HLA-A3

HLA-A3
( MHC Klass I , A cellytantigen)
Illustration HLA-A.png
HLA-A3
Om
Protein transmembranreceptor / ligand
Strukturera aP- heterodimer
Underenheter HLA-A *03--, p2 - mikroglobulin
Äldre namn HL-A3
Undertyper
Undertyp
allel
Tillgängliga strukturer
A3.1
A3.2
Sällsynta alleler
Undertyp
allel
Tillgängliga strukturer
A3.5
Alleler länkar ut till IMGT/HLA databas på EBI

HLA-A3 (A3) är en serotyp av human leukocytantigen inom HLA-A- serotypgruppen. Serotypen bestäms av antikroppsigenkänning av a3- underuppsättning av HLA-A-a-kedjor. För A3 kodas alfa, "A", kedjan av HLA-A *03 allelgruppen och p-kedjan kodas av B2M locus . Denna grupp domineras för närvarande av A*03:01. A3 och A *03 är nästan synonyma i betydelse. A3 är vanligare i Europa, det är en del av den längsta kända multigenhaplotypen, A3 ~B7~DR15~DQ6.

Serotyp

A3-igenkänning av vissa HLA A*03-genprodukter
A*03 A3 Prov
allel % storlek (N)
*03:01 99 3504
*03:02 78 342
*03:05 20 5

A3 består huvudsakligen av A*03:01 och *03:02 som serotypar väl med anti-A3-antikroppar. Det finns 26 icke-synonyma varianter av A*03, 4 null- och 22 proteinvarianter.

Associerade sjukdomar

A3-serotyp är en sekundär riskfaktor för myasthenia gravis och lägre CD8 + -nivåer hos patienter med hemokromatos . HFE (Hemochromatos) locus ligger mellan A3 och B7 inom A3~DQ6 superhaplotypen.

I HIV

HLA-A3 väljer HIV-evolution för en mutation Gag KK9-epitop och resulterar i en snabb minskning av CD8 T-cellssvaret. CD8 T-celler är ansvariga för att snabbt döda HIV-infekterade CD4+-celler. Denna typ av utvecklat svar kanske inte är specifikt för HLA-A3 och eftersom HIV kan anpassa sig snabbt in situ till selektiva faktorer.


Alleler

HLA A*03:01 frekvenser
Studera befolkning
  Frekv. (i %)
Finland 25,0
Indien Tamil Nadu Nadar 20.5
Tjeckien 18.9
Belgien 17.1
Irland norra 14.3
Australien New South Wales 13.8
Georgia Svaneti Svans 13.8
Georgien Tbilisi Georgisk… 13.8
Pakistan Burusho 13,0
Kap Verde Northwestern I... 12,0
Södra Irland 11.6
rumänska 11.6
Kroatien 11.0
USA kaukasier (3) 10.8
Nord Italien (1) 9.7
USA afroamerikaner (2) 9.4
Indien Mumbai Marathas 9.3
Indien West Bhils 9,0
Portugal Center 9,0
Pakistan Pathan 8.7
Kamerun Beti 8.6
Kamerun Bamileke 7.8
Pakistan Kalash 7.5
Saudiarabien Guraiat och … 7.5
USA spansktalande 7.3
Indien norra Delhi 7.2
Madeira 7,0
Ryssland Tuva (2) 6.9
Tunisien 6.7
USA:s nordamerikanska infödda… 6.7
Kap Verde sydöstra I… 6.5
Azorerna Santa Maria och Sa… 6.4
Pakistan Baloch 6.3
Guinea Bissau 6.2
Israel Arab Druse 6,0
Sydafrikanska Natal Zulu 6,0
USA South Texas Hispanics 6,0
Indien norra hinduer 5.8
Zambia Lusaka 5.8
Iran Baloch 5.6
Uganda Kampala 5.5
Jordan Amman 5.2
Kenya 5.2
Brasilien 5.1
oman 5.1
Kamerun Pygmé Baka 5.0
Georgien Tbilisi kurder 5.0
sudanesiska 4.8
Bulgarien 4.6
Pakistan Brahui 4.6
Kina Peking 4.5
Australien Indig. Cape Yor... 4.4
Kina Inre Mongoliet 4.4
Mali Bandiagara 4.4
Pakistan Sindhi 4.4
Kina Qinghai Hui 4.1
Zimbabwe Harare Shona 4.0
Kamerun Sawa 3.8
Senegal Niokholo Mandenka 3.8
Kenya Luo 3.6
Marocko Nador Metalsa Cla… 3.4
Kenya Nandi 3.1
Mex. Guadalajara Mestizos... 3.1
Kina Guangzhou 2.9
Kina North Han 2.9
Mongoliet Buriat 2.9
Kina tibetaner 2.5
Kina Yunnan Nu 2.5
Mexikos mestiser 2.4
Amerikanska Samoa 2.0
Singapore Javanese Indone... 2.0
allelfrekvenser presenteras
HLA A*03:02 frekvenser
Studera befolkning
  Frekv. (i %)
Georgien Tbilisi kurder 8.3
Marocko Nador Metalsa Cla… 4.1
Pakistan Karachi Parsi 2.8
Israel Arab Druse 2.5
Indien New Delhi 2.3
sudanesiska 2.3
Indien norra Delhi 2.2
Indiens västkust Parsis 2.0
Portugal Center 2.0
Indien Andhra Pradesh Goll... 1.7
Pakistan Kalash 1.7
Pakistan Baloch 1.6
Georgien Tbilisi Georgisk… 1.4
Saudiarabien Guraiat och … 1.4
oman 1.3
Pakistan Sindhi 1.3
Indien norra hinduer 1.0
Pakistan Pathan 1.0
Sydafrika Natal Tamil 1.0
USA South Texas Hispanics 0,8
allelfrekvenser presenteras

Associerade sjukdomar

A*03:01 modulerar ökad risk för multipel skleros

A3~B haplotyper



A3-B7 är en del av A3~DQ2 superhaplotypen A3-B8 (Rumänien, svanS) A3~B35 (Bulgarien, Kroatien, E. Svarta havet) A3~B55 (E. Svarta havet)

A3~Cw7~B7

A3~B7 är bimodal i frekvens i Europa med en nod i Irland och den andra i Schweiz, relativt sett verkar Schweiz vara högre. A3~Cw7~B7 är en av de vanligaste multigenhaplotyperna i västvärlden, särskilt i Central- och Östeuropa.

A *03:01 ~ C *07:02 ~ B *07:02 ~ DRB1 *15:01 ~ DQA1 *01:02 ~ DQB1 *06:02