Släkte
Genus ( / ˈdʒiːnəs ) pluralgenera den taxonomisk som / fossila / ˈdʒɛnərə en som används levande organismer / är rangordning i biologiska klassificeringen av och såväl virus . _ _ _ I hierarkin för biologisk klassificering kommer släktet över arter och under familjen . I binomial nomenklatur utgör släktnamnet den första delen av det binomala artnamnet för varje art inom släktet.
- T.ex. Panthera leo (lejon) och Panthera onca (jaguar) är två arter inom släktet Panthera . Panthera är ett släkte inom familjen Felidae .
Sammansättningen av ett släkte bestäms av taxonomer . Standarderna för släktklassificering är inte strikt kodifierade, så olika myndigheter producerar ofta olika klassificeringar för släkten. Det finns dock några allmänna metoder som används, inklusive idén att ett nydefinierat släkte bör uppfylla dessa tre kriterier för att vara beskrivande användbart:
- monophyly – alla ättlingar till ett förfäders taxon är grupperade tillsammans (dvs fylogenetisk analys bör tydligt visa både monophyly och validitet som en separat härstamning).
- rimlig kompakthet – ett släkte bör inte utökas i onödan.
- distinkthet – med avseende på evolutionärt relevanta kriterier, dvs ekologi , morfologi eller biogeografi ; DNA-sekvenser är en konsekvens snarare än ett tillstånd av divergerande evolutionära linjer förutom i fall där de direkt hämmar genflödet (t.ex. postzygotiska barriärer) .
Dessutom bör släkten vara sammansatta av fylogenetiska enheter av samma slag som andra (analoga) släkten.
Etymologi
Termen "släkte" kommer från grekiskan γένος , en substantivform besläktad med gignere ('att bära; att föda'). Den svenske taxonomen Carl Linnaeus populariserade dess användning i sin 1753 Species Plantarum , men den franske botanikern Joseph Pitton de Tournefort (1656–1708) anses vara "grundaren av det moderna släktbegreppet".
Använda sig av
Det vetenskapliga namnet (eller det vetenskapliga epitetet) av ett släkte kallas också för det generiska namnet ; i moderna stilguider och vetenskap är det alltid kapitaliserat. Det spelar en grundläggande roll i binomial nomenklatur , systemet för att namnge organismer , där det kombineras med det vetenskapliga namnet på en art : se Botaniskt namn och Specifikt namn (zoologi) . [ citat behövs ]
Använd i nomenklaturen
Reglerna för de vetenskapliga namnen på organismer är fastställda i nomenklaturkoderna , som tillåter varje art ett unikt namn som för djur (inklusive protister ), växter (även alger och svampar ) och prokaryoter ( bakterier och arkéer ) är Latin och binomial i form; detta står i kontrast till vanliga eller folkliga namn , som är icke-standardiserade, kan vara icke-unika och vanligtvis också variera beroende på land och språk.
Med undantag för virus omfattar standardformatet för ett artnamn det generiska namnet, som anger det släkte som arten tillhör, följt av det specifika epitetet, som (inom det släktet) är unikt för arten . Till exempel är den grå vargens vetenskapliga namn Canis lupus , där Canis ( latin för 'hund') är det generiska namnet som delas av vargens nära släktingar och lupus (latin för 'varg') är det specifika namnet för vargen . Ett botaniskt exempel skulle vara Hibiscus arnottianus , en speciell art av släktet Hibiscus som är infödd på Hawaii. Det specifika namnet skrivs med små bokstäver och kan följas av underarter namn inom zoologi eller en mängd olika infraspecifika namn i botanik .
När det generiska namnet redan är känt från sammanhanget, kan det förkortas till sin initiala bokstav, till exempel C. lupus i stället för Canis lupus . Där arter är ytterligare indelade, utgör det generiska namnet (eller dess förkortade form) fortfarande den främsta delen av det vetenskapliga namnet, till exempel Canis lupus lupus för den eurasiska vargunderarten , eller som ett botaniskt exempel, Hibiscus arnottianus ssp. immaculatus . Som synligt i exemplen ovan är de latiniserade delarna av de vetenskapliga namnen på släkten och deras inkluderade arter (och infraarter, i förekommande fall) enligt konvention skrivna i kursiv stil .
