Vitamin B 12 total syntes

Den totala syntesen av den komplexa biomolekylen vitamin B 12 åstadkoms på två olika sätt av de samarbetande forskargrupperna Robert Burns Woodward vid Harvard och Albert Eschenmoser vid ETH 1972. Genomförandet krävde ansträngning från inte mindre än 91 postdoktorala forskare (Harvard: 77, ETH: 14), och 12 Ph.D. studenter (vid ETH) från 19 olika nationer under en period på nästan 12 år. Syntesprojektet inducerade och innebar en stor paradigmförändring inom området för syntes av naturliga produkter .

Molekylen

Röntgenkristallstruktur av vitamin B 12 (cyanokobalamin) hydrat ( Dorothy Hodgkin et al. 1954)

Vitamin B 12 , C 63 H 88 CoN 14 O 14 P, är det mest komplexa av alla kända vitaminer . Dess kemiska struktur hade bestämts genom röntgenkristallstrukturanalys 1956 av forskargruppen Dorothy Hodgkin ( Oxford University ) i samarbete med Kenneth N. Trueblood vid UCLA och John G. White vid Princeton University . Kärnan i molekylen är corrinstrukturen , ett kvävehaltigt tetradentatligandsystem . Detta är biogenetiskt besläktat med porfyriner och klorofyller , men skiljer sig från dem i viktiga avseenden: kolskelettet saknar ett av de fyra mesokolen mellan de femledade ringarna, två ringar (A och D, fig. 1) är direkt förbundna med en kol-kol enkelbindning . Corrinkromoforsystemet är således icke-cykliskt och expanderar endast över tre mesopositioner, och innefattar tre vinylogena amidinenheter . Uppradade vid periferin av den makrocykliska ringen finns åtta metylgrupper och fyra propion- och tre ättiksyrasidokedjor . Nio kolatomer i corrinperiferin är kirogena centra . Den tetradentate, monobasiska corrin-liganden är ekvatorialt koordinerad med en trivalent koboltjon som bär ytterligare två axiella ligander .

Figur 1

flera naturliga varianter av B12- strukturen som skiljer sig åt i dessa axiella ligander. I själva vitaminet bär kobolten en cyanogrupp på översidan av corrinplanet ( cyanokobalamin ) och en nukleotidslinga på den andra. Denna slinga är ansluten på sin andra ände till den perifera propionsyraamidgruppen vid ring D och består av strukturella element som härrör från aminopropanol , fosfat , ribos och 5,6-dimetylbensimidazol . En av kväveatomerna i imidazolringen är axiellt koordinerad till kobolten, nukleotidslingan bildar således en nitton-ledad ring. Alla karboxylgrupper i sidokedjorna är amider.

Kobyrinsyra, ett av de naturliga derivaten av vitamin B12, saknar nukleotidloopen; beroende på naturen hos de två axiella liganderna visar den istället sin propionsyrafunktion vid ring D som karboxylat (som visas i fig. 1), eller karboxylsyra (med två cyanidligander vid kobolt).

De två synteserna

Strukturen av vitamin B 12 var den första naturliga produkten med låg molekylvikt som bestämdes genom röntgenanalys snarare än genom kemisk nedbrytning. Sålunda, medan strukturen för denna nya typ av komplex biomolekyl etablerades, förblev dess kemi väsentligen okänd; utforskning av denna kemi blev en av uppgifterna för vitaminets kemiska syntes . På 1960-talet utgjorde syntesen av en så exceptionellt komplex och unik struktur den stora utmaningen vid frontlinjen för forskning inom syntes av organiska naturprodukter.

Figur 2: Synteserna av två ETH-corrinmodeller

Figur 3: De två tillvägagångssätten för kobyrinsyrasyntes

Redan 1960 hade forskargruppen till biokemisten Konrad Bernhauer [ de ] i Stuttgart rekonstituerat vitamin B 12 från ett av dess naturligt förekommande derivat, kobyrinsyra, genom stegvis konstruktion av vitaminets nukleotidslinga. Detta arbete uppgick till en partiell syntes av vitamin B 12 från en naturlig produkt innehållande alla strukturella beståndsdelar av vitamin B 12 förutom nukleotidslingan . Därför valdes kobyrinsyra som målmolekyl för en total syntes av vitamin B12 .

