HLA-A68
| HLA-A68 | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ( MHC Class I , A cellyteantigen) | ||||||||||||||||
 Återger eller visar A*6801 (cyan) och Beta-2 mikroglobulin (ros). Det finns ingen bunden peptid i denna bild.
| ||||||||||||||||
| Handla om | ||||||||||||||||
| Protein | transmembranreceptor / ligand | |||||||||||||||
| Strukturera | aP- heterodimer | |||||||||||||||
| Underenheter | HLA-A *68--, p2 - mikroglobulin | |||||||||||||||
| Äldre namn | A28 | |||||||||||||||
| Undertyper | ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
| Sällsynta alleler | ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
| Alleler länkar ut till IMGT/HLA databas på EBI | ||||||||||||||||
HLA-A68 (A68) är en serotyp av human leukocytantigen inom HLA-A- serotypgruppen. Serotypen bestäms av antikroppsigenkänning av α 68 underuppsättning av HLA-A α-kedjor. För A68 kodas alfa-"A"-kedjan av HLA-A *68 -allelgruppen och p-kedjan kodas av B2M - lokus . A68 och A *68 är nästan synonyma i betydelse. A68 är ett delat antigen av den breda antigenet serotyp A28 . A68 är en systerserotyp till A69 .
A68 är vanligare i Nordamerika.
Serotyp
| A*68 | A68 | En 28 | En 69 | Prov |
| allel | % | % | % | storlek (N) |
| *6801 | 27 | 63 | 0 | 2736 |
A68 är dålig, med låg specifik detektion, hög ospecifik identifiering av A28.
Sjukdomsföreningar
Efter allel
A*68 är associerat med högre virusmängd i HIV . A68 kan vara skyddande mot symtomatisk hjärtsjukdom vid Chagas kardiomyopati.
Allelfrekvenser
| Studera befolkning |
Frekv. (i %) |
|---|---|
| Brasilien Terena | 25,0 |
| Mexiko Sonora Seri | 19.7 |
| USA Alaska Yupik Natives | 15.5 |
| Mexiko Mixtec Oaxaca | 13.7 |
| Indien Khandesh Pawra | 12,0 |
| Mexiko Zapotec Oaxaca | 11.2 |
| Burkina Faso Mossi | 9.4 |
| Mexiko Chihuahua State Ta… | 9.1 |
| Ecuador Cayapa | 9,0 |
| Sydafrika Natal Tamil | 8,0 |
| Pakistan Sindhi | 7.7 |
| Indien Mumbai Marathas | 7.5 |
| Pakistan Kalash | 7.5 |
| Indien Tamil Nadu Nadar | 7.4 |
| Senegal Niokolo Mandenka | 7,0 |
| Georgien Tbilisi kurder | 6.7 |
| Georgia Svaneti Svans | 6.3 |
| Mexikos mestiser | 6.1 |
| Indien West Bhils | 6,0 |
| Portugal Center | 6,0 |
| Belgien | 5.7 |
| Mexico Mixe Oaxaca | 5.6 |
| Saudiarabien Gurayat och … | 5.6 |
| USA:s nordamerikanska infödda… | 5.6 |
| USA South Texas Hispanics | 5.2 |
| Kamerun Pygmé Baka | 5.0 |
| Kap Verde Northwestern I… | 4.8 |
| Georgien Tbilisi Georgisk… | 4.8 |
| Kroatien | 4.7 |
| Finland | 4.5 |
| Skottland Orkney | 4.4 |
| oman | 4.3 |
| Marockos "berber" Nador Me... | 4.2 |
| Australien New South Wales | 4.1 |
| USA Afrikansk Amerika | 4.0 |
| Kina Inre Mongoliet | 3.9 |
| Guadalajara Mestizos (2) | 3.9 |
| Kamerun Sawa | 3.8 |
| Mali Bandiagara | 3.6 |
| Tunisien | 3.5 |
| Indien Andhra Pradesh Goll... | 3.4 |
| Södra Irland | 3.4 |
| Kamerun Beti | 3.2 |
| Pakistan Baloch | 3.2 |
| Burkina Faso Fulani | 3.1 |
| Indiens västkust Parsis | 3.0 |
| Israel Arab Druse | 3.0 |
| Japan Ainu Hokkaido | 3.0 |
| Sydafrikanska Natal Zulu | 3.0 |
| sudanesiska | 3.0 |
| USA kaukasiska | 3.0 |
| Indien norra hinduer | 2.9 |
| Pakistan Brahui | 2.9 |
| Uganda Kampala | 2.8 |
| Iran Baloch | 2.7 |
| Irland norra | 2.7 |
| rumänska | 2.6 |
| USA spansktalande | 2.6 |
| Brasilien | 2.5 |
| Frankrike sydöstra | 2.4 |
| Guinea Bissau | 2.3 |
| Spanien Katalonien Girona | 2.3 |
| Kina Peking | 2.2 |
| Frankrike Korsika | 2.0 |
| Singapore Javanesiska Indonesien | 2.0 |
| USA South Dakota Lakota Sioux | 2.0 |
| Bulgarien | 1.8 |
| Mongoliet Buryat | 1.7 |
| USA Arizona Pima | 1.7 |
| Spanien Östra Andalusien | 1.5 |
| Kenya | 1.4 |
| Kamerun Bamileke | 1.3 |
| Zimbabwe Harare Shona | 1.3 |
| Ryssland Tuva (2) | 1.1 |
| allelfrekvenser presenteras | |
A68 kan delas in i 3 alleler, *6801, *6802, *6803. *6801 kan också delas in i *680101 och *680102 (kallades tidigare *68011 och *68012).