De vetenskapliga namnen på virusarter är beskrivande, inte binomiala till formen, och kan eller kanske inte innehåller en indikation på deras släkte; till exempel är virusarterna " Salmonid herpesvirus 1 ", " Lax herpesvirus 2 " och " Lax herpesvirus 3 " alla inom släktet Salmonivirus ; emellertid är släktet som arten med de formella namnen " Everglades-virus " och " Ross River-virus " tilldelas Alphavirus .
Liksom med vetenskapliga namn i andra led, i alla andra grupper än virus, kan namn på släkten citeras med sina auktoriteter, vanligtvis i formen "författare, årtal" i zoologi och "standard förkortat författarnamn" i botanik. I exemplen ovan skulle således släktet Canis citeras i sin helhet som " Canis Linnaeus, 1758" (zoologisk användning), medan Hibiscus , som också först etablerades av Linné men 1753, helt enkelt är " Hibiscus L." (botaniskt bruk).
Typkonceptet
Varje släkte bör ha en angiven typ , även om det i praktiken finns en eftersläpning av äldre namn utan en. Inom zoologi är detta typen art , och det generiska namnet är permanent associerat med typexemplaret av dess typart. Om exemplaret skulle visa sig kunna hänföras till ett annat släkte, blir det generiska namnet som är kopplat till det en juniorsynonym och kvarvarande taxa i det tidigare släktet måste omvärderas.
Kategorier av generiskt namn
I zoologisk användning klassificeras taxonomiska namn, inklusive de för släkten, som "tillgängliga" eller "otillgängliga". Tillgängliga namn är de som publicerats i enlighet med International Code of Zoological Nomenclature ; det tidigaste namnet för något taxon (till exempel ett släkte) ska sedan väljas som " giltigt " (dvs nuvarande eller accepterat) namn för taxonet i fråga.
Följaktligen kommer det att finnas fler tillgängliga namn än giltiga namn vid vilken tidpunkt som helst, vilka namn för närvarande används beroende på taxonomers bedömning i att antingen kombinera taxa som beskrivs under flera namn, eller dela upp taxa som kan ge tillgängliga namn som tidigare behandlats som synonymer åter i bruk. "Otillgängliga" namn inom zoologi omfattar namn som antingen inte publicerades enligt bestämmelserna i ICZN-koden, t.ex. felaktiga original eller efterföljande stavningar, namn publicerade endast i en avhandling, och generiska namn publicerade efter 1930 utan att typarter anges. Enligt avsnittet "Ordlista" i den zoologiska koden förblir undertryckta namn (enligt publicerade "Opinions" från International Commission of Zoological Nomenclature) tillgängliga men kan inte användas som giltigt namn för en taxon; dock görs de namn som publiceras i undertryckta verk otillgängliga via det relevanta yttrande som handlar om verket i fråga.
Inom botaniken finns liknande begrepp men med olika etiketter. Den botaniska motsvarigheten till zoologins "tillgängliga namn" är ett giltigt publicerat namn . Ett ogiltigt publicerat namn är en nomen invalidum eller nom. inval. ; ett avvisat namn är en nomen rejiciendum eller nom. rej. ; en senare homonym för ett giltigt publicerat namn är en nomen illegitimum eller nom. illeg. ; för en fullständig lista se den internationella nomenklaturkoden för alger, svampar och växter och det arbete som citeras ovan av Hawksworth, 2010. I stället för det "giltiga taxonet" inom zoologi är den närmaste motsvarigheten inom botanik " korrekt namn " eller "nuvarande namn" som återigen kan skilja sig åt eller förändras med alternativa taxonomiska behandlingar eller ny information som resulterar i att tidigare accepterade släkten kombineras eller delas.
prokaryot- och viruskoder i nomenklaturen som fungerar som referens för att beteckna för närvarande accepterade släktnamn i motsats till andra som antingen kan reduceras till synonymer eller, när det gäller prokaryoter, förpassas till statusen "namn utan att stå i prokaryot". nomenklatur".
