HLA-A11
HLA-A11 | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
( MHC klass I , A cellyteantigen) | ||||||||||
Handla om | ||||||||||
Protein | transmembranreceptor / ligand | |||||||||
Strukturera | aP- heterodimer | |||||||||
Underenheter | HLA-A *11--, p2 - mikroglobulin | |||||||||
Äldre namn | HL-A11 | |||||||||
Undertyper | ||||||||||
| ||||||||||
Sällsynta alleler | ||||||||||
| ||||||||||
Alleler länkar ut till IMGT/HLA databas på EBI |
HLA-A11 (A11) är en serotyp av human leukocytantigen inom HLA-A " A"-serotypgruppen. Serotypen bestäms av antikroppsigenkänning av α 11 underuppsättning av HLA-A α-kedjor. För A11 kodas alfa-"A"-kedjan av HLA-A *11 -allelgruppen och p-kedjan kodas av B2M - lokus . Denna grupp domineras för närvarande av A*1101. A11 och A *11 är nästan synonyma i betydelse. A11 är vanligare i Östasien än på andra ställen, det är en del av flera långa haplotyper som verkar ha varit frekventa i Asiens antika folk.
Serotyp
A*11 | A11 | Prov |
allel | % | storlek (N) |
*1101 | 99 | 2530 |
*1102 | 76 | 42 |
*1103 | 83 | 18 |
*1104 | 60 | 6 |
Serotypning av A11 visar bättre igenkänning av *1101-genprodukterna och sämre igenkänning av andra A*11-genprodukter. Det finns ~40 igenkända alleler av A*11. Det finns bara en noll som klassificeras som A11.
Vid infektionssjukdom
Samband har observerats mellan A11 och familjär otoskleros , lungtuberkulos, spetälska och cytomegalovirusinfektion med epilepsi . Dessa och andra studier tyder på en inblandning mellan A11 och sekundära effekter av vissa herpesvirusinfektioner. A11 visade sig också öka i supraglottisk cancer med dålig 3 års överlevnad. I osteosarkom hittades A11 förhöjt.
Det finns ett starkt samband mellan antidepressivt inducerad hepatit och HLA-A11. Vid autoimmun hepatit har A11 en synergistisk effekt, som tillsammans med DR4 och DR3 ökar risken för sjukdom till över 300.
A11 är också en del av en haplotyp A11-Cw4-B35-DR1-DQ1 som är en andra faktor i den snabba utvecklingen av HIV. Inblandningen av non-Hodgkins lymfom främst som ett resultat av Epstein-Barr-virus återinfektion verkar inte vara en orsak till denna acceleration.
Epstein-Barr virus anomali
Det finns åtminstone ett par former av lymfoproliferativa sjukdomar som verkar uppstå från olösta Epstein-Barr-virusinfektioner . Undersökning av själva viruset har lett till upptäckten av stammar som nästan kan stänga av det A11-medierade klass I-svaret på viruset hos A11-berikade folk (se tabellerna nedan). Denna förmåga att stänga av immunförsvaret och för att viruset ska förbli aktivt är en faktor i karcinogenesen. Tidiga studier av A-serotyper avslöjade och associering av A11 med Hodgkins lymfom och nyare studier har visat en komplex involvering av Epstein-Barr-virusinfektion som en konsekvens av låg A11-kontroll över infektion.
Burkitts lymfom leder så småningom till upptäckten av viruset, men denna sjukdom är mer uppenbar i Afrika. En inblandning i nedreglering av cytotoxiska T-lymfocyter i Burkitts lymfom upptäcktes senare. Nyare studier visar att A11 är nedreglerad och att andra genetiska defekter är en trolig orsak. Förmågan att presentera EB-virusantigener avslöjade en defekt i processen efter antigenprocessen men före TAP1- inblandning. Andra studier indikerade att peptider binder A11 vid leverans till cellytan för CTL-screening, men faller av och förstörs intracellulärt. A3 och A11 kan emellertid bearbeta och ladda antigener även när proteosomaktiviteten är minskad, vilket tyder på en alternativ mekanism för laddning som kan dra nytta av tillfrisknandet från någon sjukdom men försämra återhämtningen av andra.
Det verkar som om dessa och andra virus har lärt sig att utnyttja någon defekt i regionen kring A11 som tillåter nästan fullständig avstängning av genuttryck. Märkligt nog, i Afrika är A11 vid mycket låga frekvenser, och homozygoter är sällsynta, vilket tyder på att andra genetiska mottagligheter kan finnas som styr viruset mot Burkitts lymfom.
