mir-7 mikroRNA-prekursor

mir-7 mikroRNA-prekursor
Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av mir-7-
identifierare
Symbol	mir-7
Rfam	RF00053
miRBase	MI0000263
miRBase familj	MIPF0000022
Övriga uppgifter
RNA -typ	Gen ; miRNA
Domän(er)	Eukaryota
GÅ	GO:0035195 GO:0035068
SÅ	SO:0001244
PDB- strukturer	PDBe

Denna familj representerar mikroRNA (miRNA) prekursorn mir-7. Detta miRNA har förutspåtts eller experimentellt bekräftats i ett brett spektrum av arter. miRNA transkriberas som ~70 nukleotidprekursorer (modellerad här) och bearbetas därefter av Dicer -enzymet för att ge en ~22 nukleotidprodukt. I detta fall kommer den mogna sekvensen från 5'- armen av prekursorn. Omfattningen av hårnålsprekursorerna är inte allmänt kända och uppskattas baserat på hårnålsförutsägelser. Dicers inblandning i miRNA-bearbetning tyder på ett samband med fenomenet RNA-interferens.

Moget miRNA-7 härrör från tre mikroRNA-prekursorer i det mänskliga genomet, miR-7-1, miR-7-2 och miR-7-3. miRNA numreras baserat på sekvensen för det mogna RNA:t.

miR-7 regleras direkt av transkriptionsfaktorn HoxD10.

miRNA tros ha reglerande roller genom komplementaritet till mRNA. miR-7 är avgörande för att upprätthålla regulatorisk stabilitet under förhållanden med miljöflöde. Det spelar en viktig roll för att kontrollera mRNA-uttryck. miR-7-genen finns i de flesta sekvenserade Urbilateria- arter, och sekvensen av dess mogna miRNA-produkt är perfekt konserverad från annelider till människor, vilket indikerar en stark funktionell bevarande.

Mål för miR-7

Bioinformatiska förutsägelser tyder på att den humana EGFR-mRNA 3'-otranslaterade regionen innehåller tre mikroRNA-7 (miR-7) målställen, som inte är konserverade över däggdjur. I Drosophila fotoreceptorceller kontrollerar miR-7 signalering av epidermal tillväxtfaktorreceptor (EGFR) och främjar differentiering av fotoreceptorer. Bland andra mål för miR-7 är insulinliknande tillväxtfaktor 1-receptor (IGF1R) och PIK3CD, E(spl)-genfamiljen och Pak1 (cancerceller). c-Fos är också ett mål för miR-7b hos möss. Pax6 -translation i den laterala väggen av den subventrikulära zonen hos utvecklade möss regleras post-transkriptionellt av miRNA-7a-medierad gentystnad, vilket är nödvändigt för att kontrollera hastigheten för produktion av dopaminerga neuroner i luktbulben.

Klinisk relevans

Flera roller och mål för miR-7 såväl som dess uttrycksmönster var kopplade till regleringsmekanismer och patogenes vid glioblastom , bröstcancer och andra typer av cancer, såväl som vid schizofreni och synavvikelser. Hämning av motiliteten, invasiviteten, förankringsoberoende tillväxt och tumörframkallande potential hos mycket invasiva bröstcancerceller genom införandet av miR-7 antyder en stark terapeutisk potential för miR-7.

Vidare läsning

•    Lagos-Quintana M, Rauhut R, Lendeckel W, Tuschl T (oktober 2001). "Identifiering av nya gener som kodar för små uttryckta RNA". Vetenskap . 294 (5543): 853–8. Bibcode : 2001Sci...294..853L . doi : 10.1126/science.1064921 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F65F-2 . PMID 11679670 . S2CID 18101169 .
•   Ambros V (december 2001). "mikroRNA: små regulatorer med stor potential" . Cell . 107 (7): 823–6. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . PMID 11779458 .
•   Chen H, Shalom-Feuerstein R, Riley J, Zhang SD, Tucci P, Agostini M, Aberdam D, Knight RA, Genchi G, Nicotera P, Melino G, Vasa-Nicotera M (april 2010). "miR-7 och miR-214 uttrycks specifikt under neuroblastomdifferentiering, kortikal utveckling och embryonala stamcellersdifferentiering och kontrollerar neuritutväxt in vitro". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 394 (4): 921–7. doi : 10.1016/j.bbrc.2010.03.076 . PMID 20230785 .
•    Doxakis E (april 2010). "Post-transkriptionell reglering av alfa-synuklein uttryck av mir-7 och mir-153" . Journal of Biological Chemistry . 285 (17): 12726–34. doi : 10.1074/jbc.M109.086827 . PMC 2857101 . PMID 20106983 .
•   Pek JW, Lim AK, Kai T (september 2009). "Drosophila malström säkerställer korrekt differentiering av könscellers stamcellslinje genom att undertrycka mikroRNA-7" . Utvecklingscell . 17 (3): 417–24. doi : 10.1016/j.devcel.2009.07.017 . PMID 19758565 .
•    Junn E, Lee KW, Jeong BS, Chan TW, Im JY, Mouradian MM (augusti 2009). "Repression av alfa-synukleinuttryck och toxicitet av mikroRNA-7" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 106 (31): 13052–7. Bibcode : 2009PNAS..10613052J . doi : 10.1073/pnas.0906277106 . PMC 2722353 . PMID 19628698 .
•   Correa-Medina M, Bravo-Egana V, Rosero S, Ricordi C, Edlund H, Diez J, Pastori RL (april 2009). "MicroRNA miR-7 uttrycks företrädesvis i endokrina celler i den utvecklande och vuxna bukspottkörteln". Genuttrycksmönster . 9 (4): 193–9. doi : 10.1016/j.gep.2008.12.003 . PMID 19135553 .

externa länkar

• Sida för mir-7 mikroRNA-prekursor vid Rfam
• Purow, Benjamin (december 2008). "MIR7-1 (mikroRNA 7-1)" . Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Hematology .