miR-338
| miR-338 | |
|---|---|
 Konserverad sekundär struktur av miR-338 mikroRNA-
| |
| prekursoridentifierare | |
| Symbol | miR-338 |
| Alt. Symboler | MIR338 |
| Rfam | RF00686 |
| miRBase | MI0000814 |
| miRBase familj | MIPF0000097 |
| NCBI-gen | 442906 |
| HGNC | 31775 |
| OMIM | 614059 |
| RefSeq | NR_029897 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | miRNA |
| Domän(er) | Mammalia |
| GÅ | 0035195 |
| SÅ | 0001244 |
| Ställe | Chr. 17 q25.3 |
| PDB- strukturer | PDBe |
miR-338 är en familj av hjärnspecifika mikroRNA- prekursorer som finns i däggdjur , inklusive människor . Den ~22 nukleotider mogna miRNA-sekvensen skärs ut från prekursorhårnålen av enzymet Dicer . Denna sekvens associeras sedan med RISC som påverkar RNA-interferens .
miR-338 är belägen i en intronisk region inom genen för apoptos-associerat tyrosinkinas ( AATK ). Det har förutspåtts att det kan nedreglera gener som har en nedströms negativ effekt på AATK-uttryck.
Fungera
miR-338 är ett hjärnspecifikt miRNA som reglerar uttrycket av cytokrom c-oxidas IV (COX4). Den mogna miR-338 miRNA-sekvensen är komplementär till en kort sektion av den 3'-otranslaterade regionen av COX4- mRNA . Denna mRNA-sekvens presenteras ovanpå en stam-loop -struktur, vilket indikerar att den är tillgänglig för miRNA-bearbetning.
Ansökningar
miR-338 är dysreglerad i neuroblastom och kan potentiellt implementeras som en biomarkör eller framtida terapeutiskt medel. miR-338 har också kopplats till hepatocellulärt karcinom , och ett storskaligt diagnostiskt test har föreslagits som involverar mätning av uttryck av miR-338 i vävnadsprover. Dessutom är miR-338 en av sju mikroRNA vars uttrycksprofiler kan kombineras för att ge en förutsägelse av sannolikheten för överlevnad för en patient med magcancer .
Vidare läsning
- He QY, Peng GP, Liu WX, Luo BY (november 2010). "[Interaktion av microRNA-338 och dess potentiella målprotein eiF4E3]". Zhejiang da Xue Xue Bao. Yi Xue Ban = Journal of Zhejiang University. Medicinska vetenskaper . 39 (6): 583–8. doi : 10.3785/j.issn.1008-9292.2010.06.006 . PMID 21166051 . (kinesiska)
- Saba R, Goodman CD, Huzarewich RL, Robertson C, Booth SA (2008). Akbarian S (red.). "En miRNA-signatur av prioninducerad neurodegeneration" . PLOS ETT . 3 (11): e3652. Bibcode : 2008PLoSO...3.3652S . doi : 10.1371/journal.pone.0003652 . PMC 2575400 . PMID 18987751 .
externa länkar