Trombomodulin

THBD
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, AHUS6, BDCA3, CD141, THPH12, THRM, TM, trombomodulin, BDCA-3
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Trombomodulin ( TM ), CD 141 eller BDCA-3 är ett integrerat membranprotein som uttrycks på ytan av endotelceller och fungerar som en kofaktor för trombin . Det minskar blodkoagulationen genom att omvandla trombin till ett antikoagulerande enzym från ett prokoagulerande enzym. Trombomodulin uttrycks också på humana mesotelceller , monocyter och en undergrupp av dendritiska celler .

Genetik och struktur

Hos människor kodas trombomodulin av THBD -genen . Proteinet har en molekylmassa på 74k Da och består av en enkel kedja med sex tandem upprepade EGF-liknande domäner , en serin / treoninrik spacer och en transmembrandomän . Det är en medlem av C-typ lektindomän (CTLD) grupp 14 familjen.

Fungera

Trombomodulin fungerar som en kofaktor i den trombininducerade aktiveringen av protein C i den antikoagulerande vägen genom att bilda ett 1:1 stökiometriskt komplex med trombin. Detta ökar hastigheten för protein C-aktivering tusenfaldigt. Trombomodulinbundet trombin har samtidigt prokoagulerande effekt genom att hämma fibrinolys genom att klyva trombinaktiverbar fibrinolysinhibitor (TAFI, aka karboxipeptidas B2) till dess aktiva form.

Trombomodulin är ett glykoprotein på ytan av endotelceller som, förutom att binda trombin, reglerar C3b-inaktivering av faktor I. Mutationer i trombomodulingenen (THBD) har också rapporterats vara associerade med atypiskt hemolytiskt-uremiskt syndrom (aHUS).

Antigenet som beskrivs som BDCA-3 har visat sig vara identiskt med trombomodulin . Således avslöjades det att denna molekyl också förekommer på en mycket sällsynt (0,02%) undergrupp av mänskliga dendritiska celler som kallas MDC2. Dess funktion på dessa celler är okänd.

Interaktioner

Trombomodulin har visats interagera med trombin .