Ett tillgängligt (zoologiskt) eller giltigt publicerat (botaniskt) namn som historiskt har tillämpats på ett släkte men som inte anses vara det accepterade (nuvarande/giltiga) namnet för taxonet kallas en synonym ; vissa författare inkluderar också otillgängliga namn i listor över synonymer såväl som tillgängliga namn, såsom felstavningar, namn som tidigare publicerats utan att uppfylla alla kraven i den relevanta nomenklaturkoden, och avvisade eller undertryckta namn.
Ett visst släktnamn kan ha noll till många synonymer, det senare fallet i allmänhet om släktet har varit känt under lång tid och omskrivits som nytt av en rad efterföljande arbetare, eller om en rad släkten som tidigare ansetts vara separata taxa sedan har konsoliderats till en. Till exempel World Register of Marine Species för närvarande 8 synonymer på släktnivå för kaskelotsläktet Physeter Linnaeus, 1758, och 13 för det tvåskaliga släktet Pecten OF Müller, 1776.
Identiska namn (homoonymer)
Inom samma kungarike kan ett generiskt namn endast gälla ett släkte. Men många namn har tilldelats (oftast oavsiktligt) två eller flera olika släkten. Till exempel näbbdjuret till släktet Ornithorhynchus även om George Shaw döpte det till Platypus 1799 (dessa två namn är alltså synonymer ) . Namnet Platypus hade dock redan getts till en grupp ambrosiabaggar av Johann Friedrich Wilhelm Herbst 1793. Ett namn som betyder två olika saker är en homonym . Eftersom skalbaggar och näbbdjur båda är medlemmar av kungariket Animalia kunde namnet inte användas för båda. Johann Friedrich Blumenbach publicerade ersättningsnamnet Ornithorhynchus 1800.
Ett släkte i ett rike får dock bära ett vetenskapligt namn som används som ett generiskt namn (eller namnet på en taxon i en annan rang) i ett rike som styrs av en annan nomenklaturkod. Namn med samma form men som gäller olika taxa kallas "homonymer". Även om detta avskräcks av både den internationella koden för zoologisk nomenklatur och den internationella nomenklaturkoden för alger, svampar och växter , finns det cirka fem tusen sådana namn som används i mer än ett kungarike. Till exempel,
- Anura är namnet på ordningen av grodor men är också namnet på ett icke-nuvarande släkte av växter;
- Aotus är det generiska namnet på både gyllene ärtor och nattapor ;
- Oenanthe är det generiska namnet på både wheatears och water dropworts ;
- Prunella är det generiska namnet på både accentorer och självläkande ; och
- Proboscidea är ordningen av elefanter och släktet av djävulens klor .
- Namnet på släktet Paramecia (en utdöd röd alg) är också plural av namnet på släktet Paramecium (som ingår i SAR-supergruppen), vilket också kan leda till förvirring.
En lista över generiska homonymer (med deras myndigheter), inklusive både tillgängliga (giltigt publicerade) och utvalda otillgängliga namn, har sammanställts av Interim Register of Marine and Nonmarine Genera (IRMNG).
Använd i högre klassificeringar
Typsläktet bildar basen för högre taxonomiska rangordningar, såsom familjenamnet Canidae ( " Canids") baserat på Canis . Detta går dock vanligtvis inte uppåt mer än en eller två nivåer: den ordning som hundar och vargar tillhör är Carnivora ("Köttätare").
Antal accepterade släkten
Antalet antingen accepterade eller alla publicerade släktnamn är inte känt exakt; Rees et al., 2020 uppskattar att cirka 310 000 accepterade namn (giltiga taxa) kan existera, av totalt ca. 520 000 publicerade namn (inklusive synonymer) i slutet av 2019, vilket ökade med cirka 2 500 publicerade generiska namn per år. "Officiella" register över taxonnamn i alla led, inklusive släkten, finns endast för ett fåtal grupper som virus och prokaryoter, medan det för andra finns kompendier utan "officiell" status som Index Fungorum för svampar, Index Nominum Algarum och AlgaeBase för alger, Index Nominum Genericorum och International Plant Names Index för växter i allmänhet, respektive ormbunkar genom angiospermer, och Nomenclator Zoologicus och Index to Organism Names för zoologiska namn.
