Lista över skärningsställen för restriktionsenzym: Bd–Bp

Huvudartiklar: Lista över skärplatser för restriktionsenzym och restriktionsenzym

Legenden om nukleobaser
Koda	Nukleotid representerad
A	Adenin (A)
C	Cytosin (C)
G	Guanin (G)
T	Tymin (T)
N	A, C, G eller T
M	A eller C
R	A eller G
W	A eller T
Y	C eller T
S	C eller G
K	G eller T
H	A, C eller T
B	C, G eller T
V	A, C eller G
D	A, G eller T

Den här artikeln innehåller en lista över de mest studerade restriktionsenzymer vars namn börjar med Bd till och med Bp. Den innehåller cirka 100 enzymer.

Följande information ges:

• Enzym : Accepterat namn på molekylen , enligt den internationellt antagna nomenklaturen och bibliografiska referenser . (Mer läsning: se avsnittet " Nomenklatur " i artikeln " Restriktionsenzym ".)
• PDB-kod : Kod som används för att identifiera strukturen av ett protein i PDB -databasen över proteinstrukturer. 3D-atomstrukturen hos ett protein ger mycket värdefull information för att förstå de intima detaljerna i dess verkningsmekanism.
• Källa : Organism som naturligt producerar enzymet.
• Igenkänningssekvens : Sekvens av DNA som känns igen av enzymet och till vilken det specifikt binder.
• Skärning : Skärställe och DNA-produkter från snittet. Igenkänningssekvensen dussintals nukleotider bort från igenkänningsstället.
• Isoschizomerer och neoschizomerer : En isoschizomer är ett enzym som känner igen samma sekvens som ett annat. En neoschizomer är en speciell typ av isoschizomer som känner igen samma sekvens som en annan, men skär på ett annat sätt. Ett maximalt antal av 8-10 vanligaste isoschizomerer är indikerade för varje enzym men det kan finnas många fler. Neoschizomerer visas med fet och grön typsnitt (t.ex.: BamHI ). När "Ingen på datum " anges betyder det att det inte fanns några registrerade isoschizomerer i databaserna det datumet med en tydligt definierad skärplats. Isoschizomerer indikerade med vitt teckensnitt och grå bakgrund motsvarar enzymer som inte finns med i de aktuella listorna:

som i detta ej listade enzym:

