mir-398 mikroRNA-prekursorfamilj

mir-398
Identifierare
Symbol	mir-398
Rfam	RF00695
miRBase familj	MIPF0000107
Övriga uppgifter
RNA -typ	mikroRNA
Domän(er)	Eukaryota ;
PDB- strukturer	PDBe

Inom molekylärbiologi är mir-398 mikroRNA en kort RNA- molekyl. MikroRNA fungerar för att reglera uttrycksnivåerna för andra gener genom flera mekanismer.

Se även

• MicroRNA

Vidare läsning

•    Mendoza-Soto AB, Sánchez F, Hernández G (2012). "MikroRNA som regulatorer i växtmetalltoxicitetssvar" . Frontiers in Plant Science . 3 : 105. doi : 10.3389/fpls.2012.00105 . PMC 3356851 . PMID 22661980 .
•    Burklew CE, Ashlock J, Winfrey WB, Zhang B (2012). Wu K (red.). "Effekter av nanopartiklar av aluminiumoxid på tillväxt, utveckling och mikroRNA-uttryck av tobak (Nicotiana tabacum)" . PLOS ETT . 7 (5): e34783. Bibcode : 2012PLoSO...734783B . doi : 10.1371/journal.pone.0034783 . PMC 3350507 . PMID 22606225 .
•    Zhang J, Zhang S, Han S, Wu T, Li X, Li W, Qi L (augusti 2012). "Genomomfattande identifiering av mikroRNA i lärk och scenspecifik modulering av 11 konserverade mikroRNA och deras mål under somatisk embryogenes". Planta . 236 (2): 647–57. doi : 10.1007/s00425-012-1643-9 . PMID 22526500 . S2CID 6776890 .
•    Jung JH, Seo PJ, Ahn JH, Park CM (maj 2012). "Arabidopsis RNA-bindande protein FCA reglerar microRNA172-bearbetning i termosensorisk blomning" . Journal of Biological Chemistry . 287 (19): 16007–16. doi : 10.1074/jbc.M111.337485 . PMC 3346135 . PMID 22431732 .
•   Ren L, Tang G (maj 2012). "Identifiering av sackaros-responsiva mikroRNA avslöjar sackaros-reglerade kopparansamlingar på ett SPL7-beroende och oberoende sätt i Arabidopsis thaliana". Växtvetenskap . 187 : 59–68. doi : 10.1016/j.plantsci.2012.01.014 . PMID 22404833 .
•   Sunkar R, Li YF, Jagadeeswaran G (april 2012). "Funktioner av mikroRNA i växtstresssvar". Trender inom växtvetenskap . 17 (4): 196–203. doi : 10.1016/j.tplants.2012.01.010 . PMID 22365280 .
•    Guleria P, Yadav SK (december 2011). "Identifiering av miR414 och uttrycksanalys av konserverade miRNA från Stevia rebaudiana" . Genomik, proteomik och bioinformatik . 9 (6): 211–7. doi : 10.1016/S1672-0229(11)60024-7 . PMC 5054151 . PMID 22289477 .
•    Zhao M, Tai H, Sun S, Zhang F, Xu Y, Li WX (2012). Pfeffer S (red.). "Klonning och karakterisering av majs miRNA involverade i svar på kvävebrist" . PLOS ETT . 7 (1): e29669. Bibcode : 2012PLoSO...729669Z . doi : 10.1371/journal.pone.0029669 . PMC 3250470 . PMID 22235323 .
•   Monavar Feshani A, Mohammadi S, Frazier TP, Abbasi A, Abedini R, Karimi Farsad L, Ehya F, Salekdeh GH, Mardi M (februari 2012). "Identifiering och validering av Asteraceae miRNA genom den uttryckta sekvenstaggen analys". Gene . 493 (2): 253–9. doi : 10.1016/j.gene.2011.11.024 . PMID 22146318 .
•    Xu Z, Zhong S, Li X, Li W, Rothstein SJ, Zhang S, Bi Y, Xie C (2011). Moustafa A (red.). "Genomomfattande identifiering av mikroRNA som svar på låg nitrattillgänglighet i majsblad och rötter" . PLOS ETT . 6 (11): e28009. Bibcode : 2011PLoSO...628009X . doi : 10.1371/journal.pone.0028009 . PMC 3223196 . PMID 22132192 .
•   Lu S, Yang C, Chiang VL (november 2011). "Bevarande och mångfald av mikroRNA-associerade kopparreglerande nätverk i Populus trichocarpa". Journal of Integrative Plant Biology . 53 (11): 879–91. doi : 10.1111/j.1744-7909.2011.01080.x . PMID 22013976 .