Alleler
Studera befolkning |
Frekv. (i %) |
---|---|
P apua N ew G uinea Madang | 63,6 |
PNG West Schrader Ranges | 55,0 |
Taiwan Hakka | 40,0 |
PNG Wosera | 38,5 |
Kina Yunnan Naxi | 38,0 |
Taiwan Tao | 36,0 |
Kina Guangxi Maonan | 35.2 |
Kina Guangzhou | 33,8 |
Taiwan Minnan (1) | 30,9 |
Thailand | 29,9 |
Kina Wuhan | 29.3 |
Taiwan Pazeh | 28.2 |
Kina södra Han | 27.7 |
Thailand nordost | 27.1 |
Singapore kinesiska | 26,5 |
Taiwanesiska i Mellersta Kina... | 26.2 |
PNG New Britain Rabaul | 26,0 |
Pakistan Brahui | 25.2 |
Australien Indig. Groote E... | 24,0 |
Indien New Delhi | 23.5 |
USA asiatiska | 23,0 |
Pakistan Baloch | 22.2 |
Taiwan Thao | 21.7 |
Kina, Shandong, Linqu Co... | 20.4 |
Pakistan Sindhi | 19.6 |
Australien Indig. Cape Yor... | 18,0 |
PNG Karimui-platån | 17.9 |
Singapore Riau Malay | 17.7 |
Taiwan Siraya | 17.6 |
Kina Peking | 16.4 |
Pakistan Pathan | 16.3 |
Kina Inre Mongoliet | 16.2 |
Amerikanska Samoa | 16,0 |
Spanien baskiska Arratia Vall… | 16,0 |
Kina Qinghai Hui | 15.9 |
Ryssland Murmansk Saomi | 14,0 |
Singapore Javanese Indone... | 14,0 |
Nya Kaledonien | 13.1 |
Japan Aichi | 12.7 |
Georgia Svaneti Svans | 12.5 |
Indien norra hinduer | 12.5 |
Pakistan Burusho | 12.5 |
Kina Yunnan Han (2) | 12.3 |
Indien Mumbai Marathas | 12.3 |
Kina Harbin N. Koreansk | 12.1 |
Indien Andhra Pradesh Goll... | 11.9 |
Taiwan Saisiat | 11.8 |
oman | 11.4 |
Israel Arab Druse | 11.0 |
Sydkorea (3) | 10.8 |
Taiwan Tsou | 10.8 |
Mongoliet Khoton Trialan | 10.7 |
Sri Lanka Colombo Sinhale... | 10.4 |
Georgien Tbilisi kurder | 10,0 |
Mongoliet Khalkha | 10,0 |
Australien Indig. Kimberly | 9.7 |
Indien norra Delhi | 9.4 |
Japan Hyogo | 9.4 |
Spanien norra Cabuernigo | 8.9 |
Saudiarabien | 8.7 |
Ryssland Tuva (2) | 8.7 |
Spanien norra Kantabrien | 8.4 |
Centrala Japan | 8.2 |
rumänska | 8.2 |
Grekland norr | 8,0 |
Irland norra | 8,0 |
Taiwan Atayal | 8,0 |
Jordan Amman | 7.9 |
Nord Italien (1) | 7.7 |
Italien Sardinien (3) | 7.7 |
Australien Indig. Yuendumu | 7.6 |
Mongoliet Tsaatan | 7.6 |
USA kaukasier (3) | 7.4 |
Bulgarien | 7.3 |
Taiwan Taroko | 7.3 |
Filippinerna Ivatan | 7,0 |
USA kaukasiska Bethesda | 7,0 |
Portugal Center (2) | 6.8 |
Australien New South Wales | 6.7 |
Marocko | 6.7 |
USA Hawaii Okinawa | 6.7 |
Wales | 6.6 |
Serbien | 6.5 |
Georgien Tbilisi Georgisk… | 6.2 |
Södra Irland | 6.2 |
Algeriet(1) | 6.2 |
Brasilien | 6.1 |
Spanien baskiska Gipuzkoa Pro... | 6.1 |
Turkiet (2) | 6.1 |
Ryssland nordväst | 6,0 |
Portugal South pop2 | 5.9 |
England Newcastle | 5.7 |
Italien Norra Pavia | 5.6 |
israeliska judar | 5.4 |
Sverige Stockholm | 5.1 |
Finland | 5.0 |
Makedonien (4) | 4.9 |
Italien Bergamo | 4.8 |
Marocko Berber Nador Meta... | 4.8 |
allelfrekvenser presenteras |
Studera befolkning |
Frekv. (i %) |
---|---|
Taiwan Saisiat | 12.7 |
Taiwan Pazeh | 10.9 |
Taiwan Ami | 8.7 |
Taiwan Puyuma | 7,0 |
Taiwan Siraya | 6.9 |
Kina Guangxi Maonan | 6.5 |
Taiwan Atayal | 5.2 |
Filippinerna Ivatan | 5.0 |
Ch. Guangdong Meizhou Han | 4.6 |
Taiwan Hakka | 4.5 |
Hong Kong kinesiska | 4.0 |
Taiwan Minnan (1) | 3.9 |
Thailand | 3.5 |
Singapore kinesiska | 3.0 |
Taiwan Tao | 3.0 |
Taiwan Tsou | 2.9 |
Kina Beijing Shijiazhuan... | 2.0 |
Italien North pop 1 | 1.9 |
Taiwan Taroko | 1.8 |
Kina Inre Mongoliet | 1.0 |
Indiens västkust Parsis | 1.0 |
Taiwan Bunun | 1.0 |
Kina Qinghai Hui | 0,9 |
Kina Yunnan Lisu | 0,6 |
Japan (3) | 0,2 |
allelfrekvenser presenteras |
Studera befolkning |
Frekv. (i %) |
---|---|
Kina Yunnan Lisu | 5.1 |
Kina Yunnan Nu | 3.8 |
Kina Beijing Shijiazhuan... | 0,2 |
allelfrekvenser presenteras |
Studera befolkning |
Frekv. (i %) |
---|---|
Georgia Svaneti Svans | 1.3 |
Singapore Riau Malay | 1.2 |
Amerikanska Samoa | 1.0 |
Indien norra hinduer | 1.0 |
Israel Ashkenazi och icke... | 0,4 |
Kina Beijing Shijiazhuan... | 0,2 |
allelfrekvenser presenteras |
Sjukdomsföreningar
* 1104 är associerad med ökad risk för cervikal neoplasi till följd av humant papillomvirusinfektion
A11-B haplotyper
A11-B13
- A11-Cw2-B13 (Li)
- A11-Cw9-B13 (Södra Kina och Sydostasien)
- A11-C10-B13 Buyi
- A11-CBL-B13 norra Kina