Summorna för både "alla namn" och uppskattningar för "godkända namn" som finns i Interim Register of Marine and Nonmarine Genera (IRMNG) bryts ner ytterligare i publikationen av Rees et al., 2020 som citeras ovan. De accepterade namnuppskattningarna är som följer, uppdelade efter kungarike:
- Animalia : 239 093 accepterade släktnamn (± 55 350)
- Planta : 28 724 (± 7 721)
- Svampar : 10 468 (± 182)
- Chromista : 11 114 (± 1 268)
- Protozoer : 3 109 (± 1 206)
- Bakterier : 3 433 (± 115)
- Archaea : 140 (± 0)
- Virus : 851 (± 0)
De citerade osäkerhetsintervallen uppstår eftersom IRMNG listar "osäkra" namn (som inte undersöks däri) förutom kända "accepterade" namn; de angivna värdena är medelvärdet av "accepterade" namn enbart (alla "osäkra" namn behandlas som oacceptabla) och "accepterade + osäkra" namn (alla "osäkra" namn behandlas som accepterade), med tillhörande osäkerhetsintervall som indikerar dessa två ytterligheter .
Inom Animalia är den största filumen Arthropoda , med 151 697 ± 33 160 accepterade släktnamn, varav 114 387 ± 27 654 är insekter (klass Insecta). Inom Plantae utgör Tracheophyta (kärlväxter) den största beståndsdelen, med 23 236 ± 5 379 accepterade släktnamn, varav 20 845 ± 4 494 är angiospermer (överklass Angiospermae).
Som jämförelse innehåller 2018 års årliga upplaga av Catalog of Life (uppskattningsvis >90 % komplett, för befintliga arter i huvudsak) för närvarande 175 363 "godkända" släktnamn för 1 744 204 levande och 59 284 utdöda arter, inklusive endast släktnamn (inga arter) ) för vissa grupper.
Släktstorlek
Antalet arter i släkten varierar avsevärt mellan taxonomiska grupper. Till exempel, bland (icke-fågel) reptiler , som har cirka 1180 släkten, har de flesta (>300) bara 1 art, ~360 har mellan 2 och 4 arter, 260 har 5–10 arter, ~200 har 11–50 arter, och endast 27 släkten har mer än 50 arter. Vissa insektssläkten som bisläktena Lasioglossum och Andrena har dock över 1000 arter vardera. Det största blommande växtsläktet, Astragalus , innehåller över 3 000 arter.
Vilka arter som hänförs till ett släkte är något godtyckligt. Även om alla arter inom ett släkte ska vara "lika" finns det inga objektiva kriterier för att gruppera arter i släkten. Det finns mycket debatt bland zoologer om enorma, artrika släkten ska upprätthållas, eftersom det är extremt svårt att komma på identifieringsnycklar eller till och med teckenuppsättningar som särskiljer alla arter. Därför argumenterar många taxonomer för att bryta ner stora släkten. Till exempel har ödlsläktet Anolis föreslagits att delas upp i 8 eller så olika släkten, vilket skulle föra dess ~400 arter till mindre, mer hanterbara undergrupper.
Se även
externa länkar
- Interimregister över marina och icke-marina släkten (IRMNG) : inkluderar uppskattningsvis 95 % av publicerade släktnamn (godkända och oaccepterade) i alla grupper (halvkontinuerligt uppdaterad)
- Nomenclator Zoologicus Arkiverad 2021-12-23 på Wayback Machine : index över släkten och undersläktets namn (accepterade och oaccepterade) i zoologisk nomenklatur från 1758 till 2004
- Index till organismnamn : inkluderar zoologiska taxonnamn i alla led (inklusive släkten) som kontinuerligt indexeras för Zoological Record
- Index Nominum Genericorum (ING) : en sammanställning av generiska namn (accepterade och oaccepterade) publicerade för organismer som omfattas av ICN: International Code of Nomenclature for Algae, Fungi, and Plants (semi-kontinuerligt uppdaterad)
- LPSN – Lista över prokaryota namn med stående i nomenklaturen : inkluderar alla för närvarande accepterade bakterie- och Archaea-släktnamn (uppdateras kontinuerligt)
- ICTV taxonomy releases : senaste och historiska listor över accepterade virusnamn sammanställda av International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), inklusive alla för närvarande accepterade virussläktets namn (uppdateras via vanliga utgåvor)