Neurotransmittor natrium symporter
Natrium:neurotransmittor symporter familj | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifierare | |||||||||
Symbol | SNF | ||||||||
Pfam | PF00209 | ||||||||
InterPro | IPR000175 | ||||||||
PROSITE | PDOC00533 | ||||||||
SCOP2 | 2a65 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
TCDB | 2.A.22 | ||||||||
OPM superfamilj | 64 | ||||||||
OPM-protein | 2a65 | ||||||||
|
En neurotransmittornatriumsymporter ( NSS ) ( TC# 2.A.22 ) är en typ av signalsubstanstransportör som katalyserar upptaget av en mängd olika signalsubstanser, aminosyror, osmolyter och besläktade kvävehaltiga ämnen genom en löst:Na + -symportmekanism. NSS-familjen är en medlem av APC-superfamiljen . Dess beståndsdelar har hittats i bakterier, arkéer och eukaryoter.
Fungera
Transportsystem för neurotransmittorer ansvarar för frisättning, återupptag och återvinning av signalsubstanser vid synapser . Transportproteiner med hög affinitet som finns i plasmamembranet i presynaptiska nervterminaler och gliaceller är ansvariga för avlägsnandet, från det extracellulära utrymmet, av frigjorda transmittorer, och därigenom avslutar deras verkan.
Majoriteten av transportörerna utgör en omfattande familj av homologa proteiner som får energi från samtransporten av Na + och Cl − för att transportera signalsubstansmolekyler in i cellen mot deras koncentrationsgradient.
Neurotransmittornatriumsymportörer (NSS) är måltavlor för antidepressiva, psykostimulerande medel och andra droger.
Transportreaktion
Den generaliserade transportreaktionen för medlemmarna i denna familj är:
- löst ämne (ut) + Na + (ut) → löst ämne (in) + Na + (in).
Strukturera
Familjen har en gemensam struktur av 12 förmodade transmembranspiraler och inkluderar bärare för gamma-aminosmörsyra (GABA), noradrenalin/adrenalin, dopamin, serotonin, prolin, glycin, kolin, betain, taurin och andra små molekyler.
NSS-bärare skiljer sig strukturellt från den andra mer begränsade familjen av plasmamembrantransportörer, som är ansvariga för excitatorisk aminosyratransport (se TC# 2.A.23) . De senare kopplar glutamat- och aspartatupptag till samtransporten av Na + och mottransporten av K + , utan något uppenbart beroende av Cl - . Dessutom skiljer sig båda dessa transportörfamiljer från de vesikulära neurotransmittortransportörerna. Sekvensanalys av Na + /Cl − neurotransmittor-superfamiljen avslöjar att den kan delas in i fyra underfamiljer, dessa är transportörer för monoaminer, aminosyrorna prolin och glycin, GABA, och en grupp föräldralösa transportörer.
Tavoulari et al. (2011) beskrev omvandlingen av den Cl - oberoende prokaryota tryptofantransportören TnaT ( 2.A.22.4.1 ) till en fullt funktionell Cl - beroende form genom en enda punktmutation, D268S. Mutationer i TnaT-D268S, i vildtyps-TnaT och i en serotonintransportör ( SERT; 2.A.22.1.1 ) gav direkta bevis för involveringen av var och en av de föreslagna resterna i Cl - samordning. I både SERT och TnaT-D268S ökar Cl - och Na + varandras styrka, i överensstämmelse med am elektrostatisk interaktion genom intilliggande bindningsställen.
Kristallstrukturer
Det finns flera kristallstrukturer tillgängliga för ett par medlemmar i NSS-familjen:
- 2.A.22.1.7 - Dopamintransportör: , , , ,
- 2.A.22.4.2 - Aminosyran (leucin):2 Na+ symporter, LeuTAa: , , , , , , , ( mer )
Underfamiljer
Flera karakteriserade proteiner är klassificerade inom NSS-familjen och finns i Transporter Classification Database .
- Betaintransportör ( SLC6A12 ) InterPro : IPR002983
- Kreatintransportör ( SLC6A8 ) InterPro : IPR002984
- Dopamin neurotransmittertransportör ( SLC6A3 ) InterPro : IPR002436
- Berusad neurotransmittortransportör InterPro : IPR002944
- GABA neurotransmittortransportör GAT-1 ( SLC6A1 ) InterPro : IPR002980
- GABA neurotransmittertransportör GAT-2 ( SLC6A13 ) InterPro : IPR002981
- GABA neurotransmittortransportör GAT-3 ( SLC6A11 ) InterPro : IPR002982
- Glycin-neurotransmittortransportör, typ 1 ( SLC6A9 ) InterPro : IPR003028
- Noradrenalin neurotransmittertransportör ( SLC6A2 ) InterPro : IPR002435
- Orphan neurotransmitter transporter ( SLC6A15 ) InterPro : IPR002438
- Serotonin (5-HT) neurotransmittortransportör, N-terminal ( SLC6A4 ) InterPro : IPR013086
- Taurintransportör ( SLC6A6 ) InterPro : IPR002434
Humana proteiner som innehåller denna domän
SLC6A1 , SLC6A2 . , SLC6A19 , SLC6A20 _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _
Se även
externa länkar
- Transporter Classification Database (tcdb.org) för mer detaljerad beskrivning av denna familj