Proteinsubenhet
Inom strukturbiologin är en proteinsubenhet en polypeptidkedja eller en enda proteinmolekyl som sätts samman (eller " sammonteras ") med andra för att bilda ett proteinkomplex . Stora samlingar av proteiner som virus använder ofta ett litet antal typer av proteinsubenheter som byggstenar.
En underenhet benämns ofta med en grekisk eller romersk bokstav, och siffrorna för denna typ av underenheter i ett protein anges med en sänkning. Till exempel ATP-syntas en typ av subenhet som kallas α. Tre av dessa finns i ATP-syntasmolekylen, vilket leder till beteckningen α 3 . Större grupper av subenheter kan också specificeras, som α3β3 - hexamer och c-ring .
Naturligt förekommande proteiner som har ett relativt litet antal subenheter kallas oligomera . Till exempel hemoglobin ett symmetriskt arrangemang av två identiska a-globinsubenheter och två identiska β-globinsubenheter. Längre multimera proteiner såsom mikrotubuli och andra cytoskelettproteiner kan bestå av ett mycket stort antal subenheter. Till exempel dynein ett multimert proteinkomplex som involverar två tunga kedjor (DHC), två mellanliggande kedjor (IC), två lätta mellankedjor (LIC) och flera lätta kedjor (LC).
Subenheterna i ett proteinkomplex kan vara identiska, homologa eller helt olika och dedikerade till olika uppgifter. I vissa proteinsammansättningar kan en subenhet vara en "katalytisk subenhet" som enzymatiskt katalyserar en reaktion, medan en "regulatorisk subenhet" kommer att underlätta eller hämma aktiviteten. Även om telomeras har telomeras omvänt transkriptas som en katalytisk subenhet, åstadkommes reglering av faktorer utanför proteinet.
Ett enzym som består av både regulatoriska och katalytiska subenheter när det är sammansatt kallas ofta för ett holoenzym . Till exempel klass I fosfoinositid 3-kinas sammansatt av en p110 katalytisk subenhet och en p85 regulatorisk subenhet. En subenhet är gjord av en polypeptidkedja . En polypeptidkedja har en gen som kodar för sig – vilket betyder att ett protein måste ha en gen för varje unik subenhet.