Molekylär patologisk epidemiologi

Molekulär patologisk epidemiologi ( MPE , även molekylär patologisk epidemiologi ) är en disciplin som kombinerar epidemiologi och patologi . Det definieras som "epidemiologi av molekylär patologi och heterogenitet av sjukdomar". Patologi och epidemiologi har samma mål att belysa etiologi , och MPE strävar efter att uppnå detta mål på molekylär, individ- och populationsnivå. MPE använder vanligtvis vävnadspatologiska resurser och data inom befintliga epidemiologiska studier. Molekylär epidemiologi omfattar i stort sett MPE och molekylär epidemiologi av konventionell typ med användning av traditionella sjukdomsbeteckningssystem.

Sjukdomsprocess

Data från The Cancer Genome Atlas- projekt indikerar att sjukdomsutveckling är en naturligt heterogen process. Varje patient har en unik sjukdomsprocess ("den unika sjukdomsprincipen"), med tanke på exposomens unika karaktär och dess unika inverkan på den molekylära patologiska processen. Detta koncept har antagits inom klinisk medicin tillsammans med precisionsmedicin och personlig medicin .

Metodik

I MPE, utredare dissekera inbördes samband mellan exponeringar (t.ex. miljö, kost, livsstil och genetiska faktorer); förändringar i cellulära eller extracellulära molekyler (sjukdomsmolekylära signaturer); och sjukdomsutveckling och progression. Utredare kan analysera genom , metylom , epigenom , metabolom , transkriptom , proteom , mikrobiom , immunitet och interaktom . En förmodad riskfaktor kan kopplas till specifika molekylära signaturer.

MPE-forskning möjliggör identifiering av en ny biomarkör för potentiell klinisk användbarhet, med hjälp av storskalig populationsbaserad data (t.ex. PIK3CA - mutation i kolorektal cancer för att välja patienter för aspirinbehandling ). MPE-metoden kan användas efter en genomomfattande associationsstudie (GWAS), benämnd "GWAS-MPE-tillvägagångssätt". Detaljerad fenotypning av sjukdomens slutpunkt kan utföras med hjälp av molekylär patologi eller surrogathistopatologi eller immunhistokemianalys av sjuka vävnader och celler inom GWAS.

Som ett alternativt tillvägagångssätt kan potentiella riskvarianter identifierade av GWAS undersökas i kombination med molekylär patologianalys på sjuka vävnader. Denna GWAS-MPE-metod kan ge inte bara mer exakta effektuppskattningar, ännu större effekter, för specifika molekylära subtyper av sjukdomen, utan också insikter i patogenes genom att koppla genetiska varianter till molekylära patologiska signaturer av sjukdomen. Eftersom molekylär diagnostik håller på att bli rutinmässig klinisk praxis, kan molekylär patologidata hjälpa epidemiologisk forskning.

Historia

MPE började som analys av riskfaktorer (t.ex. rökning) och molekylära patologiska fynd (t.ex. KRAS G12C onkogenmutationer i lungkarcinom).

Studier för att undersöka sambandet mellan en exponering och molekylära patologiska signaturer av sjukdom (särskilt cancer) blev allt vanligare under 1990-talet och början av 2000-talet.

Användningen av molekylär patologi inom epidemiologi saknade standardiserade metoder och riktlinjer samt tvärvetenskapliga experter och utbildningsprogram. MPE-forskning krävde ett nytt konceptuellt ramverk och metoder ( epidemiologisk metod ) eftersom MPE undersöker heterogenitet i en utfallsvariabel .

Termen "molekylär patologisk epidemiologi" användes av Shuji Ogino och Meir Stampfer 2010. Specifika principer för MPE utvecklades efter 2010. MPE- paradigmet är i utbredd användning globalt, ] och har varit föremål för internationella konferenser International Molecular Pathological Epidemiology (MPE) Meeting Series, som etablerades 2013, har varit öppen för forskarvärlden runt om i världen, och fem möten hölls fram till 2021.

Se även

• Kausal slutledning
• Epidemiologisk metod
• Epidemiologi
• Evidensbaserad medicin
• Molekylär diagnostik
• Molekylär epidemiologi
• Molekylär medicin
• Molekylär patologi
• Patogenes
• Patologi
• Personlig medicin
• Precisionsmedicin
• Folkhälsan
• Systembiologi

Vidare läsning

•    Gao C (2016). "Molekylär patologisk epidemiologi vid diabetes mellitus och risk för hepatocellulärt karcinom" . World Journal of Hepatology . 8 (27): 1119–1127. doi : 10.4254/wjh.v8.i27.1119 . PMC 5037325 . PMID 27721917 .
•    Rescigno T, Micolucci L, Tecce MF, Capasso A (2017). "Bioaktiva näringsämnen och nutrigenomics i åldersrelaterade sjukdomar" . Molekyler (Basel, Schweiz) . 22 (1): 105. doi : 10,3390/molecules22010105 . PMC 6155887 . PMID 28075340 .
•   Patil H, Saxena SG, Barrow CJ, Kanwar JR, Kapat A, Kanwar RK (2017). "Jakta den personliga medicindrömmen genom biomarkörvalidering vid kolorektal cancer". Drug Discovery Today . 22 (1): 111–119. doi : 10.1016/j.drudis.2016.09.022 . PMID 27693431 .