HLA-A31

HLA-A31
( MHC Klass I , A cellyteantigen)
Illustration HLA-A.png
HLA-A31
Om
Protein transmembranreceptor / ligand
Strukturera aP- heterodimer
Underenheter HLA-A *3101, p2 - mikroglobulin
Äldre namn A19
Undertyper
Undertyp
allel
Tillgängliga strukturer
A31
{{{cNick2}}}
{{{cNick3}}}
{{{cNick4}}}
Sällsynta alleler
Undertyp
allel
Tillgängliga strukturer
A31.2
{{{rnick2}}}
{{{rnick3}}}
Alleler länkar ut till IMGT/HLA databas på EBI

HLA-A31 (A31) är en serotyp av human leukocytantigen inom HLA-A- serotypgruppen. Serotypen bestäms av antikroppsigenkänning av α 31 underuppsättning av HLA-A α-kedjor. För A31 kodas alfa-"A"-kedjan av HLA-A *31 -allelgruppen och p-kedjan kodas av B2M - lokus . Denna grupp domineras för närvarande av A*3101. A31 och A *31 är nästan synonyma i betydelse. A31 är ett delat antigen av den breda antigenet serotyp A19 . A31 är en systerserotyp av A29 , A30 , A32 , A33 och A74 .

A31 är vanligare i Syd- och Centralamerika.

Serotyp

A31-igenkänning av vissa HLA A*31-genprodukter
A*31 A31 En 19 En 30 Prov
allel % % % storlek (N)
*3101 90 1 3 3517
*3102 100 0 0 11


Det finns en substantiell falsk reaktion av A30 med A*3101, annars är serologisk identifiering bra.

Distribution

HLA A*3101 frekvenser
Studera befolkning
  Frekv. (i %)
USA New Mexico Canoncito … 26.8
Argentina Chiriguanos 26.4
Argentina Salta Wichis 23.7
Indien Tamil Nadu Nadar 18.9
Mexiko Michoacan Tarasco 18.4
Brasilien Terena 18.3
USA South Dakota Lakota S… 18.1
Mexiko Sonora Seri 15.2
Japan Hyogo 14.1
Colombia Mestizos 13.3
Indien Andhra Pradesh Goll... 13.1
Mexiko Teenek Huasteca Re… 12.1
Japan Ainu Hokkaido 12,0
Guatemala Mayans 10.9
Brasilien Parana Oriental 10.6
Mexiko Chihuahua State Ta… 10.2
Peru Lamas City Lama 10.2
Ryssland Tuva (2) 9.8
Kina tibetanska 9.2
Saudiarabien Guraiat och … 8.7
Indien Kerala Hindu Ezhava 8.3
Mexiko Guadalajara Mestiz... 8.3
Japan Okinawa Ryukyuan 8.1
USA:s nordamerikanska infödda… 7.8
Japan Aichi 7.6
USA Arizona Pima 7.6
Mongoliet Buriat 7.5
Kina North Han 7.1
Centrala Japan 7.1
Mongoliet Khalha 7,0
Sydafrika Natal Tamil 7,0
Mexiko Zaptotec Oaxaca 6.7
Mongoliet Khoton Trialan 6.5
Indien Khandesh Pawra 6,0
Mongoliet Oold 5.8
Saudiarabien 5.7
Kina Inre Mongoliet 5.4
Sydkorea 5.4
Papua Nya Guinea Madang 5.1
Finland 5.0
Chuvash 4.9
USA spansktalande 4.9
Frankrike sydöstra 4.7
Sakhalin Island Nivkhi 4.7
Pakistan Sindhi 4.4
Belgien 4.2
Pakistan Kalash 4.2
Portugal söder 4.1
Brasilien 4.0
Indien Jalpaiguri Toto 3.8
Spanien norra Cabuernigo 3.8
Sverige Uppsala län 3.8
Kina Peking 3.7
tyska Essen 3.6
Sri Lanka Colombo Sinhale... 3.5
Zambia Lusaka 3.5
Spanien Katalonien Girona 3.4
Sverige Stockholm 3.4
Algeriet1 3.0
Kroatien 3.0
Indien New Delhi 3.0
Papua Nya Guinea Karimui … 3.0
Spanien baskiska Gipuzkoa Pro... 3.0
sudanesiska 3.0
Wales 3.0
England Sheffield 2.8
Kina södra Han 2.8
Tjeckien 2.8
Thailand 2.8
USA San Antonio kaukasiska… 2.7
Italien Bergamo 2.7
Brasilien Belo Horizonte 2.6
Irland norra 2.6
England Liverpool 2.6
Kina Yunnan Nu 2.5
Italien 2.5
oman 2.5
Skottland Orkney 2.5
Uganda Kampala 2.5
England Newcastle 2.4
Mexikos mestiser 2.4
Nya Kaledonien 2.4
rumänska 2.3
Iran Baloch 2.2
Södra Irland 2.2
Marocko "Berber" Nador Me... 2.1
Serbien 2.1
Burkina Faso Fulani 2.0
Georgia Svaneti Svans 1.9
Ryssland nordväst 1.8
Bulgarien 1.8
Georgien Tbilisi kurder 1.7
Jordan Amman 1.7
Grekland norr 1.6
Tunisien 1.5
Thailand nordost 1.4
Spanien baskiska Arratia Vall… 1.3
USA afroamerikaner 1.3
Israel Gaza palestinier 1.2
allelfrekvenser presenteras

Haplotyper

HLA A31 haplotypfrekvenser
frekv
ref. Befolkning (%)

A31-B35 (A*310102:Cw*0401:B*3501)
Lakota Sioux (USA) 4.1
Indig American (USA) 3.7
Mestizo (Guad. Mexiko) 1.5
tibetanska 1.1
judar (England) 1.3
tibetanska 1.1
italienska 0,6
japanska 0,5
franska 0,5
Chushan (Kina) 0,4
tysk 0,3

A31-B39 (A*310102:Cw*0701:B*3901)
Mixtec (Oax. Mexiko) 10,0
Lakota Sioux (USA) 1.6
japanska 0,3
tysk 0,1

A31-B48 (A*310102:B*4801)
Orochon (Ryssland) 6,0
Maya (Guatemala) 3.5
Buriat 3.4
japanska 0,3

A31-B51 (A*310102:B*5101)
Ainu (Hokkaido Japan) 8.9
Indig. Brasilien 5.8
Orochon (Ryssland) 5.3
Indig American (USA) 4.3
tibetanska 3.3
Inre mongoliska 3.0
japanska 3.0
portugisiska 1.6
koreanska 1.2
italienska 0,9
franska 0,5
tysk 0,3
Chushan (Kina) 0,2
(A*310102:B*5102)
Tarahumura (Mexiko) 5.7
vietnamesiska 1.0

A31-B60 (A*310102:Cw*0304:B*4001)
Lusaka (Zambia) 2.3
Yakuts (Ryssland) 2.0
irländska 0,7
Chushan (Kina) 0,7
Japan 0,6
holländska 0,6
tysk 0,4

A31-B62 (A*310102:B*1501)
Nivkhi (Sakalin, Ryssland) 12.5
Yakut (Ryssland) 5.5
Indig. Brasilien 4.1
Manchu 1.1
Japan 0,4
tysk 0,2
Chushan (Kina) 0,2

Undersökning av A31-haplotyper avslöjar ett troligt samband över norra Eurasien under den förhistoriska perioden. Frekvenserna för de mer "berättande" haplotyperna (A31-B60, B61 och B62) faller från NE till SW Europa. Andra haplotyper verkar ha spridit sig från Mellanöstern (A31-B51 och A31-B35).