mir-199 mikroRNA-prekursor
| mir-199 mikroRNA-prekursor | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av mir-199-
| |
| identifierare | |
| Symbol | mir-199 |
| Rfam | RF00144 |
| miRBase | MI0000242 |
| miRBase familj | MIPF0000040 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; miRNA |
| Domän(er) | Eukaryota |
| GÅ | GO:0035195 GO:0035068 |
| SÅ | SO:0001244 |
| PDB- strukturer | PDBe |
MiR -199 mikroRNA-prekursorn är en kort icke-kodande RNA- gen involverad i genreglering . miR-199-gener har nu förutspåtts eller experimentellt bekräftats i mus , människa och ytterligare 21 andra arter. mikroRNA transkriberas som ~70 nukleotidprekursorer och bearbetas därefter av Dicer -enzymet för att ge en ~22 nukleotidprodukt. De mogna produkterna tros ha reglerande roller genom komplementaritet till mRNA .
Ursprung och utveckling av miR-199
miR-199 har visat sig vara en ryggradsspecifik miR-familj som uppstår vid ursprunget till ryggradsdjurslinjen Tre paraloger av miR-199 kan vanligtvis hittas hos icke-teleost-ryggradsdjursarter och 4 till 5 kopior hos teleost-arter. Alla miR-199-gener är belägna på motsatt sträng av ortologt intron av Dynamin -gener. Inom Dynamin3- genen ( Dnm3 ) är miR-199 associerad med miR-214 och båda miR transkriberas tillsammans som ett gemensamt primärt transkript, demonstrerat i mus, människa och zebrafisk.
Mål och uttryck för miR-199
miR-199 har visat sig vara inblandad i en mängd olika cellulära och utvecklingsmekanismer såsom olika cancerutveckling och progression, kardiomyocytskydd eller skelettbildning.
Med hjälp av mikroarray- och immunoblotting-analyser har det visat sig att miR-199a* riktar sig mot Met -proto-onkogenen.
MicroRNA hsa-miR-199a är en regulator av IκB kinas-β (IKKβ) uttryck.
Med hjälp av TaqMan kvantitativa PCR-arraymetoder i realtid har miRNA-uttryck profilerats. miR-199a, en av de mest signifikant överuttryckta i invasiva skivepitelcancer (ISCC), utvärderades genom att transfektera livmoderhalscancerceller (SiHa och ME-180) med anti-miR-199a-oligonukleotider och cellviabiliteten utvärderades. mirR-199a*, mir199a och mirR-199b överuttrycktes signifikant i ISCC.
Implikation av miR-199 i skelettogenes
miR-199, tillsammans med sin klusterkompis MiR-214 , har visat sig vara inblandad i skelettbildning. Hos möss uttrycks miR-199 i perichondrial celler, periartikulära kondrocyter, trakealbrosk, lemmesenkym och de flesta vävnader i över- och underkäken. Hos zebrafisk uttrycks miR-199 i den utvecklande notokorden och i alla vävnader som omger utvecklande skelettelement. Jämförande miRNA-array ledde till isoleringen av flera benmorfogena protein 2 (BMP2)-responsiva miRNA. Bland dem är miR-199a* av särskilt intresse, eftersom det rapporterades vara specifikt uttryckt i skelettsystemet och visade sig hämma kondrogenes genom nedreglering av Smad1, en viktig regulator av ben- och broskbildning och utveckling. Twist-1 , som är en viktig aktör i skelettbildning, reglerar också miR-199 och miR-214 klusteruttryck hos mus. Vidare leder miR199-214-klusterdeletion hos mus till skelettutvecklingsavvikelser inklusive kraniofaciala defekter, missbildningar i neurala båge och ryggradsprocesser och osteopeni.
Klinisk relevans av miR-199
Alkoholisk leversjukdom är en vanlig medicinsk konsekvens av långvarigt överdrivet alkoholbruk. Aktivering av hypoxi-inducerbar faktor-1α (HIF-1α) är en indikator på hypoxi . Endotelin-1 (ET-1) är ett protein som drar ihop blodkärlen och höjer blodtrycket. Det har visats att etanol-inducerad miR-199 nedreglering kan bidra till förstärkt HIF-1α och ET-1 uttryck.
Vidare läsning
- Kalscheuer S, Zhang X, Zeng Y, Upadhyaya P (december 2008). "Differentiellt uttryck av mikroRNA i neoplastisk transformation i tidigt skede i lungorna hos F344-råttor kroniskt behandlade med tobakscarcinogenet 4-(metylnitrosamino)-1-(3-pyridyl)-1-butanon" . Carcinogenes . 29 (12): 2394–9. doi : 10.1093/carcin/bgn209 . PMC 2722864 . PMID 18780894 .
- Shen Q, Cicinnati VR, Zhang X, Iacob S, Weber F, Sotiropoulos GC, Radtke A, Lu M, Paul A, Gerken G, Beckebaum S (augusti 2010). "Roll av microRNA-199a-5p och discoidin domänreceptor 1 i human hepatocellulär karcinominvasion" . Molekylär cancer . 9 : 227. doi : 10.1186/1476-4598-9-227 . PMC 2939569 . PMID 20799954 .
- Zhang GL, Li YX, Zheng SQ, Liu M, Li X, Tang H (november 2010). "Undertryckning av hepatit B-virusreplikation genom microRNA-199a-3p och microRNA-210". Antiviral forskning . 88 (2): 169–75. doi : 10.1016/j.antiviral.2010.08.008 . PMID 20728471 .
- Fornari F, Milazzo M, Chieco P, Negrini M, Calin GA, Grazi GL, Pollutri D, Croce CM, Bolondi L, Gramantieri L (juni 2010). "MiR-199a-3p reglerar mTOR och c-Met för att påverka doxorubicinkänsligheten hos humana hepatokarcinomceller" . Cancerforskning . 70 (12): 5184–93. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-10-0145 . PMID 20501828 .