Den kubanska regeringen försökte först rekrytera japanska arbetare till sockerplantager på 1880-talet, men den japanska regeringen vägrade ge sitt godkännande på grund av de fruktansvärda arbetsförhållandena för kinesiska arbetare på Kuba. Därefter var den första registrerade japanen att bosätta sig på Kuba 1903. Den första större gruppen av ankomster kom från Mexiko mellan 1910 och 1916, vilket skulle sätta ett mönster för senare decennier, som flydde från våld under den mexikanska revolutionen .
De etablerade ett jordbrukssällskap i Carmelina. Senare 1916 anlände 262 japaner. De flesta bestämde sig för att få jobb genom att skörda sockerrör. Men förhållandena var mycket svåra för japanerna och några återvände till Japan. Några tog sig till Isle of Youth, där några familjer etablerade frukt- och grönsaksodlingar. 1926 avtog invandringen till Kuba.
Den 9 december 1941, efter att Japan attackerade Pearl Harbor , förklarade president Batista krig mot Japan, tillsammans med dess fascistiska allierade. Några dagar senare, den 12 december, förklarades alla japanska ättlingar som bodde på Kuba "fientliga utlänningar". De flesta japanska kubaner greps. Från och med 1943 hade totalt cirka 1 200 japaner immigrerat till Kuba, inklusive cirka 200 okinawaner. Senare deporterades japanska härkomster till USA . Några fick nya jobb när de kom. Några arbetade som kockar, tjänare och andra former av stöd. Fångarna släpptes inte när kriget tog slut. Den sista gruppen släpptes i mars 1946; över sex månader efter att Japan kapitulerat. Efter andra världskriget lämnade några till Japan. Vänskap mellan de två länderna gav kvinnor möjlighet att bygga en ny gemenskap. Under revolutionen 1959 och den kubanska revolutionen lämnade mer nikkei till Japan.
Samtida situation
År 2008 tilldelade den japanska regeringen den uppgående solens orden med guld- och silverstrålar till Francisco Shinichi Miyasaka Machida som ett erkännande för hans bidrag till välfärden för ättlingar till japanska emigranter på Kuba.
Under 2019 bodde det uppskattningsvis 1 200 japanska ättlingar på Kuba.
Kuba ämnen 
Japanska diasporan och japanska utlänningar