Flik endonukleas
Flap-endonukleaser (FEN, även känd som 5'-durgs i äldre referenser) är en klass av nukleolytiska enzymer som fungerar som både 5'-3'- exonukleaser och strukturspecifika endonukleaser på specialiserade DNA-strukturer som uppstår under de biologiska processerna för DNA-replikation , DNA-reparation och DNA-rekombination. Flap-endonukleaser har identifierats i eukaryoter , prokaryoter , archaea och vissa virus . Organismer kan ha mer än en FEN- homolog ; denna redundans kan ge en indikation på betydelsen av dessa enzymer. I prokaryoter finns FEN-enzymet som en N-terminal domän av DNA-polymeras I, men vissa prokaryoter verkar koda för en andra homolog.
Endonukleasaktiviteten hos FEN identifierades initialt som verkande på en DNA-duplex som har ett enkelsträngat 5'-överhäng på en av strängarna (benämnt en "5'-flik", därav namnet flik-endonukleas). FENs katalyserar hydrolytisk klyvning av fosfodiesterbindningen vid föreningspunkten mellan enkel- och dubbelsträngat DNA. Vissa FEN kan också fungera som 5'-3'-exonukleaser på 5'-änden av fliksträngen och på DNA - substrat med "nickar" .
Proteinstrukturmodeller baserade på röntgenkristallografidata tyder på att FEN har en flexibel båge skapad av två α-helixar genom vilka den enda 5'-strängen av 5'-flikstrukturen kan träs.
Flap-endonukleaser har använts inom bioteknik , till exempel Taqman PCR -analysen och Invader-analysen för mutation och detektion av singelnukleotidpolymorfism (SNP).
Se även
externa länkar
Extern länk Flap endonukleaser, 5'-3' exonukleaser och 5' nukleaser
