HLA-A24
HLA-A24 | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
( MHC Klass I , A cellyteantigen) | ||||||||||
Handla om | ||||||||||
Protein | transmembranreceptor / ligand | |||||||||
Strukturera | aP- heterodimer | |||||||||
Underenheter | HLA-A *24--, p2 - mikroglobulin | |||||||||
Äldre namn | HL-A9 | |||||||||
Undertyper | ||||||||||
| ||||||||||
Alleler länkar ut till IMGT/HLA databas på EBI |
HLA-A24 (A24) är en serotyp av human leukocytantigen inom HLA-A- serotypgruppen. Serotypen bestäms av antikroppsigenkänning av a24- underuppsättning av HLA-A-a-kedjor. För A24 kodas alfa, "A", kedjan av HLA-A *24 allelgruppen och p-kedjan kodas av B2M locus . Denna grupp domineras för närvarande av A*2402. A24 och A *24 är nästan synonyma i betydelse. A24 är ett delat antigen av det breda antigenet HLA-A9 och det är en systerserotyp av HLA-A23 .
A*2402 har en av de högsta "A"-frekvenserna som identifierats för ett antal folk, inklusive Papua Nya Guineans , inhemska taiwaneser (östliga stammar), Yupik och Grönland [Aleuts]. Det är vanligt i stora delar av Sydostasien. I Eurasien är det minst vanligt i Irland, och A24 är relativt ovanligt i Afrika förutom Nordafrika och Kenya.
Serotyp
A*24 | A24 | 9: a | Prov |
allel | % | % | storlek (N) |
*2402 | 97 | 3098 | |
*2403 | 55 | 4 | 282 |
Det finns över 90 kända A*24-alleler, 69 kodar för olika isoformer och 7 är nollor. A*2403 kan också detekteras som A2403-serotyp.
Associerad sjukdom
A24 har en sekundär riskfaktor för myasthenia gravis, Buergers sjukdom . Det är också associerat med typ 1-diabetes (T1D) och systemisk lupus erythematosus (SLE) .
Alleler
Studera befolkning |
Frekv. (i %) |
---|---|
Taiwan Paiwan | 86,3 |
Taiwan Tsou | 78,4 |
Taiwan Rukai | 76,0 |
P apua N ew G uinea Goroka | 74,4 |
PNG Karimui-platån | 74,4 |
Taiwan Puyuma | 64,0 |
Taiwan Ami | 62,8 |
PNG Wanigela | 62,7 |
Taiwan Atayal | 61,8 |
Ecuador Cayapa | 61,4 |
Nya Kaledonien | 60,7 |
Venezuela Perja Mtn. Bari | 60,2 |
USA Alaska Yupik Natives | 58,1 |
Taiwan Tao | 54,0 |
PNG Wosera | 51,3 |
Taiwan Siraya | 47,1 |
Taiwan Taroko | 44,5 |
Mexiko Chihuahua Tarahuma... | 37,5 |
USA Arizona Pima | 36,0 |
Taiwan Pazeh | 33,6 |
Japan Okinawa Ryukyuan | 33,5 |
Amerikanska Samoa | 33,0 |
Japan (5) | 32,7 |
Filippinerna Ivatan | 32,0 |
PNG New Britain Rabaul | 31.6 |
N. Mexiko Canoncito Navaj... | 30,5 |
Australien Indig. Yuendumu | 29,8 |
Australien Indig. Groote E... | 29.3 |
Kina tibetaner | 27.2 |
S. Dakota Lakota Sioux | 26.2 |
Mexiko Mixtec Oaxaca | 24.5 |
Japan Ainu Hokkaido | 24,0 |
Venezuela Perija Mtns. Yu... | 23.3 |
Mexiko Zaptotec Oaxaca | 23.1 |
USA:s nordamerikanska infödda… | 22.7 |
Australien Indig. Cape Yor... | 22.3 |
Ch. Guangdong Meizhou Han | 22.2 |
Ryssland Tuva (2) | 21.5 |