A*6801
A*6801 är högre i vissa indiangrupper , sydasiatiska folk, afrikanska folk, men *6801 är på låga nivåer i större delen av Sydostasien, särskilt ursprungsbefolkningen. Detta återspeglas också av låga nivåer längs västra Stillahavsområdet inklusive Japan. Pausen för *6801 avbryts i norra Japan med den 3%-frekvens som finns i Ainu , som fortsätter att öka med arktiska folk och fall hos indianer. I västra Eurasiens nordliga regioner faller A*6801 av. I både Afrika och Nya Världen finns både A*680101 och A*680102. Även i den nya världen är A*680102 mer utbredd.
| frekv | ||
| ref. | Befolkning | (%) |
| Yucpa (Venezuela) | 37,2 | |
| Nandi (Kenya) | 11.6 | |
| Kenya | 10.5 | |
| Harare Shona (Zimbabwe) | 9.8 | |
| Natal Zulu (S. Afrika) | 9.5 | |
| Luo (Kenya) | 7.6 | |
| Mali Bandiagara | 6.2 | |
| sudanesiska | 5.5 | |
| Kampala (Uganda) | 5.2 | |
| Baka Pygmy (Kamerun) | 5.0 | |
| Mestis (Guadalajara, Mexiko) | 4.9 | |
| SEastern Isl (Kap Verde) | 4.8 | |
| Nador Metalsa (Marocko) | 4.8 | |
| Chiriguanos (Argentina) | 4.7 | |
| Mossi (Burkina Faso) | 4.7 | |
| Lusaka (Zambia) | 4.7 | |
| Bamileke (Kamerun) | 4.5 | |
| Sawa (Kamerun) | 3.8 | |
| Kalash (Pakistan) | 3.3 | |
| Beti (Kamerun) | 3.2 | |
| SE Frankrike | 3.1 | |
| Seri (Sonora, Mexiko) | 3.0 | |
| Yaounde (Kamerun) | 2.8 | |
| Tunisien | 2.5 | |
| Guinea Bissau | 2.3 | |
| Fulani (Burkina Faso) | 2.0 | |
| S. Portugal | 2.0 | |
| Oman (E. Arabia) | 1.7 | |
| Korsika (Frankrike) | 1.6 | |
| Baloch (Pakistan) | 1.6 | |
| Niokholo Mandenka (Senegal) | 1.6 | |
| Östra Andalusien (Spanien) | 1.5 | |
| Orkney (Skottland) | 1.4 | |
| Mestizos (Mexiko) | 1.2 | |
| Baloch (Iran) | 1.1 | |
| Bergamo (Italien) | 1.1 | |
| Northern Han (Kina) | 1.0 | |
| Centrala Portugal | 1.0 | |
| Tjeckien | 0,9 | |
| Norra Irland | 0,9 | |
| judar (Israel) | 0,9 | |
| Mixe (Oaxaca, Mexiko) | 0,9 | |
| Madeira (Spanien) | 0,8 | |
| Cayapa (Ecuador) | 0,6 | |
| Svans (Georgien) | 0,6 | |
| Mallorca/Minorca (Spanien) | 0,6 | |
| Belgien | 0,5 | |
| Lakota (Sioux) | 0,5 |
A*6802
A*6802 har en global nod inom vissa ursprungsbefolkningar i Sydamerika, på 37 %. En sekundär nod kan hittas i Afrika. Liksom *6801 finns det ett uppehåll på *6802 i Sydostasiens ursprungsbefolkningar, vilket indikerar att denna befolkning inte är en trolig källa inom den nya världens infödda folk. Halterna är generellt låga (<1%) i Europa utom längs Medelhavskusten. I Afrika kan högre nivåer hittas i Kenya och i Västafrika och Kap Verdeöarna. En anmärkning om renhet, föreställningen att A*6802 är av ursprungligt ursprung i USA kan ifrågasättas baserat på möjligheten till intrång från européer och afrikaner. I fallet med Yucpa är detta inte hållbart. Yucpa har en HLA-DQ8-frekvens på ~80%, den högsta DQ-allelfrekvensen i världen, denna stam visar få bevis på europeisk genetisk introgression, dessutom är den närmaste DQ8-frekvensen i termer av Afrika den isolerade ! Kung i Namibia . Det finns två möjliga källor till A*6802: Afrika direkt och Afrika via Asien. De associerade B-allelerna (B*48, B*61) pekar mot ett asiatiskt ursprung eller en afrikansk källa av mycket gammalt ursprung, eftersom