GYPB

GYPB-
identifierare
	, CD235b, GPB, GPB.NY, GYPHe.NY, GpMiIII, HGpMiIII, HGpMiVI, HGpMiX, MNS, PAS-3, SS, GYP, glykoforin B (MNS-blodgrupp), GYPA Externa
IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa

Glykoforin B (MNS-blodgrupp) (genbeteckning GYPB ) även känd som sialoglykoprotein delta och SS-aktivt sialoglykoprotein är ett protein som hos människor kodas av GYPB - genen . GYPB har också nyligen betecknats CD235b ( kluster av differentiering 235b).

Fungera

Glykoforin A (GYPA) och B (GYPB; detta protein) är huvudsialoglykoproteiner i det humana erytrocytmembranet som bär de antigena determinanterna för MN- respektive Ss- blodgruppen . Förutom M- eller N- och S- eller s-antigenerna, som vanligtvis förekommer i alla populationer, har omkring 40 relaterade variantfenotyper identifierats. Dessa varianter inkluderar Miltenberger (Mi)-komplexet och flera isoformer av stenar (St ^a ); även Dantu, Sat, Henshaw (He eller MNS6), Mg och deletionsvarianter En ^a , SsU- och ^Mk . De flesta av dessa är resultatet av genrekombinationer mellan GYPA och GYPB.

Genomik

Genen finns på den långa armen av kromosom 4 (4q28-q31) och har 5 exoner. Den sekvenserades första gången 1987, peptidsekvensen på 72 aminosyror som bestämdes tidigare samma år.

Genen har 97 % sekvenshomologi med glykoforin A-genen från 5' UTR ungefär 1 kilobas uppströms från exonet som kodar för transmembranregionerna till den del av den kodande sekvensen som kodar för de första 45 aminosyrorna. Det finns en signalsekvens med 19 aminosyrarester. Ledarpeptiden skiljer sig åt med en aminosyra och de nästa 26 aminosyrorna är identiska. Aminosyrorna 27-55 i glykoforin A saknas i glykoforin B. Detta avsnitt inkluderar ett N-glykosyleringsställe. Endast O-glykosyleringsställen finns på glykoprotein B och dessa är länkade via serin eller treonin . Resterna 80-100 av glykoforin A och 51-71 av glykoforin B är mycket lika. De mellanliggande resterna skiljer sig däremot signifikant åt. Den antigena determinanten för blodgruppen Ss är belägen vid rest 29 där S har en metionin och sa treonin. Detta beror på en mutation vid nukleotid 143 (C->T). S-antigenet är också känt som MNS3 och s-antigenet som MNS4.

Det verkar troligt att denna gen har utvecklats genom genduplicering och efterföljande mutation av glykoforin A. Övergångsstället från homologa till icke-homologa sekvenser kan lokaliseras inom Alu-upprepningssekvenser .

Molekylärbiologi

Det finns ~80000 kopior av glykoforin B per erytrocyt. Både glykoforin A och B uttrycks på njurendotelet och epitelet.

De första 40 aminosyrorna i det mogna proteinet är extracellulära. De nästa 22 bildar ett transmembransegment och resten är intracellulära.

Blodgrupper

MNS-blodgruppen var den andra uppsättningen antigener som upptäcktes. M och N identifierades 1927 av Landsteiner och Levine. S och s in beskrevs senare 1947

Frekvenserna av dessa antigener är

• M: 78% kaukasiskt ; 74 % negroid
• N: 72 % kaukasiskt; 75 % negroid
• S: 55 % kaukasiskt; 31% negroid
• s: 89 % kaukasiskt; 93 % negroid

Molekylär medicin

Transfusionsmedicin

M- och N-antigenerna skiljer sig åt vid två aminosyrarester: M-allelen har serin i position 1 (C vid nukleotid 2) och glycin vid position 5 (G vid nukleotid 14) medan N-allelen har leucin i position 1 (T vid nukleotid). 2) och glutamat vid position 5 (A vid nukleotid 14)

Glykoforin B bär blodgruppsantigener N, Ss och U. Både glykoforin A och B binder Vicia graminea anti-N-lektinet. S- och s-antigener påverkas inte av behandling med trypsin eller sialidas utan förstörs eller deprimeras kraftigt av behandling med papain , pronase eller alfa-kymotrypsin .

