mir-34 mikroRNA-prekursorfamiljen
| mir-34 mikroRNA-prekursorfamilj | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av mir-34-
| |
| identifierare | |
| Symbol | mir-34 |
| Rfam | RF00456 |
| miRBase | MI0000268 |
| miRBase familj | MIPF0000039 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; miRNA |
| Domän(er) | Eukaryota |
| GÅ | GO:0035195 GO:0035068 |
| SÅ | SO:0001244 |
| PDB- strukturer | PDBe |
MiR -34 mikroRNA -prekursorfamiljen är icke-kodande RNA-molekyler som hos däggdjur ger upphov till tre stora mogna miRNA. MiR-34-familjemedlemmarna upptäcktes beräkningsmässigt och verifierades senare experimentellt. hårnålens 5'-arm .
miR-34 familjen
Hos däggdjur produceras tre miR-34-prekursorer från två transkriptionsenheter. Den humana miR-34a-prekursorn transkriberas från kromosom 1. MiR-34b- och miR-34c-prekursorerna samtranskriberas från en region på kromosom 11, uppenbarligen som en del av ett transkript som kallas BC021736 .
Uttryck av MIR34A (gen) i mus observeras i alla undersökta vävnader men är högst i hjärnan. miR-34b och -c är relativt mindre förekommande i de flesta vävnader, men är de dominerande miR-34-arterna i lungorna. Förekomsten av miR-34-produkter har också bekräftats i embryonala stamceller . miR-34 har visat sig vara moderligt nedärvt i Drosophila och zebrafisk och förlusten av miR-34 resulterade i defekter i bakhjärnans utveckling hos zebrafiskembryon. Detta var den första rapporten om knockdown-fenotyp av miR-34 i någon modellorganism även om fenotypen observerades i endast cirka 30% av zebrafiskembryon.
Mål för miR-34
Yamakuchi et al. . visade att miR-34a riktar sig mot för tyst informationsregulator 1 (SIRT1):
- "miR-34-hämning av SIRT1 leder till en ökning av acetylerad p53 och uttryck av p21 och PUMA, transkriptionsmål för p53 som reglerar cellcykeln respektive apoptos. Dessutom leder miR-34-undertryckandet av SIRT1 i slutändan till apoptos hos WT-människor tjocktarmscancerceller men inte i humana tjocktarmscancerceller som saknar p53. Slutligen är miR-34a i sig ett transkriptionellt mål för p53, vilket tyder på en positiv återkopplingsslinga mellan p53 och miR-34a. Sålunda fungerar miR-34a som en tumörsuppressor, i del, genom en SIRT1-p53-väg."
Nyligen användes Kvantitativ proteomik – SILAC -metod för att identifiera miR-34a-mål på genomnivå i HEK293T-celler .
Mir-34 hämmar humana p53-muterade magcancertumörsfärer
p53-defekta humana magcancerceller, återställande av funktionell miR-34 hämmar celltillväxt och inducerar kemosensibilisering och apoptos, vilket indikerar att miR-34 kan återställa p53-funktionen. Återställande av miR-34 hämmar tumörsfärbildning och tillväxt, vilket rapporteras vara korrelerat till självförnyelsen av cancerstamceller. Mekanismen för miR-34-medierad undertryckning av självförnyelse verkar vara relaterad till den direkta moduleringen av nedströmsmål Bcl-2, Notch och HMGA2, vilket indikerar att miR-34 kan vara involverat i självförnyelse av magcancerstamceller/ differentieringsbeslut. miR-34c har också associerats med benutveckling och skelettcancer.
externa länkar
- Sida för mir-34 mikroRNA-prekursorfamiljen på Rfam
- miRBase-post för mus miR-34a (mmu-miR-34a)
- miRBase-post för human miR-34a (hsa-miR-34a)