Singapore kinesiska Han | 21.5 |
Indien norra hinduer | 20.2 |
Mongoliet Buriat | 20.0 |
Kina Inre Mongoliet | 19.6 |
USA asiatiska | 18.9 |
Taiwan Minnan (1) | 18.6 |
Kina södra Han | 17.2 |
Georgien Tbilisi Georgisk… | 17.1 |
Indien Mumbai Marathas | 16.7 |
Mexiko Guadalajara Mestiz... | 16.5 |
Singapore Riau Malay | 16.5 |
Kroatien | 16,0 |
Indien Khandesh Pawra | 16,0 |
Singapore Javanese Indone... | 16,0 |
Sydafrika Natal Tamil | 16,0 |
Indien Tamil Nadu Nadar | 15.6 |
PNG Madang | 15.3 |
Kina North Han | 15.2 |
USA South Texas Hispanics | 15.2 |
PNG West Schrader Ranges | 14.2 |
Kina Guangxi Maonan | 13.4 |
Mexikos mestiser | 13.4 |
Georgia Svaneti Svans | 13.1 |
rumänska | 12.7 |
Pakistan Burusho | 12.5 |
USA spansktalande | 12.2 |
Bulgarien | 11.8 |
Georgien Tbilisi kurder | 11.7 |
Indien New Delhi | 11.4 |
Pakistan Sindhi | 10.7 |
USA kaukasiska | 10.7 |
Frankrike sydöstra | 10.6 |
Pakistan Pathan | 10.2 |
Kamerun Pygmé Baka | 10,0 |
Finland | 9.4 |
Brasilien | 8.6 |
Australien Indig. Kimberly | 8.3 |
Australien New South Wales | 8.2 |
Israel Arab Druse | 8,0 |
Pakistan Baloch | 8,0 |
Portugal Center | 8,0 |
Kamerun Sawa | 7.7 |
Brasilien Terena | 7.5 |
Södra Irland | 6.8 |
Tunisien | 6.7 |
Belgien | 6.6 |
Marocko Berber Nador Meta... | 6.2 |
Jordan Amman | 5.9 |
oman | 5.9 |
Mexico Mixe Oaxaca | 5.7 |
Portugal norr | 5.4 |
sudanesiska | 5.3 |
Mexiko Sonora Seri | 4.5 |
Uganda Kampala | 4.3 |
Thailand | 3.9 |
Iran Baloch | 3.4 |
USA Afrikansk Amerika | 2.8 |
Kenya | 2.1 |
Guinea Bissau | 1.5 |
Tjeckien | 1.0 |
Kenya Nandi | 1.0 |
allelfrekvenser presenteras |
A*2402 är en sekundär riskfaktor, förändrar risken för typ 1-diabetes och en allel associerad med tymominducerad myasthenia gravis .
Haplotyper
frekv | Rank in | |||
ref. | Befolkning | (%) | Pop. | |
Java (Indonesien) | 8,0 | 1 | 4 | |
S. Amer. Inföding | 6.3 | 1 | 3 | |
N. Amer. Inföding | 5.4 | 1 | 5 | |
Mexikansk | 4.7 | 1 | ||
Inuit | 4.2 | 1 | ||
brasiliansk | 3.8 | 1 | ||
Österrike | 3.5 | 1 | ||
portugisiska | 3.1 | 1 | 3 | |
Yakut | 2.9 | 1 | ||
mongoliska | 2.7 | 1 | ||
Timor | 2.5 | 1 | 5 | |
Bharghavas (Indien) | 2.4 | 1 | ||
grekisk | 2.3 | 1 | ||
italienska | 2.2 | 1 | ||
mongoliska | 1.9 | 1 | ||
vietnamesiska | 1.8 | 1 | ||
japanska | 1.6 | 2 | ||
franska | 1.2 | 2 | ||
1 Cw4. 2 Cw9. |
A24-Cw7-B39 A24-Cw10 -B60 A24-Cw10-B61 A24-B48
A24-Cw4-B35
Denna speciella haplotyp är vanlig över en ganska bred region, möjligen den mest spridda A-Cw-B-haplotypen hos människor. Cw4-B35 har en nod inom regionen som en gång kallades Thracia/Dacia.
A24-Cw*14-B51
frekv | ||
ref. | Befolkning | (%) |
koreanska | 3.5 | |
Iyers | 3.4 | |
mongoliska | 2.9 | |
japanska | 2.6 | |
rumänska | 2.2 | |
grekisk | 2.1 | |
ungerska | 2.0 | |
italienska | 0,6 |