•   Attallah CV, Welchen E, Martin AP, Spinelli SV, Bonnard G, Palatnik JF, Gonzalez DH (augusti 2011). "Växter innehåller två SCO-proteiner som är olika involverade i cytokrom c-oxidasfunktion och koppar- och redoxhomeostas" . Journal of Experimental Botany . 62 (12): 4281–94. doi : 10.1093/jxb/err138 . PMID 21543521 .
•   Zhu C, Ding Y, Liu H (september 2011). "MiR398 och växtstressreaktioner". Physiologia Plantarum . 143 (1): 1–9. doi : 10.1111/j.1399-3054.2011.01477.x . PMID 21496029 .
•    Kantar M, Lucas SJ, Budak H (mars 2011). "miRNA uttrycksmönster för Triticum dicoccoides som svar på chocktorkstress". Planta . 233 (3): 471–84. doi : 10.1007/s00425-010-1309-4 . PMID 21069383 . S2CID 27289636 .
•    Bouché N (juni 2010). "Nya insikter om miR398-funktioner i Arabidopsis" . Anläggningens signalering och beteende . 5 (6): 684–6. doi : 10.4161/psb.5.6.11573 . PMC 3001559 . PMID 20400846 .
•    Miura E, Kato Y, Sakamoto W (maj 2010). "Jämförande transkriptomanalys av grön/vit brokig sektor i Arabidopsis gul brokig2: svar på oxidativa och andra påfrestningar i vita sektorer" . Journal of Experimental Botany . 61 (9): 2433–45. doi : 10.1093/jxb/erq075 . PMC 2877895 . PMID 20400527 .
•    Jia X, Mendu V, Tang G (2010). "En arrayplattform för identifiering av stresskänsliga mikroRNA i växter". Växtstresstolerans . Metoder i molekylärbiologi. Vol. 639. s. 253–69. doi : 10.1007/978-1-60761-702-0_15 . ISBN 978-1-60761-701-3 . PMID 20387051 .
•   Li YF, Zheng Y, Addo-Quaye C, Zhang L, Saini A, Jagadeeswaran G, Axtell MJ, Zhang W, Sunkar R (juni 2010). "Transkriptomomfattande identifiering av mikroRNA-mål i ris". Planttidningen . 62 (5): 742–59. doi : 10.1111/j.1365-313X.2010.04187.x . PMID 20202174 .
•   Ding YF, Wang GY, Fu YP, Zhu C (februari 2010). "[MiR398:s roll i växtstressreaktioner]". Yi Chuan = Hereditas . 32 (2): 129–34. doi : 10.3724/sp.j.1005.2010.00129 . PMID 20176556 .
•   Beauclair L, Yu A, Bouché N (maj 2010). "mikroRNA-riktad klyvning och translationell repression av kopparchaperonen för superoxiddismutas-mRNA i Arabidopsis" ( PDF) . Planttidningen . 62 (3): 454–62. doi : 10.1111/j.1365-313X.2010.04162.x . PMID 20128885 .
•    Lee H, Yoo SJ, Lee JH, Kim W, Yoo SK, Fitzgerald H, Carrington JC, Ahn JH (maj 2010). "Genetisk ram för reglering av blomningstid genom omgivningstemperaturkänsliga miRNA i Arabidopsis" . Nukleinsyraforskning . 38 (9): 3081-93. doi : 10.1093/nar/gkp1240 . PMC 2875011 . PMID 20110261 .
•   Gu M, Xu K, Chen A, Zhu Y, Tang G, Xu G (februari 2010). "Expressionsanalys tyder på potentiella roller för mikroRNA för fosfat- och arbuskulär mykorrhiza-signalering i Solanum lycopersicum". Physiologia Plantarum . 138 (2): 226–37. doi : 10.1111/j.1399-3054.2009.01320.x . PMID 20015123 .
•    Trindade I, Capitão C, Dalmay T, Fevereiro MP, Santos DM (februari 2010). "miR398 och miR408 är uppreglerade som svar på vattenbrist i Medicago truncatula". Planta . 231 (3): 705–16. doi : 10.1007/s00425-009-1078-0 . PMID 20012085 . S2CID 12943657 .
•    Hsieh LC, Lin SI, Shih AC, Chen JW, Lin WY, Tseng CY, Li WH, Chiou TJ (december 2009). "Att avslöja små RNA-medierade svar på fosfatbrist i Arabidopsis genom djup sekvensering" . Växtfysiologi . 151 (4): 2120–32. doi : 10.1104/pp.109.147280 . PMC 2785986 . PMID 19854858 .