EcoR70I

Restriktionsenzymer

Bd - Bp

Enzym	PDB-kod	Källa	Igenkänningssekvens	Skära	Isoschizomerer
BdiI		Brevibacterium divaricatum	5' ATCGAT 3' TAGCTA	5' ---AT CGAT--- 3'   3' ---TAGC TA--- 5'	BavCI, Bci29I, Bli41I, Bli86I, BseCI, BsuTUI, Rme21I, SpmI
BdiSI		Bacteroides distasonis	5' CTRYAG 3' GAYRTC	5' ---C TRYAG--- 3'   3' ---GAYRT C--- 5'
BecAII		Brevibacterium sp. A	5' GGCC 3' CCGG	5' ---GG CC--- 3'   3' ---CC GG--- 5'
BepI		Brevibacterium epidermidis	5' CGCG 3' GCGC	5' ---CG CG--- 3'   3' ---GC GC--- 5'	AccII, BepI, BspFNI, BstUI, Bsu1532I, BtkI, FalII, FauBII, ThaI
BetI		Brevibacterium acetyliticum	5' WCCGGW 3' WGGCCW	5' ---W CCGGW--- 3'   3' ---WGGCC W--- 5'
BfaI		Bacteroides fragilis	5' CTAG 3' GATC	5' ---C TAG--- 3'   3' ---GAT C--- 5'
BfiI	2C1L	Bacillus firmus S8120	5' ACTGGG 3' TGACCC	5' ---ACTGGGNNNNN --- 3'   3' ---TGACCCNNNN N--- 5'	BmrI
Bfi57I		Butyrivibrio fibrisolvens OB157	5' GATC 3' CTAG	5' --- GATC--- 3'   3' ---CTAG --- 5'	Bsp105I, Bsp143I, BspJI, BstMBI, CviAI, Kzo9I, NdeII, SsiBI
Bfi89I		Butyrivibrio fibrisolvens OB189	5' YGGCCR 3' RCCGGY	5' ---Y GGCCR--- 3'   3' ---RCCGG Y--- 5'
BflI		Bacillus flavothermus	5' CCN 7 GG 3' GGN 7 CC	5' ---CCNNNNN NNGG--- 3'   3' ---GGNN NNNNNCC--- 5'
BfmI		Bacillus firmus S8-336	5' CTRYAG 3' GAYRTC	5' ---C TRYAG--- 3'   3' ---GAYRT C--- 5'
BfrI		Bacteroides fragilis	5' CTAAG 3' GAATTC	5' ---C TTAAG--- 3'   3' ---GAATT C--- 5'
BfrBI		Bacteroides fragilis BE3	5' ATGCAT 3' TACGTA	5' ---ATGCA T--- 3'   3' ---T ACGTA--- 5'	Csp68KIII, EcoT22I, Mph1103I, PinBI, Ppu10I, SepI, SspD5II, Zsp2I
BfuI		Bacillus firmus Auk 22-m21	5' GTATCC 3' CATAGG	5' ---GTATCCN 4 NN --- 3'   3' ---CATAGGN 4 N N--- 5'	BciVI
BfuAI		Bacillus fusiformis	5' ACCTGC 3' TGGACG	5' ---ACCTGCNNNN NNNN--- 3'   3' ---TGGACGNNNNNNNN --- 5'	Acc36I, BspMI, Bvel
BfuCI		Bacillus fusiformis 1226	5' GATC 3' CTAG	5' --- GATC--- 3'   3' ---CTAG --- 5'	Bce243I, Bsp105I, BspFI, BstKTI , CpfI, HacI, MkrAI, Sth368I
BglI	1DMU	Bacillus globigii	5' GCCN 5 GGC 3' CGGN 5 CCG	5' ---GCCNNNN NGGC--- 3'   3' ---CGGN NNNNCCG--- 5'
BglII	1ES8	Bacillus globigii	5' AGATCT 3' TTCTAGA	5' ---A GATCT--- 3'   3' ---TCTAG A--- 5'
BimI		Brevibacterium immotum	5' TTCGAA 3' AAGCTT	5' ---TT CGAA--- 3'   3' ---AAGC TT--- 5'	Acpl, AsuII, Bpu14I, BspT104I, CbiI, FspII, MlaI, PpaAI, SfuI
Bim19I		Brevibacterium immotum 19	5' TTCGAA 3' AAGCTT	5' ---TT CGAA--- 3'   3' ---AAGC TT--- 5'	Acpl, AsuII, Bpu14I, BspT104I, CbiI, FspII, MlaI, PpaAI, SfuI
Bim19II		Brevibacterium immotum 19	5' GGCC 3' CCGG	5' ---GG CC--- 3'   3' ---CC GG--- 5'
BinI		Bifidobacterium infantis 659	5' GGATC 3' CCTAG	5' ---GGATCNNNN N--- 3'   3' ---CCTAGNNNNN --- 5'	AclWI, AlwI,  BsrWI,  BspPI, BstH9I,  Bth617I,  EacI
