNF6β/OC-2/ONECUT2 ( ONECUT2 )

hepatocyt nukleär faktor 6, alfa- identifierare Symbol ONECUT1 Alt. symboler HNF6, HNF6A NCBI-genen 3175 HGNC 8138 OMIM 604164 RefSeq NM_004498 UniProt Q9UBC0 Övriga uppgifter Ställe Chr. 15 q21-q21.2 Söka efter Strukturer Schweizisk modell Domäner InterPro

hepatocyt nukleär faktor 6, beta- identifierare Symbol ONECUT2 Alt. symboler HNF6B, OC-2 NCBI-genen 9480 HGNC 8139 OMIM 604894 RefSeq NM_004852 UniProt O95948 Övriga uppgifter Ställe Chr. 18 q21.1-21.2 Söka efter Strukturer Schweizisk modell Domäner InterPro

Se även

• HNF4
• Transkription (genetik)
• Mognadsdiabetes hos unga

Ytterligare bilder

• 

  Hepatocyt nukleär faktor 1A bunden till DNA [1]

• 

  Olika rendering av HNF1a bundet till DNA

externa länkar

• Hepatocyt+Nuclear+Factors vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
• Transkriptionsnätverk i levern
• transtyretinpromotor, ett exempel på en regulatorisk region som innehåller HNF-bindningsställen
• HNF4 i genetik av diabetes