Glykosidhydrolasfamiljen 36
| Melibias | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 kristallstruktur av ris alfa-galaktosidas
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| Symbol | Melibias | ||||||||
| Pfam | PF02065 | ||||||||
| Pfam klan | CL0058 | ||||||||
| InterPro | IPR000111 | ||||||||
| SCOP2 | 1ktc / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| CAZy | GH36 | ||||||||
| |||||||||
| Raffinose_syn | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | Raffinose_syn | ||||||||
| Pfam | PF05691 | ||||||||
| Pfam klan | CL0058 | ||||||||
| InterPro | IPR008811 | ||||||||
| CAZy | GH36 | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologi är glykosidhydrolasfamiljen 36 en familj av glykosidhydrolaser .
Glykosidhydrolaser EC 3.2.1. är en utbredd grupp av enzymer som hydrolyserar glykosidbindningen mellan två eller flera kolhydrater, eller mellan en kolhydrat och en icke-kolhydratdel . Ett klassificeringssystem för glykosidhydrolaser, baserat på sekvenslikhet, har lett till definitionen av >100 olika familjer. Denna klassificering är tillgänglig på CAZy -webbplatsen och diskuteras även på CAZypedia, ett onlineuppslagsverk över kolhydrataktiva enzymer.
Glykosidhydrolasfamiljen 36 tillsammans med familjen 31 och familjen 27 alfa-galaktosidaser bildar glykosylhydrolasklanen GH-D, en superfamilj av alfa-galaktosidaser, alfa-N-acetylgalaktosaminidaser och isomaltodextranaser som sannolikt delar en gemensam katalytisk mekanism och strukturell mekanism. .
Alfa-galaktosidas ( EC 3.2.1.22 ) (melibias) katalyserar hydrolysen av melibios till galaktos och glukos . Hos människan är bristen på detta enzym orsaken till Fabrys sjukdom (X-länkad sfingolipidos). Alfa-galaktosidas finns i en mängd olika organismer. Det finns en avsevärd grad av likhet i sekvensen av alfa-galaktosidas från olika eukaryota arter. Escherichia coli alfa-galaktosidas (gen melA), som kräver NAD och magnesium som kofaktorer, är inte strukturellt relaterat till de eukaryota enzymerna; däremot innehåller en Escherichia coli- plasmid kodad för alfa-galaktosidas (gen rafA) en region på cirka 50 aminosyror som liknar en domän av de eukaryota alfa-galaktosidaserna. Alfa-N-acetylgalaktosaminidas ( EC 3.2.1.49 ) katalyserar hydrolysen av terminala icke-reducerande N-acetyl-D-galaktosaminrester i N-acetyl-alfa-D-galaktosaminider. Hos människan är bristen på detta enzym orsaken till Schindler- och Kanzakis sjukdomar . Sekvensen för detta enzym är starkt relaterad till den för de eukaryota alfa-galaktosidaserna.
Denna familj inkluderar också raffinossyntasproteiner , även kända som fröhämmande (Sip1) proteiner . Raffinos (O-alfa-D-galaktopyranosyl-(1-->6)-O- alfa -D-glukopyranosyl-(1<-->2)-O-beta-D-fruktofuranosid) är en utbredd oligosackarid i växtfrön och andra vävnader . Raffinossyntas EC 2.4.1.82 är nyckelenzymet som kanaliserar sackaros in i raffinosoligosackaridvägen .
Glykosidhydrolasfamiljen 36 inkluderar också enzymer med α-N-acetylgalaktosaminidas EC 3.2.1.49 och stachyossyntas EC 2.4.1.67 aktiviteter.
Glykosidhydrolasfamiljen 36 kan delas in i 11 familjer, GH36A till GH36K.