BlfI		Bacillus licheniformis	5' TCCGGA 3' AGGCCT	5' ---T CCGGA--- 3'   3' ---AGGCC T--- 5'	AccIII, Aor13HI, BseAI, BsiMI, BspMII, Bsu23I, Kpn2I, PinBII
Bli41I		Bacillus licheniformis 41	5' ATCGAT 3' TAGCTA	5' ---AT CGAT--- 3'   3' ---TAGC TA--- 5'	Bci29I, Bli86I, BseCI, BsiXI, BsuTUI, Rme21I, SpmI, Ssp27144I
Bli86I		Bacillus licheniformis 86	5' ATCGAT 3' TAGCTA	5' ---AT CGAT--- 3'   3' ---TAGC TA--- 5'	BliAI, Bli41I, BseDI, BsiXI, Rme21I, SpmI, Ssp27144I, ZhoI
Bli736I		Bacillus licheniformis 736	5' GGTCTC 3' CCAGAG	5' ---GGTTCN NNNN--- 3'   3' ---CCAGAGNNNNN --- 5'
BliAI		Bacillus licheniformis	5' ATCGAT 3' TAGCTA	5' ---AT CGAT--- 3'   3' ---TAGC TA--- 5'	BliRI, Bli41I, BsiXI, BspDI, Rme21I, SpmI, Ssp27144I, ZhoI
BliHKI		Bacillus licheniformis HK	5' CCTNAGG 3' GGANTCC	5' ---CC TNAGG--- 3'   3' ---GGANT CC--- 5'	AocI, AxyI, Bse21I, Bsu36I, Eco81I, MstII, SauI, SshAI
BliRI		Bacillus licheniformis	5' ATCGAT 3' TAGCTA	5' ---AT CGAT--- 3'   3' ---TAGC TA--- 5'	BciBI, BdiI, Bli41I, BsiXI, BspDI, BspXI, LplI, SpmI, ZhoI
BlnI		Brevibacterium sängkläder	5' CCTAGG 3' GGATCC	5' ---C CTAGG--- 3'   3' ---GGATC C--- 5'	AspA2I, AvrII, AvrBII, BspA2I, XmaJI
BloHI		Bifidobacterium longum E194b	5' RGATCY 3' YCTAGR	5' ---R GATCY--- 3'   3' ---YCTAG R--- 5'
BloHII		Bifidobacterium longum E194b	5' CTGCAG 3' GACGTC	5' ---CTGCA G--- 3'   3' ---G ACGTC--- 5'	AjoI, Asp713I, BsuBI, CflI, CfuII, HallII, PstI, SalPI, SflI, Sst12I
BlpI		Bacillus lentus	5' GCTNAGC 3' CGANTCG	5' ---GC TNAGC--- 3'   3' ---CGANT CG--- 5'
BluI		Brevibacterium luteum	5' CTCGAG 3' GAGCTC	5' ---C TCGAG--- 3'   3' ---GAGCT C--- 5'	AbrI, BssHI, BstVI, PanI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XhoI
Bme12I		Bacillus megaterium 12	5' GATC 3' CTAG	5' --- GATC--- 3'   3' ---CTAG --- 5'	Bfi57I, Bsp143I, BspJI, BstMBI, CviAI, Kzo9I, NlaII, SsiBI
Bme18I		Bacillus megaterium 18	5' GGWCC 3' CCWGG	5' ---G GWCC--- 3'   3' ---CCWG G--- 5'	BamNxI, BcuAI, Csp68KI, EagMI, FssI, HgiCII, HgiJI, SinI
Bme142I		Bacillus megaterium 142	5' RGCGCY 3' YCGCGR	5' ---RGC GCY--- 3'   3' ---YCG CGR--- 5'	AccB2I ,   BfoI ,   Bsp143II , BstH2I , HaeII , Lpnl
Bme216I		Bacillus megaterium 216	5' GGWCC 3' CCWGG	5' ---G GWCC--- 3'   3' ---CCWG G--- 5'	BamNxI, BcuAI, Csp68KI, Eco47I, FssI, HgiCII, HgiJI, SinI
Bme361I		Bacillus megaterium 361	5' GGCC 3' CCGG	5' ---GG CC--- 3'   3' ---CC GG--- 5'
Bme585I		Bacillus mesentericus 585	5' CCCGC 3' GGGCG	5' ---CCCGCNNNN NN--- 3'   3' ---GGGCGNNNNNN --- 5'
Bme1390I		Bacillus megaterium RFL1390	5' CCNGG 3' GGNCC	5' ---CC NGG--- 3'   3' ---GGN CC--- 5'
Bme1580I		Bacillus megaterium 1580	5' GKGCMC 3' CMCGKG	5' ---GKGCM C--- 3'   3' ---C MCGKG--- 5'