Samarbete mellan forskargrupper vid Harvard och ETH resulterade i två kobyrinsyrasynteser, båda genomförda samtidigt 1972, en vid Harvard och den andra vid ETH. Ett "konkurrenskraftigt samarbete" av den storleken, som involverar 103 doktorander och postdoktorala forskare under totalt nästan 177 årsverken, är hittills unikt i den organiska syntesens historia . De två synteserna är intrikat sammanflätade kemiskt, men de skiljer sig i grunden i hur det centrala makrocykliska corrinligandsystemet är konstruerat. Båda strategierna är mönstrade efter två modell-corrinsynteser utvecklade vid ETH. Den första, publicerad 1964, uppnådde konstruktionen av corrin-kromoforen genom att kombinera en AD-komponent med en BC-komponent via iminoester / enamin -C,C- kondensationer , varvid den slutliga korrin-ringförslutningen uppnåddes mellan ringarna A och B. Den andra modellsyntesen, publicerad 1969, utforskade en ny fotokemisk cykloisomeriseringsprocess för att skapa den direkta A/D-ringövergången som slutlig korrinringförslutning mellan ringarna A och D.

A/B-metoden för kobyrinsyrasynteserna eftersträvades i samarbete och genomfördes 1972 vid Harvard. Den kombinerade en bicyklisk Harvard AD-komponent med en ETH BC-komponent och stängde den makrocykliska korrinringen mellan ringarna A och B. A/D-metoden för syntesen, genomförd vid ETH och avslutades samtidigt som A/B tillvägagångssätt, även 1972, lägger successivt till ringarna D och A till BC-komponenten i A/B-metoden och uppnår korrinringen mellan ringarna A och D. Banorna för de två synteserna möttes i en gemensam korrinoidmellanprodukt. De sista stegen från denna intermediär till kobyrinsyra utfördes i de två laboratorierna igen i samarbete, varvid varje grupp arbetade med material framställt via sitt eget tillvägagångssätt.

Sammanfattning av Harvard/ETH-samarbetet

Början

Woodward och Eschenmoser inledde projektet med en kemisk syntes av vitamin B 12 oberoende av varandra. ETH-gruppen började med en modellstudie om hur man syntetiserar ett corrin-ligandsystem i december 1959. I augusti 1961 började Harvard-gruppen attackera uppbyggnaden av B 12 -strukturen direkt genom att sikta på den mest komplexa delen av B 12 -molekylen, den "västra halvan" som innehåller den direkta förbindelsen mellan ringarna A och D (AD-komponenten). Redan i oktober 1960 hade ETH-gruppen påbörjat syntesen av en ring-B-prekursor för vitamin B 12 .

I början var framstegen vid Harvard snabba, tills ett oväntat stereokemiskt förlopp av ett centralt ringbildningssteg avbröt projektet. Woodwards erkännande av den stereokemiska gåtan som kom i dagen genom det irriterande beteendet i ett av hans noggrant planerade syntetiska steg blev, enligt hans egna skrifter, en del av utvecklingen som ledde till reglerna för orbitalsymmetri .

Efter 1965 fortsatte Harvard-gruppen arbetet mot en AD-komponent enligt en modifierad plan, med (−)-kamfer som källa till ring D.

Förenade krafter: A/B-metoden för kobyrinsyrasyntes

År 1964 hade ETH-gruppen åstadkommit den första syntesen av corrinmodellen , och även framställningen av en ring-B-prekursor som en del av en konstruktion av själva B 12 -molekylen. Eftersom de två gruppernas oberoende framsteg mot deras långsiktiga mål så klart kompletterade varandra, beslöt Woodward och Eschenmoser 1965 att slå sig samman och att från och med då fortsätta projektet med en B 12-syntes i samarbete och planerade att använda ligandkonstruktionen ( ring koppling av komponenter) strategi för ETH-modellsystemet.