Vidare läsning

•    Esmon CT (juli 1995). "Trombomodulin som en modell av molekylära mekanismer som modulerar proteasspecificitet och funktion vid kärlytan". FASEB Journal . 9 (10): 946–955. doi : 10.1096/fasebj.9.10.7615164 . PMID 7615164 . S2CID 19565674 .
•   Ohlin AK, Norlund L, Marlar RA (juli 1997). "Trombomodulingenvariationer och tromboembolisk sjukdom". Trombos och hemostas . 78 (1): 396–400. doi : 10.1055/s-0038-1657559 . PMID 9198186 .
•   Van de Wouwer M, Collen D, Conway EM (augusti 2004). "Trombomodulin-protein C-EPCR-system: integrerat för att reglera koagulation och inflammation" . Åderförkalkning, trombos och kärlbiologi . 24 (8): 1374–1383. doi : 10.1161/01.ATV.0000134298.25489.92 . PMID 15178554 .
•   Boffa MC, Jackman RW, Peyri N, Boffa JF, George B (1991). "Trombomodulin i det centrala nervsystemet". Nouvelle Revue Française d'Hématologie . 33 (6): 423–429. PMID 1667949 .
•    Jackman RW, Beeler DL, Fritze L, Soff G, Rosenberg RD (september 1987). "Human trombomodulingenen är intronutarmad: nukleinsyrasekvenser av cDNA:t och genen förutsäger proteinstruktur och föreslår ställen för regulatorisk kontroll" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 84 (18): 6425–6429. Bibcode : 1987PNAS...84.6425J . doi : 10.1073/pnas.84.18.6425 . PMC 299089 . PMID 2819876 .
•    Suzuki K, Kusumoto H, Deyashiki Y, Nishioka J, Maruyama I, Zushi M, et al. (juli 1987). "Struktur och uttryck av humant trombomodulin, en trombinreceptor på endotel som fungerar som en kofaktor för protein C-aktivering" . EMBO Journal . 6 (7): 1891–1897. doi : 10.1002/j.1460-2075.1987.tb02448.x . PMC 553573 . PMID 2820710 .
•   Wen DZ, Dittman WA, Ye RD, Deaven LL, Majerus PW, Sadler JE (juli 1987). "Humant trombomodulin: fullständig cDNA-sekvens och kromosomlokalisering av genen". Biokemi . 26 (14): 4350–4357. doi : 10.1021/bi00388a025 . PMID 2822087 .
•    Shirai T, Shiojiri S, Ito H, Yamamoto S, Kusumoto H, Deyashiki Y, et al. (februari 1988). "Genstruktur av humant trombomodulin, en kofaktor för trombinkatalyserad aktivering av protein C". Journal of Biochemistry . 103 (2): 281–285. CiteSeerX 10.1.1.1006.6759 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122261 . PMID 2836377 .
•   Yonezawa S, Maruyama I, Tanaka S, Nakamura T, Sato E (augusti 1988). "Immunohistokemisk lokalisering av trombomodulin i korioniska sjukdomar i livmodern och koriokarcinom i magen. En jämförande studie med fördelningen av humant koriongonadotropin" . Cancer . 62 (3): 569–576. doi : 10.1002/1097-0142(19880801)62:3<569::AID-CNCR2820620322>3.0.CO;2-T . PMID 2839283 .
•    Ishii H, Majerus PW (december 1985). "Trombomodulin finns i human plasma och urin" . The Journal of Clinical Investigation . 76 (6): 2178–2181. doi : 10.1172/JCI112225 . PMC 424339 . PMID 3001144 .
•   Adler M, Seto MH, Nitecki DE, Lin JH, Light DR, Morser J (oktober 1995). "Strukturen av ett fragment med 19 rester från C-loopen av den fjärde epidermala tillväxtfaktorliknande domänen av trombomodulin" . Journal of Biological Chemistry . 270 (40): 23366–23372. doi : 10.1074/jbc.270.40.23366 . PMID 7559494 .
•   Ohlin AK, Marlar RA (januari 1995). "Den första mutationen som identifierades i trombomodulingenen hos en 45-årig man med tromboembolisk sjukdom. " Blod . 85 (2): 330–336. doi : 10.1182/blod.V85.2.330.330 . PMID 7811989 .
•   Srinivasan J, Hu S, Hrabal R, Zhu Y, Komives EA, Ni F (november 1994). "Trombinbunden struktur av en EGF-subdomän från humant trombomodulin bestämt av överförda nukleära Overhauser-effekter". Biokemi . 33 (46): 13553–13560. doi : 10.1021/bi00250a007 . PMID 7947766 .
•    Gerlitz B, Hassell T, Vlahos CJ, Parkinson JF, Bang NU, Grinnell BW (oktober 1993). "Identifiering av det dominerande fäststället för glykosaminoglykan i lösligt rekombinant humant trombomodulin: potentiell reglering av funktionalitet genom glykosyltransferaskonkurrens för serine474" . The Biochemical Journal . 295 (1): 131–140. doi : 10.1042/bj2950131 . PMC 1134829 . PMID 8216207 .
•   Yasuda K, Espinosa R, Davis EM, Le Beau MM, Bell GI (september 1993). "Humana somatostatinreceptorgener: lokalisering av SSTR5 till human kromosom 20p11.2". Genomik . 17 (3): 785–786. doi : 10.1006/geno.1993.1410 . PMID 8244401 .
•   Yamamoto S, Mizoguchi T, Tamaki T, Ohkuchi M, Kimura S, Aoki N (april 1993). "Trombomodulin i urin, dess isolering och karakterisering". Journal of Biochemistry . 113 (4): 433–440. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124063 . PMID 8390446 .
•    Meininger DP, Hunter MJ, Komives EA (september 1995). "Syntes, aktivitet och preliminär struktur för den fjärde EGF-liknande domänen av trombomodulin" . Proteinvetenskap . 4 (9): 1683–1695. doi : 10.1002/pro.5560040904 . PMC 2143218 . PMID 8528067 .
•    Maglott DR , Feldblyum TV, Durkin AS, Nierman WC (maj 1996). "Strålningshybridkartläggning av SNAP, PCSK2 och THBD (human kromosom 20p)". Däggdjurs genom . 7 (5): 400–401. doi : 10.1007/s003359900120 . PMID 8661740 . S2CID 34951074 .

externa länkar

• GeneReviews/NCBI/NIH/UW-post om atypiskt hemolytiskt-uremiskt syndrom
• OMIM-poster om atypiskt hemolytiskt-uremiskt syndrom