det skulle krävas tid för att rekombinera asiatiska typiska B-alleler med A68. I spanska är A28-nivåerna 3,1% av dessa ~0,5% är A*6901, A*6802 är cirka 2,0% vilket betyder att nettonivån för A*6802 till A*6805 i spanskan är ~0,5%. Av 11 undersökta NA-grupper är 9 över och 2 under 0,5 %. Av de två spanska grupperna ligger 1 (Andalusien - 1,5 %) över och den andra (Katalon 0,0 %) under. I en inblandningsmodell förklarar spansk introgression inte A*6802 i den nya världen. Den asiatiska migrationsmodellen visar att inga enstaka personer NÖ om Pakistan har A*6802.
A*6803
| frekv | ||
| ref. | Befolkning | (%) |
| Maya (Guatemala) | 7.6 | |
| Bakalo pygmé (Kamerun) | 6,0 | |
| Mestizo (Guadalajara, Mexiko) | 3.9 | |
| Mestizo (Mexiko) | 3.7 | |
| Mbenzele Pygmy (Centralafrikansk) | 1.5 | |
| Lakota (Sioux) | 1.2 | |
| Yupik (Eskimo-Alaska) | 1.0 | |
| Buriat (Mongolien) | 0,4 | |
| Nordirland, Rumänien, Tjeckien, | 0,0 |
A*6803 kan hittas hos infödda folk i den nya världen och i Centralasien, i Afrika verkar den vara begränsad till väst- och centralafrikaner. Denna fördelning tillsammans med informationen om 6801 och 6802 antyder en trolig omfördelning av *68 alleler från Afrika efter den första migrationen från Östafrika som koloniserade Sydostasien. Det ger också stöd för två migrationsvågor från Asien till den nya världen eller, åtminstone, ett okänt blandningsområde av haplotyper från västra Stillahavsområdet och haplotyper härledda från västafrikanska/mellanöstern i östra Asien före den första migrationen. För närvarande följer intrånget av västeurasiska folk i Östasien bevis för återanvändning av transbaikalregionen efter 18 300 år och korrelerar med den begynnande Jōmon-perioden i Japan flera tusen år senare. Vissa alleler och haplotyper av HLA i sydamerikaner riktar sig mot Japans beräknade sammansättning före Yayoi, men andra folk, till exempel i västra Mexiko, är mest lika Ainu och folken i Amurbassängen.
A*6805
A*6805 finns i den guatemalanska och centralafrikanska Mbenzele vid låga nivåer.
A68 haplotyper
Det genetiska avståndet mellan indianer och eurasier är för stort för beständigheten av delade haplotyper, särskilt i ljuset av de lägre nivåerna i större delen av Sibirien. Kopplingen mellan haplotyper och västra Afrika kan vara betydande och kan indikera en snabb migration österut och inblandning inom den sena paleolitiska perioden.
Inhemska amerikanska haplotyper
A*680102-B35 haplotyper
- A*680102 Cw*0304 B*3506 (A68-Cw10-B35)
- A68-Cw4-B35 (Terena, Seri (Mexiko))
- A*680102 Cw*0401 B3521 (A68-Cw4-B35) (Terena)
A*6802-B35
- A*6802-B3501 Guadalajara
- A*6802-B3502 Guadalajara
A68-B35 Mayan (A*6803).
Dessa två haplotyper överensstämmer med närvaron av Cw4-B35 och A68 i Asien och Mellanöstern och A68-B35 kanske den förfäders A68-haplotypen. A28(A*6802)-B35 finns i Senegal.
A6801-B4002/4 - Terena, eskimå, mestizo, stamindianer (Asien)
A*680102-B*520102 i den mexikanska mestispopulationen. A28(A*6802)-B52 finns också i Senegal.
Old World A68 haplotyper
A28(~A68)-B51 Armenien, Senegal, Eskimo A28(~A68)-B70 W. Afr, Zaire, Zimbabwe, N. och S. Afrikanska (icke-kaukasier), Khoi (Hottentot)