År 1966 hade ETH-gruppen lyckats syntetisera BC-komponenten ("östra halvan") genom att koppla deras ring-B-prekursor till ring-C-prekursorn. Den sistnämnda hade också framställts vid Harvard från (−)-kamfer genom en strategi som utarbetades och användes tidigare av A. Pelter och JW Cornforth 1961. Vid ETH involverade syntesen av BC-komponenten implementeringen av C,C- kondensationsreaktion via sulfidkontraktion . Denna nyutvecklade metod visade sig ge en allmän lösning på problemet med att konstruera de karakteristiska strukturella elementen i corrin-kromoforen, de vinylloga amidinsystemen som överbryggar de fyra perifera ringarna.

Figur 4. 5,15-Bisnor-korrinoider

Tidigt 1967 genomförde Harvard-gruppen syntesen av modell AD-komponenten, med f-sidokedjan odifferentierad, med en metylesterfunktion som alla andra sidokedjor. Därefter utbytte de två grupperna systematiskt prover av sina respektive halvor av den korrinoida målstrukturen. År 1970 hade de i samarbete kopplat Harvards odifferentierade AD-komponent med ETH:s BC-komponent, vilket producerade dicyano-kobolt(III)-5,15-bisnor-heptametyl-kobyrinat 1 ( fig . 4). ETH-gruppen identifierade denna helt syntetiska korrinoid-mellanprodukt genom direkt jämförelse med ett prov framställt av naturligt vitamin B 12 .

I denna avancerade modellstudie fastställdes reaktionsförhållanden för de krävande processerna av C/D-kopplingen och A/B-cykliseringen via sulfidkontraktionsmetoden. De för C/D-kopplingen undersöktes framgångsrikt i båda laboratorierna, de överlägsna förhållandena var de som hittades vid Harvard, medan metoden för A/B-ringförslutning via en intramolekylär version av sulfidkontraktionen utvecklades vid ETH . Senare visades det vid Harvard att A/B-ringförslutningen också kunde uppnås genom tio- iminoester/enaminkondensation.

I början av 1971 hade Harvard-gruppen åstadkommit syntesen av den slutliga AD-komponenten, innehållande f-sidokedjekarboxylfunktionen vid ring D differentierad från alla karboxylfunktioner som en nitrilgrupp (som visas i 2 i fig . 4 ; se även fig. 3 ). A/D-delen av B12- strukturen innefattar den konstitutionellt och konfigurationsmässigt mest invecklade delen av vitaminmolekylen; dess syntes betraktas som apoteosen av Woodwards konst i naturlig produkt total syntes.

Det alternativa tillvägagångssättet för kobyrinsyrasyntes

Redan 1966 hade ETH-gruppen börjat utforska, återigen i ett modellsystem, en alternativ strategi för corrinsyntes där corrinringen skulle slutas mellan ringarna A och D. Projektet var inspirerat av den tänkbara existensen av en hittills okänd obligationsrekonstruktionsprocess. Detta – om det finns – skulle göra det möjligt att bygga kobyrinsyra från ett enda utgångsmaterial. Viktigt är att den hypotetiska processen, som tolkades som att den innebar två sekventiella omarrangemang, erkändes vara formellt täckt av de nya reaktivitetsklassificeringarna av sigmatropiska omarrangemang och elektrocykliseringar som föreslagits av Woodward och Hoffmann i samband med deras orbitalsymmetriregler !

I maj 1968 hade ETH-gruppen i en modellstudie visat att den tänkta processen, en fotokemisk A/D-seko-korrinat→korrinat cykloisomerisering, faktiskt existerar. Denna process visade sig först fortsätta med Pd-komplexet, men inte alls med motsvarande Ni(II)- eller kobolt(III)-A/D-seko-korrinatkomplex. Det gick även smidigt i komplex av metalljoner som zink och andra fotokemiskt inerta och löst bundna metalljoner. Dessa skulle efter ringslutning lätt kunna ersättas med kobolt. Dessa upptäckter öppnade dörren till vad som så småningom blev den fotokemiska A/D-metoden för kobyrinsyrasyntes.

