Shikimate kinas

Shikimate kinas
1e6c opm.png
Shikimate kinas av Erwinia chrysanthemi
Identifierare
Symbol ÅKA SKIDOR
Pfam PF01202
Pfam klan CL0023
InterPro IPR000623
PROSITE PDOC00868
SCOP2 2shk / SCOPe / SUPFAM
OPM superfamilj 124
OPM-protein 1e6c
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
shikimate kinase
Shikimate kinase cartoon.png
En tecknad representation av shikimate kinas från Mycobacterium tuberculosis . α-Helices visas i rött, det centrala β-arket i gult och slingor i grönt
.
EG nr. 2.7.1.71
CAS-nr. 9031-51-0
Databaser
IntEnz IntEnz-vy
BRENDA BRENDA inträde
ExPASy NiceZyme-vy
KEGG KEGG inträde
MetaCyc Metabolisk väg
PRIAM profil
PDB- strukturer RCSB PDB PDBe PDB summa
Genontologi AmiGO / QuickGO
Sök
PMC artiklar
PubMed artiklar
NCBI proteiner

Shikimatkinas ( EC 2.7.1.71 ) är ett enzym som katalyserar den ATP -beroende fosforyleringen av shikimat för att bilda shikimat 3-fosfat. Denna reaktion är det femte steget i shikimat-vägen, som används av växter och bakterier för att syntetisera den vanliga prekursorn för aromatiska aminosyror och sekundära metaboliter. Det systematiska namnet på denna enzymklass är ATP:shikimat 3-fosfotransferas . Andra namn i vanlig användning inkluderar shikimatkinas (fosforylering) och shikimatkinas II .

Bakgrund

Shikimatvägen består av sju enzymatiska reaktioner genom vilka fosfoenolpyruvat och erytros 4-fosfat omvandlas till korismat , den vanliga föregångaren till de aromatiska aminosyrorna fenylalanin , tyrosin och tryptofan . De aromatiska aminosyrorna används i syntesen av proteiner och ger i växter, svampar och bakterier upphov till ett antal andra specialiserade metaboliter, såsom fenylpropanoider och alkaloider . Chorismat och flera andra intermediärer av vägen fungerar som prekursorer för ett antal andra metaboliter, såsom folater, kinater och kinoner. De fyra enzymerna som föregår shikimatkinas i vägen är DAHP-syntas , 3-dehydrokinatsyntas , 3-dehydrokinatdehydratas och shikimatdehydrogenas , och de två som följer det är EPSP-syntas och korismatsyntas . Hos svampar och protister är det en del av AROM-komplexet, där de fem centrala stegen i shikimatvägen är samlokaliserade. Vägen finns inte hos människor och andra djur, som måste få de aromatiska aminosyrorna från sin mat.

Aktivitet

Reaktionen katalyserad av shikimatkinas visas nedan:

reaction catalyzed by shikimate kinase
En rymdfyllande modell av shikimatkinas med ADP och shikimate 3-fosfatbundet.

Denna reaktion involverar överföring av en fosfatgrupp från ATP till 3-hydroxylgruppen i shikimat. Shikimatkinas har alltså två substrat , shikimat och ATP , och två produkter , shikimat 3-fosfat och ADP .

Exempel

Humana proteiner som innehåller denna domän inkluderar: MAPK7 och THNSL1