mir-16 mikroRNA-prekursorfamilj

mir-16
RF00254.jpg
miR-16 mikroRNA sekundär struktur och sekvenskonservering.
Identifierare
Symbol mir-16
Rfam RF00254
miRBase familj MIPF0000006
HGNC 31545
OMIM 609704
Övriga uppgifter
RNA -typ mikroRNA
Domän(er) Eukaryota ;
PDB- strukturer PDBe

miR -16 mikroRNA-prekursorfamiljen är en grupp relaterade små icke-kodande RNA- gener som reglerar genuttryck . miR-16, miR-15, mir-195 och miR-497 är relaterade mikroRNA -prekursorsekvenser från mir-15- genfamiljen ( [1]) . Denna mikroRNA-familj verkar vara ryggradsspecifik och dess medlemmar har förutspåtts eller experimentellt validerats i ett brett spektrum av ryggradsdjursarter ( MIPF0000006 ).

Bakgrund

Den mänskliga miR-16- prekursorn upptäcktes genom detaljerad uttrycksprofil och karyotypanalyser av patienter av Calin och kollegor. Karyotypning av kromosomstrukturer från individer med B-cells kronisk lymfatisk leukemi (B-CLL) fann att mer än hälften har förändringar i 13q14-regionen. Borttagningar av denna väl karakteriserade 1 megabasregion av genomet observerades också i cirka 50 % av mantelcellslymfom , [ citat behövs ] upp till 40 % av multipelt myelom , [ citat behövs ] och 60 % av prostatacancer . Omfattande screeningar av regionen vid den tiden gav inte konsekventa bevis på involvering från någon av de kända generna vid den tiden. Genom att använda CD5+ B-lymfocyter , som är känd för att ackumuleras med B-KLL- progression, granskades den minimala regionen som förlorades från 13q14-regionen för regulatoriska element . Allmänt tillgängliga sekvensdatabaser användes för att identifiera ett genkluster som kodar för homologen till den mänskliga miR15 och miR16 från Caenorhabditis elegans .

Genmål

I den ursprungliga publikationen som identifierade verkan av miR15 och miR16 i utvecklingen av B-CLL, föreslog Calin och kollegor att miR16 kunde vara målen med ofullständig basparning för 14 gener. Ökade CD5+ B-lymfocyter i KLL tyder på att miR16 kan vara involverad i celldifferentiering . I djurmodeller verkar enkelsträngade mikroRNA-arter genom att binda till imperfekta mRNA- komplement , typiskt till 3' UTR , även om mål också har observerats i mRNA :ts kodande sekvens . Nedreglering av miR16 (liksom miR15 ) observerades i diffust storcelligt B-cellslymfom . miR16 har visat sig binda till ett nio baspar till en komplementär sekvens i 3' UTR -regionen av BCL2 , som är en anti- apoptotisk gen involverad i en evolutionärt konserverad väg i programmerad celldöd . I den nasofaryngeala karcinomcellinjen har miR-16 visats rikta in sig på 3' UTR för vaskulär endoteltillväxtfaktor (VEGF) och undertrycka uttrycket av VEGF, som är en viktig angiogen faktor.

Klinisk relevans

Förändrat uttryck av mikroRNA-16 har observerats i cancer , inklusive maligniteter i bröst , tjocktarm , hjärna , lunga , lymfsystem , äggstockar , bukspottkörtel , prostata och mage . Denna skillnad i uttrycksnivåer kan användas för att skilja mellan cancerösa och friska vävnader och för att fastställa klinisk prognos . Det faktum att patologi är förknippat med en annan uttrycksprofil har lett till förslaget att sjukdomsspecifika biomarkörer kan ge potentiella mål för riktad klinisk intervention . På senare tid finns det bevis för att effektiviteten av behandling med den monoklonala antikroppen cetuximab vid kolorektal cancer kan bedömas genom uttrycksmönstret för kolorektal cancer efter terapi .

miR-16 och miR-15a är klustrade inom en 0,5 kbp- region i kromosom 13 (13q14) hos människor, en kromosomregion som visat sig vara raderad eller nedreglerad i ungefär mer än hälften av B-KLL , den vanligaste formen av leukemi hos vuxna. Karcinogenes är en gradvis process som involverar flera genetiska mutationer , så varje patient med malignitet uppvisar en heterogen population av celler . Det faktum att mir-16 mikroRNA-förlust observeras i en stor del av cellerna indikerar att förändringen inträffade tidigt i cancerutvecklingen och ett mål för terapeutisk intervention.

