HLA-DRB5

HLA-DRB5
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, HLA-DRB, större histokompatibilitetskomplex, klass II, DR beta 5, HLA-DRB5*
Externa ID :n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

HLA klass II histokompatibilitetsantigen, DRB5 betakedja är ett protein som hos människor kodas av HLA-DRB5- genen .

Fungera

Proteinet som kodas av denna gen tillhör HLA klass II beta- kedjans paraloger . Klass II-molekylen är en heterodimer bestående av en alfa- (DRA) och en beta-kedja (DRB), båda förankrade i membranet. Det spelar en central roll i immunsystemet genom att presentera peptider som härrör från extracellulära proteiner. Klass II-molekyler uttrycks i antigenpresenterande celler (APC: B-lymfocyter, dendritiska celler, makrofager).

Genstruktur och polymorfismer

Betakedjan är ungefär 26-28 kDa. Den kodas av 6 exoner , exon ett kodar för ledarpeptiden, exon 2 och 3 kodar för de två extracellulära domänerna , exon 4 kodar för transmembrandomänen och exon 5 kodar för den cytoplasmatiska svansen. Inom DR-molekylen innehåller betakedjan alla polymorfismer som specificerar peptidbindningsspecificiteterna. Hundratals DRB1- alleler har beskrivits och typning för dessa polymorfismer görs rutinmässigt för benmärgs- och njurtransplantation.

Genexpression

DRB1 uttrycks på en nivå som är fem gånger högre än dess paraloger DRB3 , DRB4 och DRB5. DRB1 finns hos alla individer. Allelvarianter av DRB1 är kopplade till antingen ingen eller någon av generna DRB3, DRB4 och DRB5. Närvaron av DRB5 är kopplad till alleliska varianter av DRB1, annars utelämnas den. Det finns 4 relaterade pseudogener: DRB2, DRB6, DRB7, DRB8 och DRB9.

