SMC5

Strukturellt underhåll av kromosomerna protein 5 är ett protein som kodas av SMC5 -genen hos människa.

Det strukturella underhållet av kromosomernas komplexa underliggande mekanismer som är involverade i kromatindynamikens dynamik är okänd, och nya upptäckter kastar ljus över de olika funktionerna. SMC - komplexet förmedlar långdistansinteraktioner som möjliggör högre ordningsveckning av kromatin i interfas. SMC-komplexet har en ATPas- aktivitet, ett konserverat kleisin, såväl som regulatoriska subenheter. SMC-proteinkomplex är involverade i DNA-reparation, transkriptionsvägar, reglering av kromosomsegregering och immunitet i Arabidopsis . I eukaryoter består de strukturella underhållskromosomerna av kohesin (SMC1 OCH SMC3), kondensin (SMC2 och SMC4) och SMC5/6-komplex.

Strukturera

Smc5/6-komplexet upptäcktes i fissionsjäst. RAD18 (SMC6), DNA-skadegenen i fissionsjäst, kodar också för ett SMC-liknande protein och bildar ett heterodimert komplex med Spr18 (SMC5) protein. I jäst har SMC5/6-komplexet subenheter som består av SMC5, SMC6 och sex icke-strukturellt underhåll av kromosomproteiner (NSE). Nsel-Nse3-Nse4-subenheter överbryggar Smc5-huvudet Smc6 och tillåter bindning av DNA.

SMC5-
identifierare
	, SMC5L1, strukturellt underhåll av kromosomer 5
externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Det är involverat i den alternativa förlängningen av telomerers cancermekanism.

Roll i rekombination och meios

Smc5- och Smc6 -proteiner bildar en heterodimer ringliknande struktur och bildar tillsammans med andra icke-SMC-element SMC-5/6-komplexet. Hos masken Caenorhabditis elegans interagerar detta komplex med HIM-6(BLM) helikas för att främja meiotisk rekombination mellan bearbetning och kromosommognad . SMC-5/6-komplexet i musoocyter är väsentligt för bildandet av segregationskompetenta bivalenter under meios . Hos människor är ett kromosombrottssyndrom kännetecknat av allvarlig lungsjukdom i tidig barndom associerat med en mutation i en komponent av SMC-5/6-komplexet. Patientens celler visar kromosomomarrangemang , mikrokärnor , känslighet för DNA-skada och defekt homolog rekombination .

Vidare läsning

•    Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (juni 2002). "Konstruktion av expressionsfärdiga cDNA-kloner för KIAA-gener: manuell kuration av 330 KIAA cDNA-kloner". DNA-forskning . 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923 . doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954 .
•    Taylor EM, Moghraby JS, Lees JH, Smit B, Moens PB, Lehmann AR (juni 2001). "Karakterisering av en ny human SMC-heterodimer homolog med Schizosaccharomyces pombe Rad18/Spr18-komplexet" . Cellens molekylärbiologi . 12 (6): 1583–94. doi : 10.1091/mbc.12.6.1583 . PMC 37326 . PMID 11408570 .
•    Potts PR, Yu H (augusti 2005). "Human MMS21/NSE2 är ett SUMO-ligas som krävs för DNA-reparation" . Molekylär och cellulär biologi . 25 (16): 7021–32. doi : 10.1128/MCB.25.16.7021-7032.2005 . PMC 1190242 . PMID 16055714 .
•    Potts PR, Porteus MH, Yu H (juli 2006). "Humant SMC5/6-komplex främjar homolog systerkromatid-rekombination genom att rekrytera SMC1/3-kohesinkomplexet till dubbelsträngsbrytningar" . EMBO Journal . 25 (14): 3377–88. doi : 10.1038/sj.emboj.7601218 . PMC 1523187 . PMID 16810316 .