Vidare läsning

externa länkar


  1. ^    Baudry A, Mouillet-Richard S, Schneider B, Launay JM, Kellermann O (2010). "miR-16 riktar sig mot serotonintransportören: en ny aspekt för adaptiva svar på antidepressiva medel". Vetenskap . 329 (5998): 1537–41. Bibcode : 2010Sci...329.1537B . doi : 10.1126/science.1193692 . PMID 20847275 . S2CID 7835219 .
  2. ^    Zhang X, Wan G, Mlotshwa S, Vance V, Berger FG, Chen H, Lu X (2010). "Onkogent Wip1-fosfatas hämmas av miR-16 i signalvägen för DNA-skada" . Cancer Res . 70 (18): 7176–86. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-10-0697 . PMC 2940956 . PMID 20668064 .
  3. ^    Maccani MA, Avissar-Whiting M, Banister CE, McGonnigal B, Padbury JF, Marsit CJ (2010). "Moderns cigarettrökning under graviditeten är förknippad med nedreglering av miR-16, miR-21 och miR-146a i moderkakan" . Epigenetik . 5 (7): 583–9. doi : 10.4161/epi.5.7.12762 . PMC 2974801 . PMID 20647767 .
  4. ^    Balakrishnan A, Stearns AT, Park PJ, Dreyfuss JM, Ashley SW, Rhoads DB, Tavakkolizadeh A (2010). "MicroRNA mir-16 är anti-proliferativ i enterocyter och uppvisar dygnsrytm i tarmkryptor" . Exp Cell Res . 316 (20): 3512–21. doi : 10.1016/j.yexcr.2010.07.007 . PMC 2976799 . PMID 20633552 .
  5. ^    Xu F, Zhang X, Lei Y, Liu X, Liu Z, Tong T, Wang W (2010). "Förlust av repression av HuR-översättning av miR-16 kan vara ansvarig för höjningen av HuR i humant bröstkarcinom". J Cell Biochem . 111 (3): 727–34. doi : 10.1002/jcb.22762 . PMID 20626035 . S2CID 19458784 .
  6. ^    Liu W, Liu C, Zhu J, Shu P, Yin B, Gong Y, Qiang B, Yuan J, Peng X (2010). "MicroRNA-16 riktar sig till amyloidprekursorprotein för att potentiellt modulera Alzheimers-associerad patogenes i SAMP8-möss". Neurobiol åldrande . 33 (3): 522–534. doi : 10.1016/j.neurobiolaging.2010.04.034 . PMID 20619502 . S2CID 12138856 .
  7. ^    Yang J, Cao Y, Sun J, Zhang Y (2009). "Curcumin minskar uttrycket av Bcl-2 genom att uppreglera miR-15a och miR-16 i MCF-7-celler". Med Oncol . 27 (4): 1114–8. doi : 10.1007/s12032-009-9344-3 . PMID 19908170 . S2CID 21826528 .
  8. ^    Bhattacharya R, Nicoloso M, Arvizo R, Wang E, Cortez A, Rossi S, Calin GA, Mukherjee P (2009). "MiR-15a och MiR-16 kontrollerar Bmi-1-uttryck i äggstockscancer" . Cancer Res . 69 (23): 9090–5. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-09-2552 . PMC 2859686 . PMID 19903841 .
  9. ^    Guo CJ, Pan Q, Jiang B, Chen GY, Li DG (2009). "Effekter av uppreglerat uttryck av mikroRNA-16 på biologiska egenskaper hos kulturaktiverade hepatiska stellatceller". Apoptos . 14 (11): 1331–40. doi : 10.1007/s10495-009-0401-3 . PMID 19784778 . S2CID 3229011 .
  10. ^    Hanlon K, Rudin CE, Harry LW (2009). Williams S (red.). "Undersöker målen för MIR-15a och MIR-16-1 hos patienter med kronisk lymfatisk leukemi (KLL)" . PLOS ETT . 4 (9): e7169. Bibcode : 2009PLoSO...4.7169H . doi : 10.1371/journal.pone.0007169 . PMC 2745703 . PMID 19779621 .