•    Jia X, Wang WX, Ren L, Chen QJ, Mendu V, Willcut B, Dinkins R, Tang X, Tang G (september 2009). "Differentiell och dynamisk reglering av miR398 som svar på ABA och saltstress i Populus tremula och Arabidopsis thaliana". Växtmolekylärbiologi . 71 (1–2): 51–9. doi : 10.1007/s11103-009-9508-8 . PMID 19533381 . S2CID 21096126 .
•   Ding YF, Zhu C (augusti 2009). "MikroRNAs roll i koppar- och kadmiumhomeostas". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 386 (1): 6–10. doi : 10.1016/j.bbrc.2009.05.137 . PMID 19501049 .
•    Siré C, Moreno AB, Garcia-Chapa M, López-Moya JJ, San Segundo B (mars 2009). "Daglig oscillation i ackumuleringen av Arabidopsis mikroRNA, miR167, miR168, miR171 och miR398". FEBS Bokstäver . 583 (6): 1039–44. doi : 10.1016/j.febslet.2009.02.024 . hdl : 10261/101742 . PMID 19236868 . S2CID 25968907 .
•    Jagadeeswaran G, Saini A, Sunkar R (mars 2009). "Biotisk och abiotisk stress nedreglerar miR398-uttrycket i Arabidopsis". Planta . 229 (4): 1009–14. doi : 10.1007/s00425-009-0889-3 . PMID 19148671 . S2CID 31993796 .
•    Yamasaki H, Hayashi M, Fukazawa M, Kobayashi Y, Shikanai T (januari 2009). "SQUAMOSA Promoter Binding Protein-Like7 är en central regulator för kopparhomeostas vid Arabidopsis" . Växtcellen . 21 (1): 347–61. doi : 10.1105/tpc.108.060137 . PMC 2648088 . PMID 19122104 .
•   Hewezi T, Howe P, Maier TR, Baum TJ (december 2008). "Arabidopsis små RNA och deras mål under cystnematodparasitism" . Molekylära växt-mikrobinteraktioner . 21 (12): 1622–34. doi : 10.1094/MPMI-21-12-1622 . PMID 18986258 .
•    Abdel-Ghany SE, Pilon M (juni 2008). "MicroRNA-medierad systemisk nedreglering av kopparproteinuttryck som svar på låg koppartillgänglighet i Arabidopsis" . Journal of Biological Chemistry . 283 (23): 15932–45. doi : 10.1074/jbc.M801406200 . PMC 3259626 . PMID 18408011 .
•    Dugas DV, Bartel B (juli 2008). "Sackarosinduktion av Arabidopsis miR398 undertrycker två Cu/Zn-superoxiddismutaser". Växtmolekylärbiologi . 67 (4): 403–17. doi : 10.1007/s11103-008-9329-1 . PMID 18392778 . S2CID 22984450 .
•    Yamasaki H, Pilon M, Shikanai T (april 2008). "Hur reagerar växter på kopparbrist?" . Anläggningens signalering och beteende . 3 (4): 231–2. doi : 10.4161/psb.3.4.5094 . PMC 2634185 . PMID 19704637 .
•   Buhtz A, Springer F, Chappell L, Baulcombe DC, Kehr J (mars 2008). "Identifiering och karakterisering av små RNA från floem av Brassica napus" . Planttidningen . 53 (5): 739–49. doi : 10.1111/j.1365-313X.2007.03368.x . PMID 18005229 .
•   Yamasaki H, Abdel-Ghany SE, Cohu CM, Kobayashi Y, Shikanai T, Pilon M (juni 2007). "Reglering av kopparhomeostas genom mikro-RNA i Arabidopsis" . Journal of Biological Chemistry . 282 (22): 16369–78. doi : 10.1074/jbc.M700138200 . PMID 17405879 .
•    Sunkar R, Kapoor A, Zhu JK (augusti 2006). "Posttranskriptionell induktion av två Cu/Zn-superoxiddismutasgener i Arabidopsis förmedlas av nedreglering av miR398 och är viktig för oxidativ stresstolerans" . Växtcellen . 18 (8): 2051–65. doi : 10.1105/tpc.106.041673 . PMC 1533975 . PMID 16861386 .

externa länkar

• Sida för mir-398 mikroRNA-prekursorfamiljen vid Rfam