Se även

• HLA-DR

Vidare läsning

•   Lau M, Terasaki PI, Park MS (1995). "Internationellt cellutbyte, 1994". Kliniska transplantationer : 467–88. PMID 7547576 .
•    Dong RP, Kimura A, Sasazuki T (1992). "Sekvensanalys av tre nya DRw14-DRB1 alleler". Immunogenetik . 36 (2): 130–3. doi : 10.1007/BF00215291 . PMID 1612646 . S2CID 32928324 .
•    Piatier-Tonneau D, Gastinel LN, Amblard F, et al. (1991). "Interaktion av CD4 med HLA klass II-antigener och HIV gp120". Immunogenetik . 34 (2): 121–8. doi : 10.1007/BF00211424 . PMID 1869305 . S2CID 10116507 .
•   Nong Y, Kandil O, Tobin EH, et al. (1991). "HIV-kärnproteinet p24 hämmar interferon-gamma-inducerad ökning av HLA-DR och cytokrom b tunga kedjas mRNA-nivåer i den humana monocytliknande cellinjen THP1". Cell. Immunol . 132 (1): 10–6. doi : 10.1016/0008-8749(91)90002-S . PMID 1905983 .
•   Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). "HIV-gp120 kan blockera CD4-klass II MHC-medierad vidhäftning". J. Immunol . 144 (2): 526–31. PMID 1967269 .
•   Callahan KM, Fort MM, Obah EA, et al. (1990). "Genetisk variabilitet i HIV-1 gp120 påverkar interaktioner med HLA-molekyler och T-cellsreceptor". J. Immunol . 144 (9): 3341–6. PMID 1970352 .
•    Petersdorf EW, Griffith RL, Erlich HA, et al. (1990). "Unika sekvenser för två HLA-DRB1-gener uttryckta på distinkta DRw6-haplotyper". Immunogenetik . 32 (2): 96–103. doi : 10.1007/BF00210446 . PMID 1975801 . S2CID 28007432 .
•    Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). "Identifiering och strukturell analys av rester i V1-regionen av CD4 involverade i interaktion med humant immunbristvirus hölje glykoprotein gp120 och klass II stora histokompatibilitetskomplexmolekyler. " Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (22): 9052–6. doi : 10.1073/pnas.87.22.9052 . PMC 55099 . PMID 1978941 .
•    Gyllensten UB, Sundvall M, Erlich HA (1991). "Allelisk mångfald genereras av intraexonsekvensutbyte vid DRB1-lokuset hos primater" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 88 (9): 3686–90. Bibcode : 1991PNAS...88.3686G . doi : 10.1073/pnas.88.9.3686 . PMC 51517 . PMID 2023919 .
•   Lee KW, Johnson AH, Hurley CK (1990). "Två divergerande utvecklingsvägar gav upphov till DRw13-haplotyperna". J. Immunol . 145 (9): 3119–25. PMID 2212675 .
•   Gorski J (1989). "HLA-DR beta-kedja polymorfism. Andra domän polymorfism återspeglar evolutionär släktskap av alleler och kan förklara offentliga serologiska epitoper". J. Immunol . 143 (1): 329–33. PMID 2471740 .
•    Clayton LK, Sieh M, Pious DA, Reinherz EL (1989). "Identifiering av humana CD4-rester som påverkar klass II MHC kontra HIV-1 gp120-bindning" . Naturen . 339 (6225): 548–51. Bibcode : 1989Natur.339..548C . doi : 10.1038/339548a0 . PMID 2543930 . S2CID 4246781 .
•   Hurley CK, Gregersen PK, Gorski J, et al. (1989). "DR3(w18),DQw4-haplotypen skiljer sig från DR3(w17),DQw2-haplotyperna vid flera klass II-loci". Brum. Immunol . 25 (1): 37–50. doi : 10.1016/0198-8859(89)90068-2 . PMID 2565895 .
•   Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T, et al. (1988). "Hämning av CD4+ T-cellsfunktion av HIV-höljesproteinet, gp120". J. Immunol . 141 (11): 3715–7. PMID 2846691 .
•   Freeman SM, Saunders TL, Madden M, et al. (1987). "Jämförelse av DR beta 1-alleler från diabetiker och normala individer". Brum. Immunol . 19 (1): 1–6. doi : 10.1016/0198-8859(87)90033-4 . PMID 2884201 .
•    Lee BS, Rust NA, McMichael AJ, McDevitt HO (1987). "HLA-DR2-subtyper bildar en extra supertypisk familj av DR-beta-alleler" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 84 (13): 4591–5. Bibcode : 1987PNAS...84.4591L . doi : 10.1073/pnas.84.13.4591 . PMC 305136 . PMID 2885840 .
•    Owerbach D, Rich C, Taneja K (1986). "Karakterisering av tre HLA-DR-beta-gener isolerade från en HLA-DR 3/4 insulinberoende diabetespatient". Immunogenetik . 24 (1): 41–6. doi : 10.1007/BF00372296 . PMID 3015788 . S2CID 19599710 .
•    Wu S, Saunders TL, Bach FH (1987). "Polymorfism av humana Ia-antigener genererade av ömsesidigt intergeniskt utbyte mellan två DR beta loci". Naturen . 324 (6098): 676–9. doi : 10.1038/324676a0 . PMID 3099214 . S2CID 4365990 .
•   Liu CP, Bach FH, Wu SK (1988). "Molekylära studier av en sällsynt DR2/LD-5a/DQw3 HLA klass II haplotyp. Flera genetiska mekanismer i genereringen av polymorfa HLA klass II gener". J. Immunol . 140 (10): 3631–9. PMID 3129499 .
•    Steimle V, Hinkkanen A, Schlesier M, Epplen JT (1988). "En ny HLA-DR beta I-sekvens från DRw11-haplotypen". Immunogenetik . 28 (3): 208–10. doi : 10.1007/BF00375861 . PMID 3137159 . S2CID 2712069 .