dUTP difosfatas
| dUTP | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| difosfatasidentifierare | |||||||||
| EG nr. | 3.6.1.23 | ||||||||
| CAS-nr. | 37289-34-2 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| dUTPase | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 kristallstrukturer av felint immunbristvirus dutp pyrofosfatas och dess nukleotidkomplex i tre kristallformer.
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | dUTPase | ||||||||
| Pfam | PF00692 | ||||||||
| Pfam klan | CL0153 | ||||||||
| InterPro | IPR008180 | ||||||||
| SCOP2 | 1dup / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| dUTPase_2 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 kristallstrukturen av ett komplex av campylobacter jejuni dutpase med substratanaloga dupnhp-
| |||||||||
| identifierare | |||||||||
| Symbol | dUTPase_2 | ||||||||
| Pfam | PF08761 | ||||||||
| Pfam klan | CL0231 | ||||||||
| InterPro | IPR014871 | ||||||||
| SCOP2 | 1w2y / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Inom enzymologi är ett dUTP difosfatas ( EC 3.6.1.23 ) ett enzym som katalyserar den kemiska reaktionen
- dUTP + H 2 O dUMP + difosfat
H2O , medan de två substraten för detta enzym dUTP och dess två produkter är dUMP och difosfat .
Detta enzym tillhör familjen hydrolaser , speciellt de som verkar på syraanhydrider i fosforhaltiga anhydrider. Det systematiska namnet på denna enzymklass är dUTP-nukleotidohydrolas . Andra namn i vanlig användning inkluderar deoxiuridin-trifosfatas , dUTPas , dUTP-pyrofosfatas , desoxiuridin-5'-trifosfatnukleotidohydrolas och desoxiuridin-5'-trifosfatas . Detta enzym deltar i pyrimidinmetabolismen .
Detta enzym har en dubbel funktion: å ena sidan tar det bort dUTP från deoxinukleotidpoolen, vilket minskar sannolikheten för att denna bas inkorporeras i DNA av DNA-polymeraser , medan det å andra sidan producerar dTTP-prekursorn dUMP. Brist på eller hämning av dUTPas-verkan leder till skadliga störningar i nukleotidpoolen, vilket resulterar i ökat uracilinnehåll i DNA som aktiverar en hyperaktiv meningslös cykel av DNA-reparation.
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 48 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB - accessionskoderna 1DUC , 1DUD , 1DUN , 1DUP , 1DUT , 1EU5 , 1EUW , 1F7D , 1F7K , 1F7P , 1F7N , 1F7N , 1F7N , 1F7N , 1F7N , 7R , 1MQ7 , 1OGH , 1OGK , 1OGL , 1PKH , 1PKJ , 1PKK , 1RN8 , 1RNJ , 1SEH , 1SIX , 1SJN , 1SLH , 1SM8 , 1SMC , 1SNF , 1WY2 SY , 1VY2 SY , 2CJE , 2D4L , 2D4M , 2D4N , 2HQU , _ _ _ _ 2HR6 , 2HRM , 2OKB , 2OKD , 2OKE , 2OL0 , 2OL1 och 2PY4 .
Det finns minst två strukturellt distinkta familjer av dUTPaser. Kristallstrukturen av humant dUTPase avslöjar att varje subenhet av dUTPase- trimeren viks till en åttasträngad jelly-roll beta-fat, med de C-terminala beta -strängarna utbytta mellan subenheterna . Strukturen liknar den för Escherichia coli -enzymet , trots låg sekvenshomologi mellan de två enzymerna .
Den andra familjen har en ny all-alfa- veckning , medlemmar av denna familj är inte släkt med all-beta- vecket som finns i dUTPases av majoriteten av organismer .
Se även
- DUT , genen som kodar för detta enzym hos människor
- DnaS eller dut , genen som kodar för detta enzym i E. coli
Vidare läsning
- Bertani Le.; Haeggmark A.; Reichard P.; Interkonvertering av deoxiuridinfosfater (1963). "Enzymatisk syntes av deoxiribonukleotider. II. Bildning" . J. Biol. Chem . 238 (10): 3407–13. doi : 10.1016/S0021-9258(18)48681-4 . PMID 14085395 .
- Giroir LE, Deutsch WA (1987). "Drosophila deoxiuridintrifosfatas. Rening och karakterisering" . J. Biol. Chem . 262 (1): 130–4. doi : 10.1016/S0021-9258(19)75898-0 . PMID 3025197 .
- Greenberg G, Somerville R (1962). "Deoxiuridylatkinasaktivitet och deoxiuridintrifosfatas i Escherichia coli" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 48 (2): 247–57. Bibcode : 1962PNAS...48..247G . doi : 10.1073/pnas.48.2.247 . PMC 220766 . PMID 13901467 .
- Grindey GR, Nichol CA (1971). "Däggdjursdeoxiuridin 5'-trifosfatpyrofosfatas". Biochim. Biophys. Acta . 240 (2): 180–3. doi : 10.1016/0005-2787(71)90655-1 . PMID 5105331 .
