Argininkinas
| argininkinas- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||
| EG nr. | 2.7.3.3 | ||||||||
| CAS-nr. | 9026-70-4 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Inom enzymologi är argininkinas ( EC 2.7.3.3 ) ett enzym som katalyserar den kemiska reaktionen
- ATP + L-arginin ADP + N ω -fosfo-L-arginin
Således är de två substraten för detta enzym ATP och L-arginin , medan dess två produkter är ADP och Nω-fosfo-L-arginin. Till skillnad från fosforesterbindningen, som bildas under fosforyleringen av serin-, treonin- eller tyrosinrester, är fosforamidatet (PN-bindningen) i fosfo-arginin instabil vid lågt pH (<8), vilket gör det svårt att upptäcka med traditionella masspektrometriprotokoll.
Argininkinas tillhör familjen transferaser , speciellt de som överför fosforinnehållande grupper ( fosfotransferaser ) med en kvävehaltig grupp som acceptor. Detta enzym deltar i arginin- och prolinmetabolismen .
Nomenklatur
Det systematiska namnet på denna enzymklass är
- ATP:L-arginin Nw - fosfotransferas
Andra namn i vanligt bruk inkluderar
- argininfosfokinas,
- adenosin 5'-trifosfat: L-argininfosfotransferas,
- adenosin 5'-trifosfat-arginin fosfotransferas,
- ATP:L-arginin N-fosfotransferasel ATP:L-arginin, och
- ω-N-fosfotransferas.
Fungera
I grampositiva bakterier, såsom Bacillus subtilis , fosforylerar argininkinaset McsB argininresterna på felaktigt vikta eller aggregerade proteiner för att rikta dem mot nedbrytning av bakterieproteaset ClpC-ClpP (ClpCP). Fosfo-arginin-modifieringen (pArg) igenkänns av den N-terminala domänen av ClpC, den proteinuppveckande subenheten av ClpCP-proteaset. Efter igenkänning bryts målproteinet ned av ClpP-subenheten som har proteasaktivitet. Eftersom fosforylering omvänder arginins laddning, har pArg-modifieringen en utvecklingseffekt på målproteinet, vilket underlättar dess proteolytiska nedbrytning. Argininfosforylering är en dynamisk posttranslationell modifiering, som också kan vändas av pArg-specifika fosfataser, såsom bakteriell YwlE. pArg-ClpCP-mekanismen för proteinnedbrytning i bakterier är analog med det eukaryota ubiquitin-proteasomsystemet .
Flera studier har rapporterat förekomsten av argininkinaser i eukaryoter. En nyligen genomförd studie identifierade argininfosforylering på 118 proteiner i Jurkat-celler , vilka i första hand var proteiner med DNA/RNA-bindande aktiviteter. Funktionen av argininfosforylering i eukaryoter är dock fortfarande okänd.
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 8 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med preliminära anslutningskoder , , , , , och .
Vidare läsning
- Elodi P, Szorenyi E (1956). "Egenskaper hos kristallint arginin-fosfoferas isolerat från kräftdjursmuskel". Acta Physiologica Academiae Scientiarum Hungaricae . 9 (4): 367–379. PMID 13339436 .
- Morrison JF, Griffiths DE, Ennor AH (januari 1957). "Reningen och egenskaperna hos argininfosfokinas" . The Biochemical Journal . 65 (1): 143–153. doi : 10.1042/bj0650143 . PMC 1199841 . PMID 13403885 .
- Urbancsek J, Fancsovits P, Akos M, Tóthné Gilán Z, Hauzman E, Papp Z (januari 2006). "[Provörsbefruktning på vår avdelning. Ett decenniums arbete i siffror och fakta (1994-2003)]". Orvosi Hetilap . 147 (1): 7–14. PMID 16519065 .
- Virden R, Watts DC, Baldwin E (mars 1965). "Adenosin 5'-trifosfat-arginin fosfotransferas från hummermuskel: rening och egenskaper" . The Biochemical Journal . 94 (3): 536–544. doi : 10.1042/bj0940536 . PMC 1206586 . PMID 14340045 .
