HLA-DQB1

HLA-DQB1
1UVQ.png
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning:
Identifierare
, CELIAC1, HLA-DQB, IDDM1, större histokompatibilitetskomplex, klass II, DQ beta 1, HLA-DRB1
Externa ID:n
Ortologer
Arter Mänsklig Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Plats (UCSC)
PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Major histokompatibilitetskomplex, klass II, DQ beta 1, även känd som HLA-DQB1 , är en mänsklig gen och betecknar också det genetiska stället som innehåller denna gen. Proteinet denna gen är ett av två proteiner som krävs för att bilda DQ - heterodimeren , en cellytereceptor som är väsentlig för immunsystemets funktion .

Fungera

HLA-DQB1 tillhör HLA klass II beta-kedjans paraloger . Denna klass II-molekyl är en heterodimer som består av en alfa- (DQA) och en beta-kedja (DQB), båda förankrade i membranet. Det spelar en central roll i immunsystemet genom att presentera peptider som härrör från extracellulära proteiner. Klass II-molekyler uttrycks i antigenpresenterande celler (APC: B-lymfocyter, dendritiska celler, makrofager).

Genstruktur och polymorfismer

Betakedjan är cirka 26-28 kDa och den innehåller 6 exoner . Exon ett kodar för ledarpeptiden, exon 2 och 3 kodar för de två extracellulära proteindomänerna , exon 4 kodar för transmembrandomänen och exon 5 kodar för den cytoplasmatiska svansen. Inom DQ-molekylen innehåller både alfakedjan och betakedjan polymorfismerna som specificerar peptidbindningsspecificiteterna, vilket resulterar i upp till 4 olika molekyler. Typning för dessa polymorfismer görs rutinmässigt för benmärgstransplantation .

Sjukdomsförening

Diabetes

Flera alleler av HLA-DQB1 är associerade med en ökad risk att utveckla typ 1-diabetes . Lokuset har också det genetiska namnet IDDM1 eftersom det är den högsta genetiska risken för typ 1-diabetes. Återigen har DQB1*0201 och DQB1*0302 allelerna, särskilt fenotypen DQB1*0201/*0302, en hög risk för sen typ 1-diabetes. Risken delas delvis med HLA-DR-lokuset (serotyperna DR3 och DR4).

Celiaki

Celiac1 är ett genetiskt namn för DQB1, HLA DQB1*0201, *0202 och *0302 kodar för gener som förmedlar den autoimmuna celiaki . Homozygoter av DQB1*0201 har en högre risk att utveckla celiaki, jämfört med något annat genetiskt locus.

Multipel skleros

Vissa HLA-DQB1-alleler är också kopplade till en måttlig ökad risk för multipel skleros .

Narkolepsi

Andra HLA-DQB1-alleler är associerade med en predisposition för narkolepsi , särskilt HLA-DQB1*0602, som bärs av över 90 % av patienterna med narkolepsi-kataplexi.

Alleler

HLA-DQB1 alleler
Serotyp DQB1 allel
DQ2 *0201
*0202
*0203
DQ4 *0401
*0402
DQ5 *0501
*0502
*0503
*0504
DQ6 *0601
*0602
*0603
*0604
*0605
*0609
DQ7 *0301
*0304
DQ8 *0302
*0305
DQ9 *0303

Se även

externa länkar

  • Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : P01920 (HLA klass II histokompatibilitetsantigen, DQ beta 1-kedja) vid PDBe-KB .