HLA-A34
HLA-A34 | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
( MHC Klass I , A cellytantigen) | ||||||||||||||||
Om | ||||||||||||||||
Protein | transmembranreceptor / ligand | |||||||||||||||
Strukturera | aP- heterodimer | |||||||||||||||
Underenheter | HLA-A *34--, p2 - mikroglobulin | |||||||||||||||
Äldre namn | A10 | |||||||||||||||
Undertyper | ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
Alleler länkar ut till IMGT/HLA databas på EBI |
HLA-A34 (A34) är en serotyp av human leukocytantigen inom HLA-A- serotypgruppen. Serotypen bestäms av antikroppsigenkänning av α 34 underuppsättning av HLA-A α-kedjor. För A34 kodas alfa-"A"-kedjan av HLA-A *34 -allelgruppen och p-kedjan kodas av B2M - lokus . A34 och A *34 är nästan synonyma i betydelse. A34 är ett delat antigen av den breda antigenet serotyp A10 . A34 är en systerserotyp av A25 , A26 , A43 och A66 .
A34 är mest lik A66 ..
Serotyp
A*34 | A34 | 10: a | Prov |
allel | % | % | storlek (N) |
*3401 | 67 | 5 | 269 |
*3402 | 89 | 2 | 996 |
A34 serotypning är blygsam..
A34 allelfrekvenser
A*3401
frekv | ||
ref. | Befolkning | (%) |
Kimberly (Indig. Österrike) | 68,1 | |
Yuendumu (Indig. Österrike) | 44,0 | |
Groote Eylandt (Indig. Österrike) | 32,0 | |
Rabaul (New Britain, PNG) | 30.2 | |
West Schrader Ranges (PNG) | 29.2 | |
Cape York Penin. (Indig. Österrike) | 29.1 | |
Ami (Indig. Taiwan) | 21.9 | |
Goroka (E. Highlands, PNG) | 20.5 | |
Nya Kaledonien | 15.5 | |
Madang (PNG) | 13.6 | |
Ivatan (N. Islands, Filippinerna) | 13,0 | |
Wanigela (PNG) | 12.7 | |
Amerikanska Samoa | 10,0 | |
Wosera (PNG) | 9,0 | |
Riau Malay (Singapore) | 6,0 | |
Karimui Plateau (PNG) | 4.8 | |
Puyuma (Indig. Taiwan) | 4.0 | |
javanesiska (Singapore) | 3.0 | |
Spanien Katalonien Girona | 1.1 | |
Thai (Singapore) | 1.0 | |
Paiwan (Indig. Taiwan) | 1.0 | |
Taiwan Hakka | 0,9 | |
Kenya | 0,7 | |
Thailand | 0,7 | |
Kina södra Han | 0,5 | |
Indien norra Delhi | 0,5 | |
kinesiska (Hongkong) | 0,3 | |
kinesiska (Singapore) | 0,3 | |
Zimbabwe Harare Shona | 0,2 |
A*3401 när den hittas utanför Afrika finns främst i Sydasien , Austronesien och den södra/centrala delen av West Pacific Rim (WPR). Det verkar ha kommit till östra Taiwans inhemska stammar (Ami, Yami ) men inte längre norr om denna region. Det har inte upptäckts i något provtagning från Japan . Över större delen av regionen East Pacific Rim där den finns är den begränsad till 1 eller 2 vanliga haplotyper i stark kopplingsojämvikt. Detta indikerar att dess närvaro i WPR-regionen är resultatet av de senaste migrationerna.
A*3401-migrationen från Afrika stöds av dess närvaro i Östafrika och Sydafrika och av nuvarande modeller för mänsklig migration , denna allel var sannolikt representerad i den första vågen av invandrare. Men i områden där blandningar av dessa alleler är vanliga, Persiska viken och Indien, är A*3401 relativt ovanlig, knapphändig eller saknas. Undantaget är Saudiarabien , där A34 ligger på 2,8 % och bland israeliska judar på 8,8 %. Vissa rapporter om att både A*3401 och A*3402 är i regionen, men tveksamt om dessa är ständigt upprätthållna allelfrekvenser är helt enkelt nyligen invandrade.
A*3402
frekv | ||
ref. | Befolkning | (%) |
Natal Zulu (S. Afrika) | 5.5 | |
Guinea Bissau | 5.4 | |
Bandiagara (Mali) | 3.6 | |
Shona (Zimbabwe) | 3.3 | |
Kenya | 2.8 | |
Tunisien Tunis | 2.8 | |
Uganda Kampala | 2.8 | |
Kamerun Bamileke | 2.6 | |
Senegal Niokholo Mandenka | 2.2 | |
Marocko Nador Metalsa | 2.1 | |
Zambia Lusaka | 1.2 | |
sudanesiska | 1.0 | |
Israel Arab Druse | 0,5 | |
Frankrike sydöstra | 0,4 | |
Jordan Amman | 0,3 | |
England Lancaster | 0,1 | |
Irland norra | 0,1 |
A*3402 finns mer frekvent i väster, den finns i Iberien och längs Medelhavet, men dess frekvens är låg, undantaget kan vara i Levanten, men det är oklart om detta är A*3401 eller A*3402.
A34-B Haplotyper
A34 är i stark kopplingsojämvikt i många delar av världen, men särskilt Sydostasien och Oceanien . Den mest framträdande av dessa haplotyper är A34-Cw11(1)-B56. Denna haplotyp finns från västra Australien till Taiwan till Nya Zeeland , vilket indikerar en nyligen genetisk koppling mellan dessa folk.
En annan ofta hittad haplotyp är haplotypen A34-B61 (A*3401:Cw*04:B*B4002). Denna haplotyp har en liknande fördelning som A34-B56.
Dessa haplotyper indikerar att långväga/övervakande migrationer ägde rum i Austronesias (sen paleolitiska) förhistoria.
frekv | ||
ref. | Befolkning | (%) |
Ami (Indig. Taiwan) | 19.9 | |
Highlanders (PNG) | 10.6 | |
Maori (Nya Zeeland) | 5.6 | |
Ursprungsbefolkningen Australien | 4.1 | |
Puyuma (Indig. Taiwan) | 4.0 |