SMC3
| SMC3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , BAM, BMH, CDLS3, CSPG6, HCAP, SMC3L1, strukturellt underhåll av kromosomer 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| externa ID:n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strukturellt underhåll av kromosomerna protein 3 (SMC3) är ett protein som hos människor kodas av SMC3 -genen . SMC3 är en subenhet av Cohesin -komplexet som förmedlar systerkromatidkohesion , homolog rekombination och DNA-looping . Kohesin bildas av SMC3, SMC1 , RAD21 och antingen SA1 eller SA2 . Hos människor finns SMC3 i alla kohesinkomplex medan det finns flera paraloger för de andra subenheterna.
SMC3 är en medlem av SMC-proteinfamiljen . Medlemmar av denna familj är nyckelregulatorer för DNA-reparation, kromosomkondensering och kromosomsegregering.
Struktur och interaktioner
_and_SMC1_(green)_(PDB_2WD5)_from_mice_(Kurze_et_al._2009).png)
-RAD21_(green)_interface_(PDB_4UX3).png)
Domänorganisationen för SMC-proteiner är evolutionärt bevarad och består av ett N-terminalt Walker A-motiv , coiled-coil, "gångjärn", coiled-coil och ett C-terminalt Walker B-motiv . Proteinet viks tillbaka på sig självt för att bilda en stavformad molekyl med en heterodimeriserings-"gångjärn"-domän i ena änden och ett " av ABC-typ ATPas i den andra. Dessa globulära domäner är åtskilda av en ~50 nm anti-parallell spiral. SMC3 och SMC1 binder via sina gångjärnsdomäner och skapar V-formade heterodimerer. Den N-terminala domänen av RAD21 binder till den lindade spolen av SMC3 precis ovanför huvuddomänen medan den C-terminala domänen av RAD21 binder huvuddomänen av SMC1. Denna bindning från ände till ände av SMC3-SMC1-RAD21-trimeren skapar en sluten ring inom vilken DNA kan fångas. SA1 eller
När DNA replikeras och systerkromatidkohesion är etablerad acetyleras SMC3 på ett par mycket konserverade lysiner av ESCO1 och ESCO2 . I spirande jäst är denna modifiering tillräcklig för att stabilisera kohesin på DNA till mitos, men hos djur krävs även bindning av sororin.
Under meios bildar SMC3 kohesinkomplex med SMC1ß , STAG3 och REC8 som genererar kohesion mellan homologa kromosomer och systerkromatider.
Cornelia de Langes syndrom
Cornelia de Langes syndrom (CdLS) är en sällsynt genetisk sjukdom som uppvisar varierande kliniska abnormiteter inklusive dysmorfa egenskaper , allvarlig tillväxthämning, global utvecklingsförsening och intellektuell funktionsnedsättning . SMC3 är en av fem gener som har varit inblandade i CdLS. I en fallrapport upptäcktes en ny SMC3-genduplicering hos ett barn med bristande trivsel , hypotoni och ansiktsdysmorfa egenskaper hos CdLS. Samma dubbelarbete observerades även hos modern, som hade mildare dysmorfa ansiktsuttryck.
Musmodell
| Karakteristisk | Fenotyp |
|---|---|
| Homozygot viabilitet | Onormal |
| Recessiv dödlig studie | Onormal |
| Homozygot fertilitet | Onormal |
| Kroppsvikt | Onormal |
| Ångest | Vanligt |
| Neurologisk bedömning | Vanligt |
| Greppstyrka | Vanligt |
| Varm tallrik | Vanligt |
| Dysmorfologi | Onormal |
| Indirekt kalorimetri | Vanligt |
| Glukostoleranstest | Vanligt |
| Auditiv hjärnstammsrespons | Vanligt |
| DEXA | Onormal |
| Radiografi | Vanligt |
| Kroppstemperatur | Vanligt |
| Ögonmorfologi | Vanligt |
| Klinisk kemi | Vanligt |
| Hematologi | Vanligt |
| Perifera blodlymfocyter | Vanligt |
| Hjärtvikt | Vanligt |
| Ögonhistopatologi | Vanligt |
| Salmonellainfektion _ | Vanligt |
| Citrobacter infektion | Vanligt |
| Alla tester och analyser från |
Modellorganismer har använts i studien av SMC3-funktion. En villkorlig knockout-muslinje , kallad Smc3 tm1a(EUCOMM)Wtsi genererades som en del av programmet International Knockout Mouse Consortium - ett högkapacitetsmutagenesprojekt för att generera och distribuera djurmodeller av sjukdomar till intresserade forskare.
Han- och hondjur genomgick en standardiserad fenotypisk screening för att bestämma effekterna av deletion. Tjugotvå tester utfördes på mutantmöss och sex signifikanta abnormiteter observerades. Inga homozygota mutanta embryon identifierades under dräktigheten, och därför överlevde inga förrän avvänjningen . De återstående testerna utfördes på heterozygota muterade vuxna möss. Honor hade en högre incidens än normalt av dödsfall före avvänjning hos sina avkommor och hade också en minskad kroppsvikt. Manliga heterozygoter visade en förkortad, uppåtvänd nos .
Roll i Basement Membrane
SMC3 förekommer i vissa celltyper som ett utsöndrat protein och posttranslationell addition av kondroitinsulfatkedjor ger upphov till den utsöndrade proteoglykanen bamacan , ett rikligt basalmembranprotein .