Det finns ett 40-tal kända varianter i MNS-blodgruppssystemet. Dessa har till stor del uppstått som ett resultat av mutationer inom 4 kb-regionen som kodar för den extracellulära domänen. Dessa inkluderar antigenerna Mv, Dantu, Henshaw (He), Orriss (Or), Miltenberger, Raddon (FR) och Stones (St a ⁾ . Schimpanser har också ett MN blodantigensystem. Hos schimpanser reagerar M starkt men N endast svagt.

Noll mutanter

Individer som saknar GypB har fenotypen SsU-. Detta kan inträffa med frekvenser på 20 % i vissa afrikanska pygméer.

Hos individer som saknar både glykoforin A och B har fenotypen betecknats ^Mk .

Dantu antigen

Dantu-antigenet beskrevs 1984. Dantu-antigenet har en skenbar molekylvikt på 29 kilodalton (kDa) och 99 aminosyror. De första 39 aminosyrorna i Dantu-antigenet är härledda från glykoforin B och resterna 40-99 är härledda från glykoforin A. Dantu är associerad med mycket svag s-antigen, ett proteasresistent N-antigen och antingen mycket svagt eller inget U-antigen. Det finns minst tre varianter: MD, NE och Ph. Dantu-fenotypen förekommer med en frekvens av Dantu-fenotypen är ~0,005 hos amerikanska svarta och < 0,001 hos tyskar.

Henshaw antigen

Henshaw (He)-antigenet beror på en mutation av den N-terminala regionen. Det finns tre skillnader i de tre första aminosyraresterna: den vanliga formen har tryptofan ₁ -serin-treonin-serin- glycin ₅ medan Henshaw har leucin ₁ -serin-treonin-treonin- glutamat ₅ . Detta antigen är sällsynt hos kaukasier men förekommer med en frekvens på 2,1 % i USA och Storbritannien av afrikanskt ursprung. Det förekommer med en hastighet av 7,0 % hos svarta i Natal och 2,7 % hos västafrikaner. Minst 3 varianter av detta antigen har identifierats.

Miltenberger delsystem

Miltenberger (Mi) subsystem som ursprungligen bestod av fem fenotyper (Mi ^a , V ^w , Mur, Hil och Hut) har nu 11 erkända fenotyper numrerade I till XI (antigenet 'Mur' är uppkallat efter patienten det ursprungliga serumet isolerades från - en fru Murrel.) Namnet som ursprungligen gavs till detta komplex hänvisar till reaktionen erytrocyter gav till standard Miltenberger-antisera som användes för att testa dem. Underklasserna baserades på ytterligare reaktioner med andra standardantisera.

Mi-I (Mia ⁾ , Mi-II(Vw ⁾ , Mi-VII och Mi-VIII bärs på glykoforin A. Mi-I beror på en mutation vid aminosyra 28 (treonin till metionin: C->T vid nukleotid 83) vilket resulterar i en förlust av glykosyleringen vid asparagin _26- resten. Mi-II beror på en mutation vid aminosyra 28 (treonin till lysin :C->A vid nukleotid 83). I likhet med fallet med Mi-I resulterar denna mutation i en förlust av glykosyleringen vid asparagin _26- resten. Denna förändring i glykosylering kan detekteras genom närvaron av ett nytt 32 kDa glykoprotein som är färgbart med PAS. Mi-VII beror på en dubbelmutation i glykoforin A som omvandlar en argininrest till en treoninrest och en tyrosinrest till en serin vid positionerna 49 respektive 52. Treonin-49-resten glykosyleras. Detta verkar vara ursprunget till en av de Mi-VII-specifika antigenerna (Anek) som är känd för att ligga mellan resterna 40-61 av glykoforin A och innefattar sialinsyrarester bundna till O-glykosidiskt kopplade oligosackarider. Detta förklarar också förlusten av ett högfrekvent antigen ((EnaKT)) som finns i normalt glykoforin A som finns inom resterna 46–56. Mi-VIII beror på en mutation vid aminosyrarest 49 ( arginin ->treonin). M-VIII delar Anek-determinanten med MiVII. Mi-III, Mi-VI och Mi-X beror på omarrangemang av glykoforin A och B i ordningen GlyA (alfa)-GlyB (delta)-GlyA (alfa). Mil-IX däremot är en omvänd alfa-delta-alfa-hybridgen. Mi-V, MiV(JL) och St ^a beror på ojämlik men homolog korsning mellan alfa- och deltaglykoforingener. MiV- och MiV(JL)-generna är arrangerade i samma 5'-alfa-delta 3'-ram medan St ^a- genen är i en reciprok 5'delta-alfa-3'-konfiguration.

