Det fanns två tidigare San Joaquin Valley Railroads. En införlivades av Leland Stanford and Associates 1868 för att bygga en 11,3 mil (18,2 km) linje från Lathrop, Kalifornien till Stanislaus River och konsoliderades 1870 till Central Pacific Railroad . Den andra San Joaquin Valley Railroad fungerade från 1892 till 1893 mellan Fresno och Friant över 24,1 miles (38,8 km) spår och såldes vid avskärmning till södra Stilla havet.
1991 drev SJVR hela den tidigare SP-linjen från Fresno till Famoso, men en del norr om Famoso övergavs senare.
SJVR växlar med BNSF Railway i Fresno och Bakersfield och med Union Pacific vid Fresno och Goshen Junction.
SJVR ägdes ursprungligen av Kyle Railways. 1992 skapades SJVR för att erhålla och driva flera grenlinjer från södra Stilla havet. Från 1992 till 1997 ägdes SJVR av Kyle Railways. 1997 såldes SJVR:s moderbolag, Kyle Railways, till States Rail. 2002 köptes SJVR:s nya moderbolag, States Rail, av RailAmerica . Genesee & Wyoming Inc. kontrollerade RailAmerica i december 2012. Idag är SJVR fortfarande en kortlinje inom Genesee & Wyoming-familjen av järnvägar.
Spårningsrättigheter över UP från Fresno – Algoso (nära Bakersfield) via Goshen Jct. (tidigare SP)
Historia
West Side Line
Denna huvudlinje var tidigare känd som Southern Pacifics "West Side Line" och sträckte sig en gång från Tracy, Kalifornien och sedan söderut genom den västra sidan av San Joaquin Valley (I-5-korridoren) via Patterson, Gustine, Newman, Los Banos , Oxalis och sedan österut till Fresno via Ingle och Kerman. California Northern Railroad driver nu den norra delen av linjen från Tracy - Los Banos. SJVR driver den södra delen av linjen från Oxalis till Fresno och ägdes vid ett tillfälle av Port Railroads, Inc. (PRI; även ett Kyle-dotterbolag) och drevs av SJVR. Den 24 april 1996 slogs PRI samman till SJVR. Både PRI och SJVR var redan Kyle Railway-dotterbolag. Banavsnittet mellan Los Banos och Oxalis övergavs av södra Stilla havet 1993 och spåren togs bort strax efter.
Southern Pacific konstruerade banan från Tracy till Newman (37 miles) och från Los Banos till Armona (nära Fresno) 1891. Southern Pacifics passagerartåg Owl (#57/58) körde över denna linje mellan San Francisco och Los Angeles till 1965.
Exeter underavdelning
2008 godkände Surface Transportation Board övergivandet av spåravsnittet mellan Strathmore och Jovista . Detta lämnade gemenskaperna Strathmore, Porterville , Terra Bella , Ducor och Richgrove utan någon järnvägstjänst. Tulare County har nyligen avbrutit förhandlingarna med SJVR om att köpa denna del av banan för att bevara den för framtida användning och eventuell återaktivering. Men med början i september 2010 togs spåren bort av SJVR och jobbet slutfördes med hela linjen som drogs upp i mitten av november. Framtiden för denna linje är mycket tveksam och med rälsen som nu har tagits bort är det extremt osannolikt att tåg någonsin kommer att korrida den korridoren igen. Från och med mars 2015 har SJVR förbjudit linjen med rälsen spetsade i södra änden av Exeter med några korsningssignaler söderut som redan delvis har demonterats. Denna spårsektion, som går cirka 8 miles till Lindsay, väntar nu på att formellt överges varpå rälsen förväntas dras upp omedelbart efter STB-godkännande. Sektionerna från Exeter till Dinuba tillsammans med tidigare ATSF-bana mellan Lindsay och Exeter förväntades följa med tanke på deras dåliga skick och bristande användning, men i april 2022 har det ännu inte hänt.
Trafik
Järnvägens huvudsakliga trafikkällor är petroleumgas och jordbruksprodukter. Under 2008 drog SJVR omkring 39 000 billass.
Edward A. Lewis, American Shortline Railway Guide 5:e upplagan. (Kalmbach Publishing, 1996)
Mike Walker, SPV's Comprehensive Railroad Atlas of North America - California/Nevada Post Merger Edition, (Steam Powered Publishing & SPV, 1997) Ägarskap och detaljer om järnvägslinjer.