  11. ^    Takeshita F, Patrawala L, Osaki M, Takahashi RU, Yamamoto Y, Kosaka N, Kawamata M, Kelnar K, Bader AG, Brown D, Ochiya T (2010). "Systemisk leverans av syntetiskt mikroRNA-16 hämmar tillväxten av metastaserande prostatatumörer via nedreglering av flera cellcykelgener" . Mol Ther . 18 (1): 181–7. doi : 10.1038/mt.2009.207 . PMC 2839211 . PMID 19738602 .
  12. ^   Lerner M, Harada M, Lovén J, Castro J, Davis Z, Oscier D, Henriksson M, Sangfelt O, Grandér D, Corcoran MM (2009). "DLEU2, som ofta tas bort vid malignitet, fungerar som en kritisk värdgen för de cellcykelhämmande mikroRNA miR-15a och miR-16-1". Exp Cell Res . 315 (17): 2941–52. doi : 10.1016/j.yexcr.2009.07.001 . PMID 19591824 .
  13. ^   Bandi N, Zbinden S, Gugger M, Arnold M, Kocher V, Hasan L, Kappeler A, Brunner T, Vassella E (2009). "miR-15a och miR-16 är inblandade i cellcykelreglering på ett Rb-beroende sätt och deleteras eller nedregleras ofta i icke-småcellig lungcancer" . Cancer Res . 69 (13): 5553–9. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-08-4277 . PMID 19549910 .
  14. ^   Aqeilan RI, Calin GA, Croce CM (2010). "miR-15a och miR-16-1 i cancer: upptäckt, funktion och framtidsperspektiv" . Celldöd skiljer sig åt . 17 (2): 215–20. doi : 10.1038/cdd.2009.69 . PMID 19498445 .
  15. ^   Tsang WP, Kwok TT (2010). "Epigallocatechin gallate uppreglering av miR-16 och induktion av apoptos i mänskliga cancerceller". J Nutr Biochem . 21 (2): 140–6. doi : 10.1016/j.jnutbio.2008.12.003 . PMID 19269153 .
  16. ^   Kaddar T, Rouault JP, Chien WW, Chebel A, Gadoux M, Salles G, Ffrench M, Magaud JP (2009). "Två nya miR-16-mål: caprin-1 och HMGA1, proteiner inblandade i cellproliferation" . Biol Cell . 101 (9): 511–24. doi : 10.1042/BC20080213 . PMID 19250063 .
  17. ^   Guo CJ, Pan Q, Li DG, Sun H, Liu BW (2009). "miR-15b och miR-16 är inblandade i aktiveringen av råttleverstjärncellen: En viktig roll för apoptos". J Hepatol . 50 (4): 766–78. doi : 10.1016/j.jhep.2008.11.025 . PMID 19232449 .
  18. ^   Kaddar T, Chien WW, Bertrand Y, Pages MP, Rouault JP, Salles G, Ffrench M, Magaud JP (2009). "Prognostiskt värde av miR-16 uttryck i barndom akut lymfoblastisk leukemi relationer till normal och maligna lymfocytproliferation". Leuk Res . 33 (9): 1217–23. doi : 10.1016/j.leukres.2008.12.015 . PMID 19195700 .
  19. ^    Karaa ZS, Iacovoni JS, Bastide A, Lacazette E, Touriol C, Prats H (2009). "VEGF IRESes är differentiellt mottagliga för translationshämning av miR-16" . RNA . 15 (2): 249–54. doi : 10.1261/rna.1301109 . PMC 2648711 . PMID 19144909 .