Även om det är ovanligt hos kaukasier (0,0098 %) och japaner (0,006 %), är frekvensen av Mi-III exceptionellt hög i flera taiwanesiska aboriginalstammar (upp till 90 %). Däremot är frekvensen 2-3 % i Han-taiwanesiska (Minnan). Mi-III-fenotypen förekommer hos 6,28 % av kineserna i Hongkong.

Mi-IX (MNS32) förekommer med en frekvens på 0,43 % i Danmark .

Stones antigen

Stenar (St ^a ) har visat sig vara produkten av en hybridgen vars 5'-hälften härrör från glykoforin B medan 3'-halvan härrör från glykoforin A. Flera isoformer är kända. Detta antigen anses nu vara en del av Miltenberger-komplexet.

Satt antigen

Ett besläktat antigen är Sat. Denna gen har sex exoner av vilka exon I till exon IV är identiska med N-allelen av glykoforin A medan dess 3'-del, inklusive exon V och exon VI, härrör från glykoforin B-genen. Det mogna proteinet SAT-proteinet innehåller 104 aminosyrarester.

Orissa antigen

Orriss (Or) verkar vara en mutant av glyforin A men dess exakta natur har ännu inte fastställts.

Transfusionsreaktioner

Både anti-S och anti-s har varit inblandade i transfusionsreaktioner och hemolytisk sjukdom hos det nyfödda barnet. Anti-M, även om det förekommer naturligt, har sällan varit inblandat i transfusionsreaktioner. Anti-N anses inte orsaka transfusionsreaktioner. Allvarliga reaktioner har rapporterats med anti-U och anti-Miltenberger. Anti Mi-I (Vw) och Mi-III har erkänts som orsak till hemolytisk sjukdom hos nyfödda. Raddon har associerats med allvarliga transfusionsreaktioner.

Andra områden

Glykoforin B fungerar som en receptor för erytrocytbindande ligand (EBl-1) av Plasmodium falciparum involverad i malaria. Både Dantu- och SsU-cellernas fenotyper har visat sig vara skyddande mot P. falciparum- infektion medan Henshaw-fenotypen inte är skyddande.

Influensa A och B binder till glykoforin B.

