HLA-A34

HLA-A34
( MHC Klass I , A cellytantigen)
Illustration HLA-A.png
HLA-A34
Om
Protein transmembranreceptor / ligand
Strukturera aP- heterodimer
Underenheter HLA-A *34--, p2 - mikroglobulin
Äldre namn A10
Undertyper
Undertyp
allel
Tillgängliga strukturer
A34.1
A34.2
{{{cNick3}}}
{{{cNick4}}}
Alleler länkar ut till IMGT/HLA databas på EBI

HLA-A34 (A34) är en serotyp av human leukocytantigen inom HLA-A- serotypgruppen. Serotypen bestäms av antikroppsigenkänning av α 34 underuppsättning av HLA-A α-kedjor. För A34 kodas alfa-"A"-kedjan av HLA-A *34 -allelgruppen och p-kedjan kodas av B2M - lokus . A34 och A *34 är nästan synonyma i betydelse. A34 är ett delat antigen av den breda antigenet serotyp A10 . A34 är en systerserotyp av A25 , A26 , A43 och A66 .

A34 är mest lik A66 ..

Serotyp

A34-igenkänning av vissa HLA A*34-genprodukter
A*34 A34 10: a Prov
allel % % storlek (N)
*3401 67 5 269
*3402 89 2 996

A34 serotypning är blygsam..

A34 allelfrekvenser

A*3401

HLA A*3401 frekvenser
frekv
ref. Befolkning (%)
Kimberly (Indig. Österrike) 68,1
Yuendumu (Indig. Österrike) 44,0
Groote Eylandt (Indig. Österrike) 32,0
Rabaul (New Britain, PNG) 30.2
West Schrader Ranges (PNG) 29.2
Cape York Penin. (Indig. Österrike) 29.1
Ami (Indig. Taiwan) 21.9
Goroka (E. Highlands, PNG) 20.5
Nya Kaledonien 15.5
Madang (PNG) 13.6
Ivatan (N. Islands, Filippinerna) 13,0
Wanigela (PNG) 12.7
Amerikanska Samoa 10,0
Wosera (PNG) 9,0
Riau Malay (Singapore) 6,0
Karimui Plateau (PNG) 4.8
Puyuma (Indig. Taiwan) 4.0
javanesiska (Singapore) 3.0
Spanien Katalonien Girona 1.1
Thai (Singapore) 1.0
Paiwan (Indig. Taiwan) 1.0
Taiwan Hakka 0,9
Kenya 0,7
Thailand 0,7
Kina södra Han 0,5
Indien norra Delhi 0,5
kinesiska (Hongkong) 0,3
kinesiska (Singapore) 0,3
Zimbabwe Harare Shona 0,2

A*3401 när den hittas utanför Afrika finns främst i Sydasien , Austronesien och den södra/centrala delen av West Pacific Rim (WPR). Det verkar ha kommit till östra Taiwans inhemska stammar (Ami, Yami ) men inte längre norr om denna region. Det har inte upptäckts i något provtagning från Japan . Över större delen av regionen East Pacific Rim där den finns är den begränsad till 1 eller 2 vanliga haplotyper i stark kopplingsojämvikt. Detta indikerar att dess närvaro i WPR-regionen är resultatet av de senaste migrationerna.

A*3401-migrationen från Afrika stöds av dess närvaro i Östafrika och Sydafrika och av nuvarande modeller för mänsklig migration , denna allel var sannolikt representerad i den första vågen av invandrare. Men i områden där blandningar av dessa alleler är vanliga, Persiska viken och Indien, är A*3401 relativt ovanlig, knapphändig eller saknas. Undantaget är Saudiarabien , där A34 ligger på 2,8 % och bland israeliska judar på 8,8 %. Vissa rapporter om att både A*3401 och A*3402 är i regionen, men tveksamt om dessa är ständigt upprätthållna allelfrekvenser är helt enkelt nyligen invandrade.

A*3402

HLA A*3402 frekvenser
frekv
ref. Befolkning (%)
Natal Zulu (S. Afrika) 5.5
Guinea Bissau 5.4
Bandiagara (Mali) 3.6
Shona (Zimbabwe) 3.3
Kenya 2.8
Tunisien Tunis 2.8
Uganda Kampala 2.8
Kamerun Bamileke 2.6
Senegal Niokholo Mandenka 2.2
Marocko Nador Metalsa 2.1
Zambia Lusaka 1.2
sudanesiska 1.0
Israel Arab Druse 0,5
Frankrike sydöstra 0,4
Jordan Amman 0,3
England Lancaster 0,1
Irland norra 0,1

A*3402 finns mer frekvent i väster, den finns i Iberien och längs Medelhavet, men dess frekvens är låg, undantaget kan vara i Levanten, men det är oklart om detta är A*3401 eller A*3402.

A34-B Haplotyper

A34 är i stark kopplingsojämvikt i många delar av världen, men särskilt Sydostasien och Oceanien . Den mest framträdande av dessa haplotyper är A34-Cw11(1)-B56. Denna haplotyp finns från västra Australien till Taiwan till Nya Zeeland , vilket indikerar en nyligen genetisk koppling mellan dessa folk.

En annan ofta hittad haplotyp är haplotypen A34-B61 (A*3401:Cw*04:B*B4002). Denna haplotyp har en liknande fördelning som A34-B56.

Dessa haplotyper indikerar att långväga/övervakande migrationer ägde rum i Austronesias (sen paleolitiska) förhistoria.


HLA A34-Cw11-B56 A*3401:Cw*0102:B*5601
frekv
ref. Befolkning (%)
Ami (Indig. Taiwan) 19.9
Highlanders (PNG) 10.6
Maori (Nya Zeeland) 5.6
Ursprungsbefolkningen Australien 4.1
Puyuma (Indig. Taiwan) 4.0