Guanosin nukleotid dissociationsinhibitor
| GDP-dissociationsinhibitorstruktur | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 av dubbelt prenylerade ypt1:gdi-
| |||||||||||
| komplexidentifierare | |||||||||||
| Symbol | GDI | ||||||||||
| Pfam | PF00996 | ||||||||||
| Pfam klan | CL0063 | ||||||||||
| InterPro | IPR018203 | ||||||||||
| SCOP2 | 1gnd / SCOPe / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
Inom molekylärbiologin utgör Guanosin-dissociationsinhibitorerna ( GDI ) en familj av små GTPaser som har en reglerande roll i vesikulär membrantrafik. GDI binder till den GDP-bundna formen av Rho och Rab små GTPaser och förhindrar inte bara utbyte (bibehåller det lilla GTPaset i ett off-state), utan hindrar också det lilla GTPaset från att lokaliseras vid membranet, vilket är deras verkningsplats. Denna hämning kan avlägsnas genom inverkan av en GDI-förskjutningsfaktor. GDI:er hämmar också cdc42 genom att binda till dess svans och förhindra dess införande i membran; därför kan den inte utlösa WASP och kan inte leda till kärnbildning av F- aktin .
GDI:s C-terminala geranylgeranylering är avgörande för deras membranassociation och funktion. Denna post-translationella modifiering katalyseras av Rab-geranylgeranyltransferas (Rab-GGTase), ett multi-subenhetsenzym som innehåller en katalytisk heterodimer och en tillbehörskomponent, kallad Rab eskortprotein (REP)-1. REP-1 presenterar nysyntetiserade Rab- proteiner för den katalytiska komponenten och bildar ett stabilt komplex med de prenylerade proteinerna efter överföringsreaktionen. Mekanismen för REP-1-medierad membranassociation av Rab5 liknar den som medieras av Rab GDP-dissociationsinhibitor (GDI). REP-1 och Rab GDI delar också andra funktionella egenskaper, inklusive förmågan att hämma frisättningen av GDP och att avlägsna Rab-proteiner från membran.
Kristallstrukturen för den bovina alfaisoformen av Rab GDI har bestämts till en upplösning på 1,81 Ångström . Proteinet är sammansatt av två huvudsakliga strukturella enheter: en stor komplex flerskiktsdomän I och en mindre alfa-helixdomän II .
Den strukturella organisationen av domän I är nära relaterad till FAD -innehållande monooxygenaser och oxidaser . Konserverade regioner som är gemensamma för GDI och choroideremi -genprodukten , som levererar Rab till katalytiska subenheter av Rab geranylgeranyltransferas II, är klustrade på en sida av domänen. De två mest konserverade regionerna bildar en kompakt struktur vid molekylens spets; platsriktad mutagenes har visat att dessa regioner spelar en avgörande roll i bindningen av Rab-proteiner.
externa länkar
- Guanin+Nukleotid+Dissociation+Hämmare vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)