mir-8/mir-141/mir-200 mikroRNA-prekursorfamilj
| mir-8/mir-141/mir-200 mikroRNA-prekursorfamilj | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av mir-8-
| |
| identifierare | |
| Symbol | mir-8 |
| Rfam | RF00241 |
| miRBase | MI0000128 |
| miRBase familj | MIPF0000019 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; miRNA |
| Domän(er) | Eukaryota |
| GÅ | GO:0035195 GO:0035068 |
| SÅ | SO:0001244 |
| PDB- strukturer | PDBe |
MiR -8 mikroRNA-prekursorn ( homolog med miR-141, miR-200 , miR-236), är en kort icke-kodande RNA- gen involverad i genreglering . miR-8 i Drosophila melanogaster uttrycks från 3'-armen av besläktade prekursorhårnålar (representerade här), tillsammans med miR-200, miR-236, miR-429 och human- och mushomolog miR-141. Medlemmar av denna prekursorfamilj har nu förutspåtts eller experimentellt bekräftats i ett brett spektrum av arter. Gränserna för prekursorerna förutsägs baserat på konservering och basparning och är inte allmänt kända.
miR-200-familjen är mycket konserverad i bilaterala djur, med miR-8 som den enda homologen i Drosophila . Denna art har därför använts flitigt i arbete för att avslöja den biologiska funktionen hos miR-200-familjen. miR-8 har observerats i alla utvecklingsstadier av embryot och finns i odlade S2-celler av D. melanogaster . Dess uttryck har setts vara starkt uppreglerat i larver och detta uttryck bibehölls sedan till vuxen ålder.
Mål för miR-8
Atrofingenen har visat sig vara ett mål för Drosophila miR-8., med antydan om att detta mål också är konserverat i däggdjurs miR-8 . Förhöjd atrofinaktivitet i miR-8 mutantfenotyper har observerats, vilket i sin tur inducerar förhöjd neural apoptos och även beteendedefekter. Atrofin-mRNA-ökningen i miR-8-mutanter sker post-transkriptionellt, med miR-8-bindning som leder till destabilisering av atrofin-mRNA. miR-8 verkar för att kontrollera atrofinexpression in vivo direkt via miR-8-ställen i dess 3'UTR . En statistiskt signifikant ökning av överlevande vuxna efter avlägsnandet av en kopia av atrofingenen har faktiskt visat att atrofin-mRNA är ett funktionellt viktigt mål in vivo. Detta stöder teorin att en felreglering av atrofin bidrar till defekterna som ses i miR-8-mutanter. Atrofinproteinnivåer har dessutom visat sig vara detekterbart högre i miR-8 mutanthjärnor. De neurala effekterna av miR-8 i miR-8-uttryckande celler är sannolikt koncentrerade i miR-8-uttryckande neuroner, och verkar därför bara för att påverka vissa neuronfunktioner.
En avstämningsmålrelation finns mellan atrofinnivåer och miR-8-reglering. Nivån av atrofin under den som uppnås med miR-8-reglering är skadlig för den fortsatta funktionen av miR-8-uttryckande celler. Atrofinnivån här krävs på en optimal nivå för att säkerställa undvikande av utvecklingsdefekter som uppstår på grund av minskat atrofinuttryck.
Den mänskliga miR-200c kommer sannolikt att rikta sig mot Zink Finger Transcription Factor 8-genen (TCF8).
Reglering av insulinsignalering
miR-8, tillsammans med miR-200, har identifierats som en regulator av insulinsignalering i Drosophila fettkropp, motsvarande lever och fettväv i kombination. Detta har lett till spekulationer om ytterligare roller för dessa två medlemmar av denna miRNA-prekursorfamilj. mir-8 reglerar kroppsstorleken i Drosophila i samband med dess mål USH, och homologen miR-200 fungerar på samma sätt med sitt respektive mål FOG2. Fosfoinositid 3-kinas (PI3K) är ett kinas involverat i en fosforyleringskaskad som, när den väl har aktiverats, arbetar för att förbättra celltillväxt och proliferation. USH och FOG2 kan hämma PI3K-aktivitet genom direkt interaktion med dess regulatoriska subenheter, dp60 respektive p85α. Detta förhindrar bildandet av ett aktivt PI3K-komplex. Förhöjda USH/F0G2-nivåer observeras i miR-8/200 nolllarver, med en resulterande nedreglering av PI3K-aktiviteten hos dessa larver. I närvaro av miR-8/200 förbättras insulinsignaleringen i fettkroppsregionen, och ytterligare cellstorleksökningar ses med miR-8/200-överuttryck. Effekten av miR-8/200 på celltillväxt genom insulinsignalering har visat sig variera i olika vävnadstyper.
externa länkar
- MirBase-post för Drosophila miR-8
- MirBase-post för mänsklig miR-141
- MirBase-post för mus miR-141
- MirBase-post för mänsklig miR-200
- MirBase-post för mus miR-200
- MirBase-post för C. elegans miR-236
- MirBase-post för miR-429