Figur 5: Översikt Harvard/ETH-samarbete

Från och med hösten 1969 med BC-komponenten av A/B-metoden och en ring-D-prekursor framställd av enantiomeren av utgångsmaterialet som ledde till ring-B-prekursorn, tog det doktoranden Walter Fuhrer mindre än en och en halv år för att översätta den fotokemiska modellen corrinsyntes till en syntes av dicyano-kobolt(III)-5,15-bisnor-a,b,d,e,g-pentametyl-kobyrinat-c-N,N-dimetylamid-f - nitril 2 ( fig. 4 ), den vanliga korrinoidmellanprodukten på vägen mot kobyrinsyra. Vid Harvard erhölls samma mellanliggande 2 ungefär samtidigt genom att koppla den ring-D differentierade Harvard AD-komponenten (tillgänglig våren 1971) med ETH BC-komponenten, med tillämpning av de kondensationsmetoder som utvecklats tidigare med den odifferentierade AD-komponenten .

Sålunda, våren 1971, hade två olika vägar till en gemensam korrinoid intermediär 2 ( fig. 4 ) längs vägen till kobyrinsyra blivit tillgängliga, en som krävde 62 kemiska steg ( Harvard/ETH A/B-metoden) , den andra 42 ( ETH) A/D-metoden ). I båda tillvägagångssätten är de fyra perifera ringarna härledda från enantiopura prekursorer som har den korrekta känslan av kiral , och kringgår därigenom stora stereokemiska problem i uppbyggnaden av ligandsystemet. Vid konstruktionen av A/D-övergången genom A/D-secocorrin→ corrin cykloisomerisering, var bildning av två A/D- diastereomerer tvungen att förväntas. Användning av kadmium(II) som den koordinerande metalljonen ledde till en mycket hög diastereoselektivitet till förmån för den naturliga A/D- trans -isomeren.

När corrinstrukturen väl hade formats med endera tillvägagångssättet visade sig de tre CH- kirogena centra i periferin intill kromoforsystemet vara benägna att epimeriseras med exceptionell lätthet. Detta krävde en separation av diastereomerer efter de flesta av de kemiska stegen i detta avancerade steg av synteserna. Det var verkligen tur att precis runt den tiden hade tekniken för högtrycksvätskekromatografi (HPLC) utvecklats inom analytisk kemi. HPLC blev ett oumbärligt verktyg i båda laboratorierna; dess användning i B 12 -projektet, som pionjärer av Jakob Schreiber vid ETH, var den tidigaste tillämpningen av tekniken i syntes av naturliga produkter.

De gemensamma sista stegen

Den slutliga omvandlingen av den gemensamma korrinoidintermediären 2 (fig. 6) från de två tillvägagångssätten till målkobyrinsyran krävde införandet av de två saknade metylgrupperna vid mesopositionerna av corrinkromoforen mellan ringarna A/B och C/D, såväl som omvandlingen av alla perifera karboxylfunktioner till deras amidform, utom den kritiska karboxylen vid ring-D f-sidokedjan (se fig. 6). Dessa steg undersöktes tillsammans på ett strikt parallellt sätt i båda laboratorierna, Harvard-gruppen använde material som producerats via A/B-metoden, ETH-gruppen sådan framställd genom den fotokemiska A/D-metoden.

Bild 6.

