HLA-A24

HLA-A24
( MHC Klass I , A cellyteantigen)
HLA-A24.png
Återgivning av: α (A*2402 genprodukt) , β2 - mikroglobulin och telomeraspeptid .
Handla om
Protein transmembranreceptor / ligand
Strukturera aP- heterodimer
Underenheter HLA-A *24--, p2 - mikroglobulin
Äldre namn HL-A9
Undertyper
Undertyp
allel
Tillgängliga strukturer
A24 .
A9.3
Alleler länkar ut till IMGT/HLA databas på EBI

HLA-A24 (A24) är en serotyp av human leukocytantigen inom HLA-A- serotypgruppen. Serotypen bestäms av antikroppsigenkänning av a24- underuppsättning av HLA-A-a-kedjor. För A24 kodas alfa, "A", kedjan av HLA-A *24 allelgruppen och p-kedjan kodas av B2M locus . Denna grupp domineras för närvarande av A*2402. A24 och A *24 är nästan synonyma i betydelse. A24 är ett delat antigen av det breda antigenet HLA-A9 och det är en systerserotyp av HLA-A23 .

A*2402 har en av de högsta "A"-frekvenserna som identifierats för ett antal folk, inklusive Papua Nya Guineans , inhemska taiwaneser (östliga stammar), Yupik och Grönland [Aleuts]. Det är vanligt i stora delar av Sydostasien. I Eurasien är det minst vanligt i Irland, och A24 är relativt ovanligt i Afrika förutom Nordafrika och Kenya.

Serotyp

A24-igenkänning av vissa HLA A*24-genprodukter
A*24 A24 9: a Prov
allel % % storlek (N)
*2402 97 3098
*2403 55 4 282

Det finns över 90 kända A*24-alleler, 69 kodar för olika isoformer och 7 är nollor. A*2403 kan också detekteras som A2403-serotyp.

Associerad sjukdom

A24 har en sekundär riskfaktor för myasthenia gravis, Buergers sjukdom . Det är också associerat med typ 1-diabetes (T1D) och systemisk lupus erythematosus (SLE) .

Alleler

HLA A*2402 frekvenser
Studera befolkning
  Frekv. (i %)
Taiwan Paiwan 86,3
Taiwan Tsou 78,4
Taiwan Rukai 76,0
P apua N ew G uinea Goroka 74,4
PNG Karimui-platån 74,4
Taiwan Puyuma 64,0
Taiwan Ami 62,8
PNG Wanigela 62,7
Taiwan Atayal 61,8
Ecuador Cayapa 61,4
Nya Kaledonien 60,7
Venezuela Perja Mtn. Bari 60,2
USA Alaska Yupik Natives 58,1
Taiwan Tao 54,0
PNG Wosera 51,3
Taiwan Siraya 47,1
Taiwan Taroko 44,5
Mexiko Chihuahua Tarahuma... 37,5
USA Arizona Pima 36,0
Taiwan Pazeh 33,6
Japan Okinawa Ryukyuan 33,5
Amerikanska Samoa 33,0
Japan (5) 32,7
Filippinerna Ivatan 32,0
PNG New Britain Rabaul 31.6
N. Mexiko Canoncito Navaj... 30,5
Australien Indig. Yuendumu 29,8
Australien Indig. Groote E... 29.3
Kina tibetaner 27.2
S. Dakota Lakota Sioux 26.2
Mexiko Mixtec Oaxaca 24.5
Japan Ainu Hokkaido 24,0
Venezuela Perija Mtns. Yu... 23.3
Mexiko Zaptotec Oaxaca 23.1
USA:s nordamerikanska infödda… 22.7
Australien Indig. Cape Yor... 22.3
Ch. Guangdong Meizhou Han 22.2
Ryssland Tuva (2) 21.5
Singapore kinesiska Han 21.5
Indien norra hinduer 20.2
Mongoliet Buriat 20.0
Kina Inre Mongoliet 19.6
USA asiatiska 18.9
Taiwan Minnan (1) 18.6
Kina södra Han 17.2
Georgien Tbilisi Georgisk… 17.1
Indien Mumbai Marathas 16.7
Mexiko Guadalajara Mestiz... 16.5
Singapore Riau Malay 16.5
Kroatien 16,0
Indien Khandesh Pawra 16,0
Singapore Javanese Indone... 16,0
Sydafrika Natal Tamil 16,0
Indien Tamil Nadu Nadar 15.6
PNG Madang 15.3
Kina North Han 15.2
USA South Texas Hispanics 15.2
PNG West Schrader Ranges 14.2
Kina Guangxi Maonan 13.4
Mexikos mestiser 13.4
Georgia Svaneti Svans 13.1
rumänska 12.7
Pakistan Burusho 12.5
USA spansktalande 12.2
Bulgarien 11.8
Georgien Tbilisi kurder 11.7
Indien New Delhi 11.4
Pakistan Sindhi 10.7
USA kaukasiska 10.7
Frankrike sydöstra 10.6
Pakistan Pathan 10.2
Kamerun Pygmé Baka 10,0
Finland 9.4
Brasilien 8.6
Australien Indig. Kimberly 8.3
Australien New South Wales 8.2
Israel Arab Druse 8,0
Pakistan Baloch 8,0
Portugal Center 8,0
Kamerun Sawa 7.7
Brasilien Terena 7.5
Södra Irland 6.8
Tunisien 6.7
Belgien 6.6
Marocko Berber Nador Meta... 6.2
Jordan Amman 5.9
oman 5.9
Mexico Mixe Oaxaca 5.7
Portugal norr 5.4
sudanesiska 5.3
Mexiko Sonora Seri 4.5
Uganda Kampala 4.3
Thailand 3.9
Iran Baloch 3.4
USA Afrikansk Amerika 2.8
Kenya 2.1
Guinea Bissau 1.5
Tjeckien 1.0
Kenya Nandi 1.0
allelfrekvenser presenteras

A*2402 är en sekundär riskfaktor, förändrar risken för typ 1-diabetes och en allel associerad med tymominducerad myasthenia gravis .

Haplotyper

HLA A24-B35 haplotyp av Cw-frekvenser
frekv Rank in
ref. Befolkning (%) Pop.
Java (Indonesien) 8,0 1 4
S. Amer. Inföding 6.3 1 3
N. Amer. Inföding 5.4 1 5
Mexikansk 4.7 1
Inuit 4.2 1
brasiliansk 3.8 1
Österrike 3.5 1
portugisiska 3.1 1 3
Yakut 2.9 1
mongoliska 2.7 1
Timor 2.5 1 5
Bharghavas (Indien) 2.4 1
grekisk 2.3 1
italienska 2.2 1
mongoliska 1.9 1
vietnamesiska 1.8 1
japanska 1.6 2
franska 1.2 2
1 Cw4. 2 Cw9.




A24-Cw7-B39 A24-Cw10 -B60 A24-Cw10-B61 A24-B48

A24-Cw4-B35

Denna speciella haplotyp är vanlig över en ganska bred region, möjligen den mest spridda A-Cw-B-haplotypen hos människor. Cw4-B35 har en nod inom regionen som en gång kallades Thracia/Dacia.

A24-Cw*14-B51

HLA A24-CBL-B51 (CBL=1402) haplotypfrekvenser
frekv
ref. Befolkning (%)
koreanska 3.5
Iyers 3.4
mongoliska 2.9
japanska 2.6
rumänska 2.2
grekisk 2.1
ungerska 2.0
italienska 0,6