HLA-DRB4
HLA-DRB4- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
, DR-4, DR4, DRB4, HLA-DR4B, större histokompatibilitetskomplex, klass II, DR beta 4, HLA-DRB4*, HLA-DRB Externa ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Stort histokompatibilitetskomplex, klass II, DR beta 4, även känt som HLA-DRB4 , är en human gen .
Fungera
Proteinet som kodas av denna gen tillhör HLA klass II beta- kedjans paraloger . Klass II-molekylen är en heterodimer bestående av en alfa- (DRA) och en beta-kedja (DRB), båda förankrade i membranet. Det spelar en central roll i immunsystemet genom att presentera peptider som härrör från extracellulära proteiner. Klass II-molekyler uttrycks i antigenpresenterande celler (APC: B-lymfocyter, dendritiska celler, makrofager).
Genstruktur och polymorfismer
Betakedjan är ungefär 26-28 kDa. Den kodas av 6 exoner , exon ett kodar för ledarpeptiden, exon 2 och 3 kodar för de två extracellulära domänerna , exon 4 kodar för transmembrandomänen och exon 5 kodar för den cytoplasmatiska svansen. Inom DR-molekylen innehåller betakedjan alla polymorfismer som specificerar peptidbindningsspecificiteterna. Hundratals DRB1- alleler har beskrivits och typning för dessa polymorfismer görs rutinmässigt för benmärgs- och njurtransplantation.
Genexpression
DRB1 uttrycks på en nivå som är fem gånger högre än dess paraloger DRB3 , DRB4 och DRB5 . DRB1 finns hos alla individer. Allelvarianter av DRB1 är kopplade till antingen ingen eller någon av generna DRB3, DRB4 och DRB5. Det finns 4 relaterade pseudogener: DRB2, DRB6, DRB7, DRB8 och DRB9.
Se även
Vidare läsning
- Germain RN (1996). "Bindande domänreglering av MHC klass II-molekylsammansättning, trafficking, öde och funktion". Semin. Immunol . 7 (6): 361–72. doi : 10.1006/smim.1995.0041 . PMID 8775462 .
- O'Brien RM, Cram DS, Russ GR, et al. (1992). "Nukleotidsekvenser av HLA-DRw12- och DRw8 B1-kedjorna från en australisk aborigin". Brum. Immunol . 34 (2): 147–51. doi : 10.1016/0198-8859(92)90041-K . PMID 1358866 .
- Kenter M, Otting N, Anholts J, et al. (1992). "Mhc-DRB mångfald av schimpansen (Pan troglodytes)". Immunogenetik . 37 (1): 1–11. doi : 10.1007/BF00223539 . PMID 1428007 . S2CID 26557301 .
- Dong RP, Kimura A, Sasazuki T (1992). "Sekvensanalys av tre nya DRw14-DRB1 alleler". Immunogenetik . 36 (2): 130–3. doi : 10.1007/BF00215291 . PMID 1612646 . S2CID 32928324 .
- Piatier-Tonneau D, Gastinel LN, Amblard F, et al. (1991). "Interaktion av CD4 med HLA klass II-antigener och HIV gp120". Immunogenetik . 34 (2): 121–8. doi : 10.1007/BF00211424 . PMID 1869305 . S2CID 10116507 .
- Nong Y, Kandil O, Tobin EH, et al. (1991). "HIV-kärnproteinet p24 hämmar interferon-gamma-inducerad ökning av HLA-DR och cytokrom b tunga kedjas mRNA-nivåer i den humana monocytliknande cellinjen THP1". Cell. Immunol . 132 (1): 10–6. doi : 10.1016/0008-8749(91)90002-S . PMID 1905983 .
- Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). "HIV-gp120 kan blockera CD4-klass II MHC-medierad vidhäftning". J. Immunol . 144 (2): 526–31. PMID 1967269 .