Den första avgörande identifieringen av en helt syntetisk intermediär på vägen mot kobyrinsyra genomfördes i februari 1972 med ett kristallint prov av helsyntetisk dicyano-kobolt(III)-hexametyl-kobyrinat-f-amid 3 ( fig . 6), funnen. att vara identisk i alla data med ett kristallint reläprov tillverkat av vitamin B 12 genom metanolys till cobester 4 , följt av partiell ammonolys och separation av den resulterande blandningen. När Woodward tillkännagav "Total Synthesis of Vitamin B 12 " vid IUPAC-konferensen i New Delhi i februari 1972, var det helt syntetiska provet av f-amid ett som hade gjorts vid ETH genom den fotokemiska A/D-metoden , medan det första provet av syntetisk kobyrinsyra, identifierat med naturlig kobyrinsyra, hade erhållits vid Harvard genom partiell syntes från B 12 -härlett f-amidrelämaterial. Sålunda hade Woodward/Eschenmoser-prestationen runt den tiden varit, strängt taget, två formella totala synteser av kobyrinsyra, såväl som två formella totalsynteser av vitaminet.

Under senare delen av 1972, två kristallina epimerer av helt syntetisk dicyano-kobolt(III)-hexametyl-kobyrinat-f- amid 3 , samt två kristallina epimerer av den helt syntetiska f-nitril, alla framställda via båda syntetiska metoder, identifierades strängt kromatografiskt och spektroskopiskt med motsvarande B 12 -härledda substanser. Vid Harvard tillverkades sedan kobyrinsyra också av helt syntetisk f-amid 3 framställd via A/B-metoden. Slutligen de ] banat väg för , 1976 vid Harvard, omvandlades helt syntetisk kobyrinsyra till vitamin B 12 via den väg som Konrad Bernhauer [ .

Publiceringsprotokollet

Under de nästan 12 år som det tog de två grupperna att nå sitt mål, rapporterade både Woodward och Eschenmoser med jämna mellanrum om scenen för samarbetsprojektet i föreläsningar, några av dem visades i tryck. Woodward diskuterade A/B-metoden i föreläsningar publicerade 1968 och 1971, som kulminerade i tillkännagivandet av "Total Synthesis of Vitamin B 12 " i New Delhi i februari 1972 publicerad 1973. Denna publikation och föreläsningar med samma titel Woodward som levererades under den senare delen av året 1972 är begränsade till A/B-metoden i syntesen och diskuterar inte ETH A/D-metoden.

Eschenmoser hade diskuterat ETH:s bidrag till A/B-metoden 1968 vid den 22:a Robert A. Welch Foundation- konferensen i Houston, såväl som i sin 1969 RSC Centenary Lecture "Roads to Corrins", publicerad 1970. Han presenterade ETH:s fotokemiska A/D-inställning till B 12 -syntesen vid den 23:e IUPAC- kongressen i Boston 1971. Zürich-gruppen tillkännagav genomförandet av syntesen av kobyrinsyra genom den fotokemiska A/D-metoden i två föreläsningar som hölls av doktoranderna Maag och Fuhrer kl. Swiss Chemical Societys möte i april 1972, presenterade Eschenmoser en föreläsning "Total Synthesis of Vitamin B 12 : the Photochemical Route" för första gången som Wilson Baker-föreläsning vid University of Bristol, Bristol/UK den 8 maj 1972.

Figur 7a: ETH B 12 Ph.D. avhandlingar (uppifrån och ned, i kronologisk ordning: Jost Wild, Urs Locher, Alexander Wick och)
Figur 7b: Harvard B 12- rapporter (tre stackar) av postdoktorala forskare

Eftersom en gemensam fullständig publikation av synteserna av Harvard- och ETH-grupperna (tillkännagiven i och förväntad i) inte hade dykt upp 1977, publicerades en artikel som beskrev den slutliga versionen av den fotokemiska A/D-metoden som redan genomfördes 1972 i Science 1977. Den här artikeln är en utökad engelsk översättning av en som redan hade dykt upp 1974 i Naturwissenschaften, baserad på en föreläsning som hölls av Eschenmoser den 21 januari 1974 vid ett möte i Zürcher Naturforschende Gesellschaft. Fyra decennier senare, 2015, publicerade äntligen samma författare en serie av sex fullständiga artiklar som beskrev ETH-gruppens arbete med corrinsyntes . Del I av serien innehåller ett kapitel med titeln "The Final Phase of the Harvard/ETH Collaboration on the Synthesis of Vitamin B 12 ", i vilket ETH-gruppens bidrag till det samarbetsarbete om syntesen av vitamin B 12 mellan 1965 och 1972 är inspelade.