Vidare läsning

•    Blumenfeld OO, Huang CH (1996). "Molekylär genetik för glykoforingenfamiljen, antigenerna för MNSs blodgrupper: multipla genomarrangemang och modulering av användning av skarvställen resulterar i omfattande diversifiering". Brum. Mutat . 6 (3): 199–209. doi : 10.1002/humu.1380060302 . PMID 8535438 . S2CID 34245274 .
•   Blumenfeld OO, Huang CH (1997). "Molekylär genetik av glykoforin MNS-varianter". Transfusion Clinique et Biologique . 4 (4): 357–65. doi : 10.1016/s1246-7820(97)80041-9 . PMID 9269716 .
•   Huang CH, Spruell P, Moulds JJ, Blumenfeld OO (1992). "Molekylär grund för det humana erytrocytglykoforinet som specificerar Miltenberger klass I (MiI) fenotyp" . Blod . 80 (1): 257–63. doi : 10.1182/blod.V80.1.257.257 . PMID 1611092 .
•   Rearden A, Phan H, Dubnicoff T, et al. (1990). "Identifiering av övergångspunkten för en hybridgen som kodar för human glykoforinvariant Sta. Likhet med övergångspunkten i haptoglobinrelaterade gener" . J. Biol. Chem . 265 (16): 9259–63. doi : 10.1016/S0021-9258(19)38841-6 . PMID 1971625 .
•   Huang CH, Blumenfeld OO (1991). "Identifiering av rekombinationshändelser som resulterar i tre hybridgener som kodar för humana MiV, MiV(JL) och Sta-glykoforiner" . Blod . 77 (8): 1813–20. doi : 10.1182/blod.V77.8.1813.1813 . PMID 2015404 .
•   Huang CH, Blumenfeld OO (1991). "Molekylär genetik av humana erytrocyter MiIII och MiVI glykoforiner. Användning av ett pseudoexon i konstruktion av två delta-alfa-delta hybridgener vilket resulterar i antigen diversifiering" . J. Biol. Chem . 266 (11): 7248–55. doi : 10.1016/S0021-9258(20)89637-9 . PMID 2016325 .
•   Kudo S, Fukuda M (1990). "Identifiering av ett nytt humant glykoforin, glykoforin E, genom isolering av genomiska kloner och komplementära DNA-kloner med användning av polymeraskedjereaktion" . J. Biol. Chem . 265 (2): 1102–10. doi : 10.1016/S0021-9258(19)40164-6 . PMID 2295603 .
•    Kudo S, Fukuda M (1989). "Strukturell organisation av glykoforin A- och B-gener: glykoforin B-genen utvecklad genom homolog rekombination vid Alu-upprepningssekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (12): 4619–23. Bibcode : 1989PNAS...86.4619K . doi : 10.1073/pnas.86.12.4619 . PMC 287322 . PMID 2734312 .
•    Tate CG, Tanner MJ (1988). "Isolering av cDNA-kloner för humana erytrocytmembran-sialoglykoproteiner alfa och delta" . Biochem. J . 254 (3): 743–50. doi : 10.1042/bj2540743 . PMC 1135146 . PMID 3196288 .
•    Siebert PD, Fukuda M (1987). "Molekylär kloning av ett humant glykoforin B cDNA: nukleotidsekvens och genomiskt förhållande till glykoforin A." Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 84 (19): 6735–9. Bibcode : 1987PNAS...84.6735S . doi : 10.1073/pnas.84.19.6735 . PMC 299158 . PMID 3477806 .
•   Blanchard D, Dahr W, Hummel M, et al. (1987). "Glykoforiner B och C från humana erytrocytmembran. Rening och sekvensanalys" . J. Biol. Chem . 262 (12): 5808–11. doi : 10.1016/S0021-9258(18)45646-3 . PMID 3571235 .
•   Dahr W, Beyreuther K, Moulds J, Unger P (1987). "Hybridglykoforiner från humana erytrocytmembran. I. Isolering och fullständig strukturell analys av hybridsialoglykoproteinet från Dantu-positiva röda blodkroppar av NE-varianten". Eur. J. Biochem . 166 (1): 31–6. doi : 10.1111/j.1432-1033.1987.tb13479.x . PMID 3595615 .
•   Onda M, Fukuda M (1995). "Detaljerad fysisk kartläggning av generna som kodar för glykoforinerna A, B och E, som avslöjats av P1-plasmider som innehåller humant genomiskt DNA". Gene . 159 (2): 225–30. doi : 10.1016/0378-1119(95)00075-H . PMID 7622054 .
•   Kudo S, Onda M, Fukuda M (1995). "Karakterisering av glykoforin A-transkript: kontroll av den vanliga erytroidspecifika promotorn och alternativ användning av olika polyadenyleringssignaler". J. Biochem . 116 (1): 183–92. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124492 . PMID 7798177 .
•   Rahuel C, Elouet JF, Cartron JP (1995). "Post-transkriptionell reglering av cellytuttrycket av glykoforiner A, B och E." J. Biol. Chem . 269 ​​(52): 32752–8. doi : 10.1016/S0021-9258(20)30055-7 . PMID 7806496 .
•   Huang CH, Reid ME, Blumenfeld OO (1994). "Ombyggnad av transmembransegmentet i humant glykoforin genom avvikande RNA-skarvning" . J. Biol. Chem . 269 ​​(14): 10804–12. doi : 10.1016/S0021-9258(17)34131-5 . PMID 8144668 .
•   Huang CH, Lomas C, Daniels G, Blumenfeld OO (1994). "Glykoforin He(Sta) i det mänskliga röda blodkroppsmembranet kodas av en komplex hybridgen som är ett resultat av två rekombinationshändelser" . Blod . 83 (11): 3369–76. doi : 10.1182/blod.V83.11.3369.3369 . PMID 8193374 .
•   Huang CH, Reid ME, Blumenfeld OO (1993). "Exon-hoppning orsakad av DNA-rekombination som introducerar ett defekt donatorsplitsningsställe i den humana glykoforin A-genen" . J. Biol. Chem . 268 (7): 4945–52. doi : 10.1016/S0021-9258(18)53487-6 . PMID 8444872 .
•    Cherif-Zahar B, Raynal V, Gane P, et al. (1996). "Kandidatgen som fungerar som en suppressor av RH-lokuset i de flesta fall av Rh-brist". Nat. Genet . 12 (2): 168–73. doi : 10.1038/ng0296-168 . PMID 8563755 . S2CID 1999844 .

externa länkar

• GYPB+protein,+human vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .