Coriobacteria
Coriobacteriia | |
---|---|
Vetenskaplig klassificering | |
Rike: | |
Provins: | |
Klass: |
Coriobacteria
König 2013
|
Order | |
|
|
Synonymer | |
|
Coriobacteria är en klass av grampositiva bakterier inom Actinomycetota - fylumet. Arter inom denna grupp är icke- sporulerande , strikta eller fakultativa anaerober som är kapabla att frodas i en mångfald av ekologiska nischer. Gordonibacter- arter är de enda medlemmarna som kan röra sig med hjälp av flageller inom klassen. Flera arter inom Coriobacteriia -klassen har varit inblandade i mänskliga sjukdomar som varierar i svårighetsgrad. Atopobium- , Olsenella- och Cryptobacterium -arter har ansvar för mänskliga orala infektioner inklusive parodontit , halitosis och andra endodontiska infektioner. Eggertella -arter har associerats med svår blodbakteremi och ulcerös kolit .
Molekylära signaturer och fylogenetisk position
Historiskt sett var alla Coriobacteria -arter placerade inom en enda ordning ( Coriobacteriales ) och en enda familj ( Coriobacteriaceae ). Denna uppfattning återspeglade dock inte exakta evolutionära inbördes relationer inom klassen. Den nuvarande taxonomiska uppfattningen motiveras av närvaron av flera konserverade signaturindelar (CSI) som har hittats i de olika taxonomiska leden. Dessa CSI är specifika och representerar synapomorfa egenskaper som kan användas för att särskilja grupper inom Coriobacteriia , både på familje- och ordningsnivå. Skillnaden mellan beställningarna inom Coriobacteria stöds också av fylogenetisk trädgrening och av konsekventa egenskaper; medlemmar som tillhör Coriobacteriales är glukosjäsande, sackarolytiska arter medan Eggerthellales -ordningen har arter som konsekvent inte kan fermentera glukos och är asackarolytiska.
CSI har också använts för att lösa den fylogenetiska positionen för Coriobacteriia bland alla bakterier där de har hittats exklusivt för alla arter inom klassen, vilket avgränsar dem från andra Actinomycetota . Coriobakterierna är en tidig förgrenad härstamning inom Actinomycetota phylum Klassens djupa förgrening har lett till tvist om dess medlemskap inom phylum och om det är en sann Actinomycetota-grupp eller inte . En CSI i form av en enskild aminosyrainsättning i enzymet deoxiuridin 59-trifosfat (dUTP) nukleotidohydrolas har hittats som delas av alla Coriobacteriia -medlemmar, såväl som flera Actinomycetota-arter, och frånvarande från alla andra bakterier. Denna CSI ger ett entydigt stöd för Coriobacteriias medlemskap inom Actinomycetota.
Fylogeni
16S rRNA-baserad LTP _12_2021 | GTDB 07-RS207 av Genome Taxonomy Database | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|