mir-127
| mir-127 | |
|---|---|
 miR-127 mikroRNA sekundär struktur och sekvenskonservering
| |
| Identifierare | |
| Symbol | mir-127 |
| Rfam | RF00676 |
| miRBase familj | MIPF0000080 |
| NCBI-gen | 406914 |
| HGNC | 31509 |
| OMIM | 611709 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | mikroRNA |
| Domän(er) | Eukaryota ; |
| PDB- strukturer | PDBe |
mir-127 mikroRNA är en kort icke-kodande RNA- molekyl med intressant överlappande genstruktur. miR-127 fungerar för att reglera uttrycksnivåerna för gener involverade i lungutveckling, placentabildning och apoptos . Avvikande uttryck av miR-127 har kopplats till olika cancerformer.
Genstruktur
pri-miR-127 härrör från ett separat men överlappande konserverat genkluster som kodar för miR-433/127. miR-127 och miR-433 överlappas i en 5'-3' riktning. Även om loci kunde hittas på olika kromosomer i olika arter, har strukturen bevarats. Hos däggdjur inklusive människa, schimpans, häst, hund, apa, råtta, ko och mus multipla sekvensanpassningar (MSA) mellan miR-433 och miR127 visat 95-100 % likhet med ett bevarat avstånd mellan miR-433 och miR- 127 av 986 till 1007 bp. Dessutom har uppströmsresponselementen i miR-433/127-promotorerna, inklusive östrogenrelaterade receptorresponselement (ERRE) bevarats bland ovanstående arter. Data har antytt att de miR-433/127 loci kan ha utvecklats från en gemensam ursprungsgen.
Transkriptionsreglering
Transkriptionsfaktorbindningsställen placerade uppströms om miRNA-prekursor spelar en roll för att reglera transkription. Aktivering av miR-127 och miR-433-promotorer förmedlas av östrogenrelaterad receptor-gamma (ERRgamma, NR3B3), som fysiskt associerar med deras endogena promotorer. Hämning regleras av Small heterodimer partner (SHP), som verkar i trans. Även om miR-127 och miR-433 har gemensamma regulatoriska element, har de oberoende promotorer och deras differentiella uttrycksmönster observeras.
Funktionella roller
Nedreglering av den präglade genen Rtl1
Rtl1 är en nyckelgen i placentabildning och förlusten eller överuttrycket av Rlt1 har lett till sen foster eller neonatal dödlighet hos möss. miR-127 ligger nära CpG-öar i den präglade regionen som kodar för rtl1 och transkriberas normalt i en antisens-orientering till genen. Ektopiskt uttryck av miR-127 resulterade i en minskning av Rtl1-uttryck i Human Hela-cell och mus Heppa-1.
Experiment utförda på möss visade att Rtl1 endast transkriberades från den paternala kromosomen, medan den moderna allelen bröts ned. miR-127 och miR-136 uttrycks dock endast moderligt i de somatiska cellerna och spelar således en roll i antisense-reglering av Rtl1-avtryck. Avvikande metyleringsstatus för Rtl1 och miR-127 indikerade att epigenetisk programmering också är involverad i processen.
Kontroll av fostrets lungutveckling
miR-127 är starkt uttryckt i sent tillstånd av fosterutveckling. En störning av systemet genom att överuttrycka miR-127 i ett fosterlungorganodlingssystem resulterade i defekt utveckling som visades genom en minskning av terminala knoppar och varierande knoppstorlekar.
Roll i sjukdom
Diffust stort B-cellslymfom
Uppreglering av miR-127 orsakade en nedreglering av B-cellslymfom 6-protein , en proto-onkogen som vanligtvis är hypermuterad i diffust stort B-cellslymfom (DLCL) . Dessutom upptäcktes differentiellt uttryck av miR-127 i olika typer av DLCL. miR-127-nivåer var signifikant högre i testikel-DLCL jämfört med nodal- och centrala nervsystemet DLCL, vilket innebär olika biologiska enheter av DLCL på olika platser.
Hepatocellulärt karcinom
Hämning av miR-127-uttryck är kopplat till hepatocellulärt karcinom. Den mekanistiska länken bekräftades av en förändring i BCL6-protein, som riktas mot miR-127.
Se även
Vidare läsning
- Saito Y, Liang G, Egger G, Friedman JM, Chuang JC, Coetzee GA, Jones PA (2006). "Specifik aktivering av microRNA-127 med nedreglering av proto-onkogenen BCL6 genom kromatinmodifierande läkemedel i humana cancerceller" . Cancercell . 9 (6): 435–43. doi : 10.1016/j.ccr.2006.04.020 . PMID 16766263 .
- Cui XS, Zhang DX, Ko YG, Kim NH (2009). "Aberrant epigenetisk omprogrammering av imprinted microRNA-127 och Rtl1 i klonade musembryon". Biochem Biophys Res Commun . 379 (2): 390–4. doi : 10.1016/j.bbrc.2008.12.148 . PMID 19126398 .
- Zhang C, Wang C, Chen X, Yang C, Li K, Wang J, Dai J, Hu Z, Zhou X, Chen L, Zhang Y, Li Y, Qiu H, Xing J, Liang Z, Ren B, Yang C , Zen K, Zhang CY (december 2010). "Expressionsprofil av mikroRNA i serum: ett fingeravtryck för esofageal skivepitelcancer" . Clin. Chem . 56 (12): 1871–9. doi : 10.1373/clinchem.2010.147553 . PMID 20943850 .