- Callahan KM, Fort MM, Obah EA, et al. (1990). "Genetisk variabilitet i HIV-1 gp120 påverkar interaktioner med HLA-molekyler och T-cellsreceptor". J. Immunol . 144 (9): 3341–6. PMID 1970352 .
- Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). "Identifiering och strukturell analys av rester i V1-regionen av CD4 involverade i interaktion med humant immunbristvirus hölje glykoprotein gp120 och klass II stora histokompatibilitetskomplexmolekyler. " Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (22): 9052–6. doi : 10.1073/pnas.87.22.9052 . PMC 55099 . PMID 1978941 .
- Gyllensten UB, Sundvall M, Erlich HA (1991). "Allelisk mångfald genereras av intraexonsekvensutbyte vid DRB1-lokuset hos primater" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 88 (9): 3686–90. Bibcode : 1991PNAS...88.3686G . doi : 10.1073/pnas.88.9.3686 . PMC 51517 . PMID 2023919 .
- Lee KW, Johnson AH, Hurley CK (1990). "Två divergerande utvecklingsvägar gav upphov till DRw13-haplotyperna". J. Immunol . 145 (9): 3119–25. PMID 2212675 .
- Gorski J (1989). "Första domänsekvensen av HLA-DRB1-kedjan från två HLA-DRw14 homozygot typningscellinjer: TEM (Dw9) och AMALA (Dw16)". Brum. Immunol . 24 (2): 145–9. doi : 10.1016/0198-8859(89)90054-2 . PMID 2466818 .
- Fan WM, Kasahara M, Gutknecht J, et al. (1990). "Delade klass II MHC-polymorfismer mellan människor och schimpanser". Brum. Immunol . 26 (2): 107–21. doi : 10.1016/0198-8859(89)90096-7 . PMID 2511168 .
- Clayton LK, Sieh M, Pious DA, Reinherz EL (1989). "Identifiering av humana CD4-rester som påverkar klass II MHC kontra HIV-1 gp120-bindning" . Naturen . 339 (6225): 548–51. Bibcode : 1989Natur.339..548C . doi : 10.1038/339548a0 . PMID 2543930 . S2CID 4246781 .
- Abe A, Ito I, Ohkubo M, et al. (1990). "Två distinkta subtyper av HLA-DRw12-haplotyperna i den japanska befolkningen upptäckts genom nukleotidsekvensanalys och oligonukleotidgenotypning". Immunogenetik . 30 (6): 422–6. doi : 10.1007/BF02421173 . PMID 2592019 . S2CID 30397455 .
- Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T, et al. (1988). "Hämning av CD4+ T-cellsfunktion av HIV-höljesproteinet, gp120". J. Immunol . 141 (11): 3715–7. PMID 2846691 .
- Owerbach D, Rich C, Taneja K (1986). "Karakterisering av tre HLA-DR-beta-gener isolerade från en HLA-DR 3/4 insulinberoende diabetespatient". Immunogenetik . 24 (1): 41–6. doi : 10.1007/BF00372296 . PMID 3015788 . S2CID 19599710 .
- Karr RW, Gregersen PK, Obata F, et al. (1986). "Analys av DR beta och DQ beta kedja cDNA kloner från en DR7 haplotyp". J. Immunol . 137 (9): 2886–90. PMID 3020127 .
- Andersson G, Larhammar D, Widmark E, et al. (1987). "Klass II-gener av det mänskliga stora histokompatibilitetskomplexet. Organisation och evolutionärt förhållande mellan DR-beta-gener" . J. Biol. Chem . 262 (18): 8748–58. doi : 10.1016/S0021-9258(18)47480-7 . PMID 3036826 .
- Wu S, Saunders TL, Bach FH (1987). "Polymorfism av humana Ia-antigener genererade av ömsesidigt intergeniskt utbyte mellan två DR beta loci". Naturen . 324 (6098): 676–9. doi : 10.1038/324676a0 . PMID 3099214 . S2CID 4365990 .