HLA-A3
HLA-A3 | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
( MHC Klass I , A cellytantigen) | ||||||||||
Om | ||||||||||
Protein | transmembranreceptor / ligand | |||||||||
Strukturera | aP- heterodimer | |||||||||
Underenheter | HLA-A *03--, p2 - mikroglobulin | |||||||||
Äldre namn | HL-A3 | |||||||||
Undertyper | ||||||||||
| ||||||||||
Sällsynta alleler | ||||||||||
| ||||||||||
Alleler länkar ut till IMGT/HLA databas på EBI |
HLA-A3 (A3) är en serotyp av human leukocytantigen inom HLA-A- serotypgruppen. Serotypen bestäms av antikroppsigenkänning av a3- underuppsättning av HLA-A-a-kedjor. För A3 kodas alfa, "A", kedjan av HLA-A *03 allelgruppen och p-kedjan kodas av B2M locus . Denna grupp domineras för närvarande av A*03:01. A3 och A *03 är nästan synonyma i betydelse. A3 är vanligare i Europa, det är en del av den längsta kända multigenhaplotypen, A3 ~B7~DR15~DQ6.
Serotyp
A*03 | A3 | Prov |
allel | % | storlek (N) |
*03:01 | 99 | 3504 |
*03:02 | 78 | 342 |
*03:05 | 20 | 5 |
A3 består huvudsakligen av A*03:01 och *03:02 som serotypar väl med anti-A3-antikroppar. Det finns 26 icke-synonyma varianter av A*03, 4 null- och 22 proteinvarianter.
Associerade sjukdomar
A3-serotyp är en sekundär riskfaktor för myasthenia gravis och lägre CD8 + -nivåer hos patienter med hemokromatos . HFE (Hemochromatos) locus ligger mellan A3 och B7 inom A3~DQ6 superhaplotypen.
I HIV
HLA-A3 väljer HIV-evolution för en mutation Gag KK9-epitop och resulterar i en snabb minskning av CD8 T-cellssvaret. CD8 T-celler är ansvariga för att snabbt döda HIV-infekterade CD4+-celler. Denna typ av utvecklat svar kanske inte är specifikt för HLA-A3 och eftersom HIV kan anpassa sig snabbt in situ till selektiva faktorer.
Alleler
Studera befolkning |
Frekv. (i %) |
---|---|
Finland | 25,0 |
Indien Tamil Nadu Nadar | 20.5 |
Tjeckien | 18.9 |
Belgien | 17.1 |
Irland norra | 14.3 |
Australien New South Wales | 13.8 |
Georgia Svaneti Svans | 13.8 |
Georgien Tbilisi Georgisk… | 13.8 |
Pakistan Burusho | 13,0 |
Kap Verde Northwestern I... | 12,0 |
Södra Irland | 11.6 |
rumänska | 11.6 |
Kroatien | 11.0 |
USA kaukasier (3) | 10.8 |
Nord Italien (1) | 9.7 |
USA afroamerikaner (2) | 9.4 |
Indien Mumbai Marathas | 9.3 |
Indien West Bhils | 9,0 |
Portugal Center | 9,0 |
Pakistan Pathan | 8.7 |
Kamerun Beti | 8.6 |
Kamerun Bamileke | 7.8 |
Pakistan Kalash | 7.5 |
Saudiarabien Guraiat och … | 7.5 |
USA spansktalande | 7.3 |
Indien norra Delhi | 7.2 |
Madeira | 7,0 |
Ryssland Tuva (2) | 6.9 |
Tunisien | 6.7 |
USA:s nordamerikanska infödda… | 6.7 |
Kap Verde sydöstra I… | 6.5 |
Azorerna Santa Maria och Sa… | 6.4 |
Pakistan Baloch | 6.3 |
Guinea Bissau | 6.2 |
Israel Arab Druse | 6,0 |
Sydafrikanska Natal Zulu | 6,0 |
USA South Texas Hispanics | 6,0 |
Indien norra hinduer | 5.8 |
Zambia Lusaka | 5.8 |
Iran Baloch | 5.6 |
Uganda Kampala | 5.5 |
Jordan Amman | 5.2 |
Kenya | 5.2 |
Brasilien | 5.1 |
oman | 5.1 |
Kamerun Pygmé Baka | 5.0 |
Georgien Tbilisi kurder | 5.0 |
sudanesiska | 4.8 |
Bulgarien | 4.6 |
Pakistan Brahui | 4.6 |
Kina Peking | 4.5 |
Australien Indig. Cape Yor... | 4.4 |
Kina Inre Mongoliet | 4.4 |
Mali Bandiagara | 4.4 |
Pakistan Sindhi | 4.4 |
Kina Qinghai Hui | 4.1 |
Zimbabwe Harare Shona | 4.0 |
Kamerun Sawa | 3.8 |
Senegal Niokholo Mandenka | 3.8 |
Kenya Luo | 3.6 |
Marocko Nador Metalsa Cla… | 3.4 |
Kenya Nandi | 3.1 |
Mex. Guadalajara Mestizos... | 3.1 |
Kina Guangzhou | 2.9 |
Kina North Han | 2.9 |
Mongoliet Buriat | 2.9 |
Kina tibetaner | 2.5 |
Kina Yunnan Nu | 2.5 |
Mexikos mestiser | 2.4 |
Amerikanska Samoa | 2.0 |
Singapore Javanese Indone... | 2.0 |
allelfrekvenser presenteras |
Studera befolkning |
Frekv. (i %) |
---|---|
Georgien Tbilisi kurder | 8.3 |
Marocko Nador Metalsa Cla… | 4.1 |
Pakistan Karachi Parsi | 2.8 |
Israel Arab Druse | 2.5 |
Indien New Delhi | 2.3 |
sudanesiska | 2.3 |
Indien norra Delhi | 2.2 |
Indiens västkust Parsis | 2.0 |
Portugal Center | 2.0 |
Indien Andhra Pradesh Goll... | 1.7 |
Pakistan Kalash | 1.7 |
Pakistan Baloch | 1.6 |
Georgien Tbilisi Georgisk… | 1.4 |
Saudiarabien Guraiat och … | 1.4 |
oman | 1.3 |
Pakistan Sindhi | 1.3 |
Indien norra hinduer | 1.0 |
Pakistan Pathan | 1.0 |
Sydafrika Natal Tamil | 1.0 |
USA South Texas Hispanics | 0,8 |
allelfrekvenser presenteras |
Associerade sjukdomar
A*03:01 modulerar ökad risk för multipel skleros
A3~B haplotyper
A3-B7 är en del av A3~DQ2 superhaplotypen A3-B8 (Rumänien, svanS) A3~B35 (Bulgarien, Kroatien, E. Svarta havet) A3~B55 (E. Svarta havet)
A3~Cw7~B7
A3~B7 är bimodal i frekvens i Europa med en nod i Irland och den andra i Schweiz, relativt sett verkar Schweiz vara högre. A3~Cw7~B7 är en av de vanligaste multigenhaplotyperna i västvärlden, särskilt i Central- och Östeuropa.
A *03:01 ~ C *07:02 ~ B *07:02 ~ DRB1 *15:01 ~ DQA1 *01:02 ~ DQB1 *06:02