BmgBI		Bacillus megaterium	5' CACGTC 3' GTGCAG	5' ---CAC GTC--- 3'   3' ---GTG CAG--- 5'
BmrI		Bacillus megaterium	5' ACTGGG 3' TGACCC	5' ---ACTGGGNNNNN --- 3'   3' ---TGACCCNNNN N--- 5'	BfiI
BmtI		Bacillus megaterium S2	5' GCTAGC 3' CGATCG	5' ---GCTAG C--- 3'   3' ---C GATCG--- 5'	AceII, AsuNHI ,  BspOI,  NheI , LlaG2I , PstNHI
BmyI		Bacillus mycoides	5' GDGCHC 3' CHCGDG	5' ---GDGCH C--- 3'   3' ---C HCGDG--- 5'	AocII, BsoCI, Bsp1286I, BspLS2I, MhlI, NspII, SduI
BnaI		Bacillus natto B3364	5' GGATCC 3' CCTAGG	5' ---G GATCC--- 3'   3' ---CCTAG G--- 5'	AccEBI, BamHI , Bce751I, BstI, CelI, OkrAI, Nsp29132II, Pfl8I, SolI
BoxI		Brevibacterium oxidans Iti 12-025	5' GACN 4 GTC 3' CTGN 4 CAG	5' ---GACNN NNGTC--- 3'   3' ---CTGNN NNCAG--- 5'
Bpcl		Bacillus sphaericus	5' CTRYAG 3' GAYRTC	5' ---C TRYAG--- 3'   3' ---GAYRT C--- 5'
BpiI		Bacillus pumilus sw 4-3	5' GAAGAC 3' CTTCTG	5' ---GAAGACNN NNNN--- 3'   3' ---CTTCTGNNNNNN --- 5'
BplI		Bacillus pumilus	5' GAGN 5 CTC 3' CTCN 5 GAG	5' ---GAGN 5 CTCN 7 NNNNNN --- 3'   3' ---CTCN 5 GAGN 7 N NNNNN--- 5'
BpmI		Bacillus pumilus	5' CTGGAG 3' GACCTC	5' ---CTGGAGN 13 NNN --- 3'   3' ---GACCTCN 13 N NN--- 5'
BpoAI		Bacillus polymyxa	5' ATTAAT 3' TAATTA	5' ---AT TAAT--- 3'   3' ---TAAT TA--- 5'	AseI, AsnI, PshBI, Sru4DI, VspI
BptI		Bacillus pantothenticus	5' CCWGG 3' GGWCC	5' ---CC WGG--- 3'   3' ---GGW CC--- 5'	AjnI , BseBI, Bse16I, BstNI, BstOI, BstM6I, Bst2UI, EcoRII , MvaI
BpuI		Bacillus pumilus AHU1387A	5' GRGCYC 3' CYCGRG	5' ---GRGCY C--- 3'   3' ---C YCGRG--- 5'
Bpu10I		Bacillus pumilus 10	5' CCTNAGC 3' GGANTCG	5' ---CC TNAGC--- 3'   3' ---GGANT CG--- 5'
Bpu14I		Bacillus pumilus 14	5' TTCGAA 3' AAGCTT	5' ---TT CGAA--- 3'   3' ---AAGC TT--- 5'	Acpl, AsuII, BsiCI, BspT104I, CbiI, FspII, MlaI, PpaAI, SfuI
Bpu95I		Bacillus pumilus 95	5' CGCG 3' GCGC	5' ---CG CG--- 3'   3' ---GC GC--- 5'	AccII, BepI, BspFNI, BstUI, Bsu1532I, FalII, FnuDII, MvnI, ThaI
Bpu1102I		Bacillus pumilus RFL1102	5' GCTNAGC 3' CGANTCG	5' ---GC TNAGC--- 3'   3' ---CGANT CG--- 5'
BpuAI		Bacillus pumilus	5' GAAGAC 3' CTTCTG	5' ---GAAGACNN NNNN--- 3'   3' ---CTTCTGNNNNNN --- 5'
BpuAmI		Bacillus pumilus	5' GAGCTC 3' CTCGAG	5' ---GAG CTC--- 3'   3' ---CTC GAG--- 5'
BpuB5I		Bacillus pumilus	5' CGTACG 3' GCATGC	5' ---C GTACG--- 3'   3' ---GCATG C--- 5'
BpuDI		Bacillus pumilus 1117	5' CCTNAGC 3' GGANTCG	5' ---CC TNAGC--- 3'   3' ---GGANT CG--- 5'
BpuEI		Bacillus pumilus 2187a	5' CTTGAG 3' GAACTC	5' ---CTTGAGN 13 NNN --- 3'   3' ---GAACTCN 13 N NN--- 5'
BpuJI	2VLA	Bacillus pumilus RFL1458	5' CCCGT 3' GGGCA	5' ---CCCGTN 10 N NNNNNNNN--- 3'   3' ---GGGCAN 10 NNNNNNNNN --- 5'	— Inga i maj 2010 —
BpuSI		Bacillus pumilus	5' GGGAC 3' CCCTG	5' ---GGGACN 9 N NNNN--- 3'   3' ---CCCTGN 9 NNNNN --- 5'