Hela ETH -arbetet dokumenteras i full experimentell detalj i offentligt tillgänglig Ph.D. avhandlingar, nästan 1 900 sidor, alla på tyska. Bidrag från de 14 postdoktorala ETH-forskarna som är involverade i kobyrinsyrasynteserna är till största delen integrerade i dessa avhandlingar. Det detaljerade experimentella arbetet vid Harvard dokumenterades i rapporter från de 77 inblandade postdoktorala forskarna, med en total volym på mer än 3 000 sidor.

Representativa recensioner av de två metoderna för den kemiska syntesen av vitamin B 12 har publicerats i detalj av AH Jackson och KM Smith, T. Goto, RV Stevens, KC Nicolaou & EG Sorensen, sammanfattade av J. Mulzer & D. Riether, och GW Craig, förutom många andra publikationer där dessa epokala synteser diskuteras.

Harvard/ETH-metoden för syntesen av kobyrinsyra: vägen till den gemensamma korrinoidmellanprodukten via A/B-korrin-ringförslutning

I A/B-metoden för kobyrinsyra kopplades Harvard AD-komponenten till ETH BC-komponenten mellan ringarna D och C, och stängdes sedan till en korrin mellan ringarna A och B. Båda dessa kritiska steg utfördes av C, C-koppling via sulfidkontraktion , en ny reaktionstyp utvecklad i syntesen av BC-komponenten vid ETH. AD-komponenten syntetiserades vid Harvard från en ring-A-prekursor (framställd från akirala utgångsmaterial), och en ring-D-prekursor framställd från (−)-kamfer . En modell AD-komponent användes för att utforska kopplingsförhållandena; denna komponent skilde sig från AD-komponenten som användes i den slutliga syntesen genom att som funktionell grupp vid ring-D f-sidokedjan hade en metylestergrupp ( som alla andra sidokedjor) istället för en nitrilgrupp .

ETH-metoden för syntesen av kobyrinsyra: vägen till den vanliga korrinoidmellanprodukten via A/D-korrin-ringförslutning

I A/D-metoden för syntesen av kobyrinsyra härrör de fyra ringprekursorerna (ring-C-prekursor endast formellt så) från de två enantiomererna av ett gemensamt kiralt utgångsmaterial . Alla tre vinylloga amidinbryggor som förbinder de fyra perifera ringarna konstruerades med sulfidkontraktionsmetoden, där BC-komponenten – redan förberedd för A/B-metoden – fungerade som en mellanprodukt. Den fotokemiska A/D-sekokorrin→korrincykloisomeriseringen, genom vilken korrinringen stängdes mellan ringarna A och D, är en ny process, målinriktad och befunnits existera i en modellstudie (jfr fig. 2 ) .

ETH/Harvard: de gemensamt utförda sista stegen från den vanliga korrinoidintermediären till kobyrinsyra

De sista stegen från den vanliga korrinoidintermediären E-37/HE-44 till kobyrinsyra E-44/HE-51 utfördes av de två grupperna i samarbete och parallellt, ETH -gruppen arbetade med material som producerats med A/D-metoden , och Harvard -gruppen med det från A/B-metoden . Vad de två grupperna faktiskt åstadkom var alltså de gemensamma slutstegen i två olika synteser.

Uppgifterna i denna slutfas av projektet var det regioselektiva införandet av metylgrupper vid de två mesopositionerna C-5 och C-15 i E-37/HE-44 , följt av omvandling av alla dess perifera karboxylfunktioner till primära amidgrupper , förutom det i sidokedjan f vid ring D, som måste sluta som fri karboxyl. Dessa konceptuellt enkla efterbehandlingssteg visade sig vara ganska komplexa i utförande, inklusive oförutsedda fallgropar som en dramatisk förlust av dyrbart syntetiskt material i den så kallade "Black Friday" (9 juli 1971).

Anteckningar