  20. ^    Shanmugam N, Reddy MA, Natarajan R (2008). "Särskilda roller av heterogent nukleärt ribonukleärt protein K och mikroRNA-16 i cyklooxygenas-2 RNA-stabilitet inducerad av S100b, en ligand av receptorn för avancerade glykeringsslutprodukter" . J Biol Chem . 283 (52): 36221–33. doi : 10.1074/jbc.M806322200 . PMC 2606002 . PMID 18854308 .
  21. ^    Liu Q, Fu H, Sun F, Zhang H, Tie Y, Zhu J, Xing R, Sun Z, Zheng X (2008). "miR-16-familjen inducerar cellcykelstopp genom att reglera flera cellcykelgener" . Nucleic Acids Res . 36 (16): 5391–404. doi : 10.1093/nar/gkn522 . PMC 2532718 . PMID 18701644 .
  22. ^    Chen RW, Bemis LT, Amato CM, Myint H, Tran H, Birks DK, Eckhardt SG, Robinson WA (2008). "Trunkering i CCND1-mRNA förändrar miR-16-1-reglering i mantelcellslymfom" . Blod . 112 (3): 822–9. doi : 10.1182/blood-2008-03-142182 . PMC 2481543 . PMID 18483394 .
  23. ^   Xia L, Zhang D, Du R, Pan Y, Zhao L, Sun S, Hong L, Liu J, Fan D (2008). "miR-15b och miR-16 modulerar multidrogresistens genom att rikta in sig på BCL2 i humana magcancerceller" . Int J Cancer . 123 (2): 372–9. doi : 10.1002/ijc.23501 . PMID 18449891 .
  24. ^    Calin GA, Cimmino A, Fabbri M, Ferracin M, Wojcik SE, Shimizu M, Taccioli C, Zanesi N, Garzon R, Aqeilan RI, Alder H, Volinia S, Rassenti L, Liu X, Liu CG, Kipps TJ, Negrini M, Croce CM (2008). "MiR-15a och miR-16-1 klusterfunktioner i human leukemi" . Proc Natl Acad Sci USA . 105 (13): 5166–71. Bibcode : 2008PNAS..105.5166C . doi : 10.1073/pnas.0800121105 . PMC 2278188 . PMID 18362358 .
  25. ^    Scaglione BJ, Salerno E, Balan M, Coffman F, Landgraf P, Abbasi F, Kotenko S, Marti GE, Raveche ES (2007). "Murina modeller av kronisk lymfatisk leukemi: roll för mikroRNA-16 i den nya Zeelands svarta musmodellen" . Br J Haematol . 139 (5): 645–57. doi : 10.1111/j.1365-2141.2007.06851.x . PMC 2692662 . PMID 17941951 .
  26. ^    Raveche ES, Salerno E, Scaglione BJ, Manohar V, Abbasi F, Lin YC, Fredrickson T, Landgraf P, Ramachandra S, Huppi K, Toro JR, Zenger VE, Metcalf RA, Marti GE (2007). "Onormalt mikroRNA-16-lokus med synteny till humant 13q14 kopplat till CLL i NZB-möss" . Blod . 109 (12): 5079–86. doi : 10.1182/blood-2007-02-071225 . PMC 1890829 . PMID 17351108 .
  27. ^    Linsley PS, Schelter J, Burchard J, Kibukawa M, Martin MM, Bartz SR, Johnson JM, Cummins JM, Raymond CK, Dai H, Chau N, Cleary M, Jackson AL, Carleton M, Lim L (2007). "Transkript som är inriktade på microRNA-16-familjen reglerar tillsammans cellcykelprogression" . Mol Cell Biol . 27 (6): 2240–52. doi : 10.1128/MCB.02005-06 . PMC 1820501 . PMID 17242205 .
  28. ^    Bottoni A, Piccin D, Tagliati F, Luchin A, Zatelli MC, degli Uberti EC (2005). "miR-15a och miR-16-1 nedreglering i hypofysadenom". J Cell Physiol . 204 (1): 280–5. doi : 10.1002/jcp.20282 . PMID 15648093 . S2CID 39337781 .
Hämtad från " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mir-16_microRNA_precursor_family&oldid=1142757918 "